基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_004409 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:134825561-134826658 (+) |
| 描述 | Similar to DRT100: DNA damage-repair/toleration protein DRT100 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_004409 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g12610 |
该蛋白能够补偿细菌 recA 突变,但其在植物中的本体功能尚不清楚。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g05660 |
类受体蛋白33。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g12145 |
在长日照 (LD) 条件下促进开花过渡。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0203800 |
参与调节耐热性的受体激酶。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0001558 | regulation of cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.398; 覆盖度=92.877; E 值=2.71e-46; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006281 | DNA repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.357; 覆盖度=93.699; E 值=1.88e-147; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.357; 覆盖度=93.699; E 值=1.88e-147; UniProt GO evidence=IC:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010286 | heat acclimation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.398; 覆盖度=92.877; E 值=2.71e-46; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.357; 覆盖度=93.699; E 值=1.88e-147; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.357; 覆盖度=93.699; E 值=1.88e-147; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.398; 覆盖度=92.877; E 值=2.71e-46; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000166 | nucleotide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.357; 覆盖度=93.699; E 值=1.88e-147; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004674 | protein serine/threonine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.398; 覆盖度=92.877; E 值=2.71e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.398; 覆盖度=92.877; E 值=2.71e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0033612 | receptor serine/threonine kinase binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.398; 覆盖度=92.877; E 值=2.71e-46; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106310 | protein serine kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.398; 覆盖度=92.877; E 值=2.71e-46; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G12610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.357; 覆盖度=93.699; E 值=1.88e-147 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0203800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.398; 覆盖度=92.877; E 值=2.71e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4340427 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.398; 覆盖度=92.877; E 值=2.71e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |