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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_017990
当前查询版本OH1004
位置Chr04:4704087-4705316 (-)
描述Similar to ATL43: RING-H2 finger protein ATL43 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_017990 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g05810 RING-H2 指蛋白 ATL43。 暂无已核实直接文献
At2g20030 推测的RING-H2指蛋白ATL12。 暂无已核实直接文献
At4g28890 E3 泛素蛋白连接酶,能够与泛素结合酶 E2 UBC8 在体外催化多泛素化反应。 暂无已核实直接文献
At4g40070 RING-H2指蛋白ATL32。 暂无已核实直接文献
At3g05200 E3 泛素蛋白连接酶,能够与泛素结合酶 E2 UBC8 在体外催化多泛素化反应。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.413; 覆盖度=92.421; E 值=5.6e-91; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042742defense response to bacterium生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.317; 覆盖度=40.098; E 值=1.28e-25; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0098542defense response to other organism生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.317; 覆盖度=40.098; E 值=1.28e-25; UniProt GO evidence=IEP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005576extracellular region细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.317; 覆盖度=40.098; E 值=1.28e-25; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.413; 覆盖度=92.421; E 值=5.6e-91; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.317; 覆盖度=40.098; E 值=1.28e-25; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016020membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.413; 覆盖度=92.421; E 值=5.6e-91; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004842ubiquitin-protein transferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.259; 覆盖度=79.218; E 值=6.03e-44; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.413; 覆盖度=92.421; E 值=5.6e-91; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.413; 覆盖度=92.421; E 值=5.6e-91; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G20030KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.53; 覆盖度=88.509; E 值=1.81e-48UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G05200KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.317; 覆盖度=40.098; E 值=1.28e-25UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G28890KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.259; 覆盖度=79.218; E 值=6.03e-44UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G40070KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.146; 覆盖度=33.496; E 值=5.5e-28UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G05810KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.413; 覆盖度=92.421; E 值=5.6e-91UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release