基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_004461 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:136734851-136738821 (-) |
| 描述 | Similar to ARF4: Auxin response factor 4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_004461 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 16 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g60450 |
生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g33860 |
生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os05g0563400 |
生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0670800 |
生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0753500 |
生长素反应因子 (ARF) 是与生长素反应启动子元件 (AuxRE) 中发现的 DNA 序列 5'-TGTCTC-3' 特异性结合的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.418; 覆盖度=96.684; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.418; 覆盖度=96.684; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.732; 覆盖度=54.377; E 值=1.32e-136; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009734 | auxin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.418; 覆盖度=96.684; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009850 | auxin metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.732; 覆盖度=54.377; E 值=1.32e-136; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010050 | vegetative phase change | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.418; 覆盖度=96.684; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010158 | abaxial cell fate specification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.418; 覆盖度=96.684; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010582 | floral meristem determinacy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.732; 覆盖度=54.377; E 值=1.32e-136; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1902584 | positive regulation of response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.732; 覆盖度=54.377; E 值=1.32e-136; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.418; 覆盖度=96.684; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.418; 覆盖度=96.684; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.732; 覆盖度=54.377; E 值=1.32e-136; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.418; 覆盖度=96.684; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031490 | chromatin DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.732; 覆盖度=54.377; E 值=1.32e-136; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0036094 | small molecule binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.732; 覆盖度=54.377; E 值=1.32e-136; UniProt GO evidence=IMP:DisProt | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0140677 | molecular function activator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.732; 覆盖度=54.377; E 值=1.32e-136; UniProt GO evidence=IPI:DisProt | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G33860 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.732; 覆盖度=54.377; E 值=1.32e-136 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G60450 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.418; 覆盖度=96.684; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0670800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.708; 覆盖度=64.456; E 值=2.98e-131 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0753500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.559; 覆盖度=64.589; E 值=9.27e-122 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0563400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.656; 覆盖度=67.905; E 值=4.47e-135 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |