基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_002053 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:40992167-40993550 (+) |
| 描述 | Similar to LE: Gibberellin 3-beta-dioxygenase 1 (Pisum sativum OX%3D3888) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002053 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g15550 |
将无活性的赤霉素 前体 GA9 和 GA20 分别转化为生物活性赤霉素 GA4 和 GA1。 | |
At1g80340 |
将无活性的赤霉素 前体 GA9 和 GA20 转化为生物活性赤霉素 GA4 和 GA1。 | |
At1g80330 |
将无活性的赤霉素 前体 GA9 和 GA20 转化为生物活性赤霉素 GA4 和 GA1。 | |
At4g21690 |
将无活性的赤霉素 前体 GA9 和 GA20 转化为生物活性赤霉素 GA4 和 GA1。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009416 | response to light stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.514; 覆盖度=94.278; E 值=5.73e-143; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009639 | response to red or far red light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.514; 覆盖度=94.278; E 值=5.73e-143; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009686 | gibberellin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.171; 覆盖度=101.907; E 值=9.35e-175; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009739 | response to gibberellin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.514; 覆盖度=94.278; E 值=5.73e-143; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009740 | gibberellic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.514; 覆盖度=94.278; E 值=5.73e-143; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009845 | seed germination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.268; 覆盖度=93.46; E 值=1.14e-133; UniProt GO evidence=IEP:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010114 | response to red light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.514; 覆盖度=94.278; E 值=5.73e-143; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.514; 覆盖度=94.278; E 值=5.73e-143; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.268; 覆盖度=93.46; E 值=1.14e-133; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016707 | gibberellin 3-beta-dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.171; 覆盖度=101.907; E 值=9.35e-175; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.171; 覆盖度=101.907; E 值=9.35e-175; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G15550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.514; 覆盖度=94.278; E 值=5.73e-143 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G80330 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=52.047; 覆盖度=93.188; E 值=8.1e-122 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G80340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.268; 覆盖度=93.46; E 值=1.14e-133 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G21690 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.851; 覆盖度=95.095; E 值=6.15e-112 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |