基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_007077 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:35323331-35324543 (+) |
| 描述 | Similar to CRS2: Chloroplastic group IIB intron splicing facilitator CRS2%2C chloroplastic (Zea mays OX%3D4577) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_007077 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g16140 |
叶绿体中IIB类内含子剪接所必需。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g38290 |
叶绿体中IIB类内含子剪接所必需。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g19830 |
该酶的天然底物可能是蛋白质合成过程中从核糖体上脱落的肽酰-tRNA。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0132800 |
叶绿体中IIB类内含子剪接所必需。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.528; 覆盖度=86.531; E 值=7.4e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008380 | RNA splicing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.528; 覆盖度=86.531; E 值=7.4e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.391; 覆盖度=80.408; E 值=3.06e-80; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.067; 覆盖度=97.143; E 值=2.73e-115; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.528; 覆盖度=86.531; E 值=7.4e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.528; 覆盖度=86.531; E 值=7.4e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000049 | tRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.528; 覆盖度=86.531; E 值=7.4e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004045 | peptidyl-tRNA hydrolase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.528; 覆盖度=86.531; E 值=7.4e-116; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G16140 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.067; 覆盖度=97.143; E 值=2.73e-115 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G19830 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.391; 覆盖度=80.408; E 值=3.06e-80 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G38290 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=67.073; 覆盖度=100.408; E 值=3.44e-115 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0132800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=71.963; 覆盖度=87.347; E 值=4.3e-113 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |