基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_011776 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:32875-38619 (-) |
| 描述 | Similar to spoT: Probable guanosine-3'%2C5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase (Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX%3D1111708) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_011776 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g54130 |
在体外具有鸟苷3′-二磷酸5′-二磷酸(ppGpp)合酶活性,并能在功能上互补大肠杆菌relA突变体。 | |
At3g14050 |
在体外具有鸟苷3′-二磷酸5′-二磷酸(ppGpp)合酶活性,并能在功能上互补大肠杆菌relA突变体。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0457600 |
可能的ppGpp(鸟苷酸3'-二磷酸5'-二磷酸)合成酶,可能参与植物对病原体和其他胁迫的快速ppGpp介导反应。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010150 | leaf senescence | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015949 | nucleobase-containing small molecule interconversion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.637; 覆盖度=50.525; E 值=4.68e-47; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015969 | guanosine tetraphosphate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.03; 覆盖度=51.225; E 值=4.1e-46; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015970 | guanosine tetraphosphate biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.043; 覆盖度=53.676; E 值=4.24e-58; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015979 | photosynthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.637; 覆盖度=50.525; E 值=4.68e-47; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005525 | GTP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008728 | GTP diphosphokinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008893 | guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.043; 覆盖度=53.676; E 值=4.24e-58; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016301 | kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G54130 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bbu:BB_0198 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.637; 覆盖度=50.525; E 值=4.68e-47 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0457600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.03; 覆盖度=51.225; E 值=4.1e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:slr1325 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.043; 覆盖度=53.676; E 值=4.24e-58 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |