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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_011776
当前查询版本OH1004
位置Chr03:32875-38619 (-)
描述Similar to spoT: Probable guanosine-3'%2C5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase (Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX%3D1111708)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_011776 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g54130 在体外具有鸟苷3′-二磷酸5′-二磷酸(ppGpp)合酶活性,并能在功能上互补大肠杆菌relA突变体。
At3g14050 在体外具有鸟苷3′-二磷酸5′-二磷酸(ppGpp)合酶活性,并能在功能上互补大肠杆菌relA突变体。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0457600 可能的ppGpp(鸟苷酸3'-二磷酸5'-二磷酸)合成酶,可能参与植物对病原体和其他胁迫的快速ppGpp介导反应。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0010150leaf senescence生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0015949nucleobase-containing small molecule interconversion生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.637; 覆盖度=50.525; E 值=4.68e-47; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0015969guanosine tetraphosphate metabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.03; 覆盖度=51.225; E 值=4.1e-46; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0015970guanosine tetraphosphate biosynthetic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.043; 覆盖度=53.676; E 值=4.24e-58; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0015979photosynthesis生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.637; 覆盖度=50.525; E 值=4.68e-47; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafterUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005524ATP binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005525GTP binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008728GTP diphosphokinase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008893guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.043; 覆盖度=53.676; E 值=4.24e-58; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016301kinase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G54130KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.727; 覆盖度=51.342; E 值=2.13e-46UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGbbu:BB_0198KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.637; 覆盖度=50.525; E 值=4.68e-47UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os08g0457600KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.03; 覆盖度=51.225; E 值=4.1e-46UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGsyn:slr1325KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.043; 覆盖度=53.676; E 值=4.24e-58UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release