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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_015213
当前查询版本OH1004
位置Chr03:66063253-66066202 (+)
描述Similar to PUB15: U-box domain-containing protein 15 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015213 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g42340 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At3g46510 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At2g28830 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At3g54850 与特定的 E2 泛素结合酶一起发挥 E3 泛素连接酶的作用。
Structure and biochemical function of a prototypical Arabidopsis U-box domain.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m405057200

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0102700 在体外具有 E3 泛素蛋白连接酶。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0007166cell surface receptor signaling pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.941; 覆盖度=96.53; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.941; 覆盖度=96.53; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042742defense response to bacterium生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.498; 覆盖度=101.262; E 值=8.95e-154; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0050777negative regulation of immune response生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.498; 覆盖度=101.262; E 值=8.95e-154; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:2000028regulation of photoperiodism, flowering生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.498; 覆盖度=101.262; E 值=8.95e-154; UniProt GO evidence=IMP:CACAOUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.941; 覆盖度=96.53; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.941; 覆盖度=96.53; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005829cytosol细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.498; 覆盖度=101.262; E 值=8.95e-154; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004842ubiquitin-protein transferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.498; 覆盖度=101.262; E 值=8.95e-154; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.941; 覆盖度=96.53; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0070696transmembrane receptor protein serine/threonine kinase binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.498; 覆盖度=101.262; E 值=8.95e-154; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G28830KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.266; 覆盖度=94.795; E 值=3.69e-138UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G46510KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.498; 覆盖度=101.262; E 值=8.95e-154UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G54850KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.379; 覆盖度=97.476; E 值=1.98e-136UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G42340KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.941; 覆盖度=96.53; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os06g0102700KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.752; 覆盖度=96.057; E 值=1.77e-135UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release