基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030602 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:119440794-119441682 (-) |
| 描述 | Similar to SRP14: Signal recognition particle 14 kDa protein (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030602 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g43640 |
信号识别颗粒(SRP)复合物的组成部分,这是一种介导分泌蛋白和膜蛋白共翻译靶向内质网(ER)的核糖核蛋白复合物(通过相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0623700 |
信号识别颗粒(SRP)复合物的组成部分,这是一种介导分泌蛋白和膜蛋白共翻译靶向内质网(ER)的核糖核蛋白复合物(通过相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006613 | cotranslational protein targeting to membrane | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.545; 覆盖度=84.167; E 值=5.76e-21; UniProt GO evidence=TAS:ProtInc | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006614 | SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.298; 覆盖度=95.0; E 值=4.49e-47; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006617 | SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.545; 覆盖度=84.167; E 值=5.76e-21; UniProt GO evidence=NAS:ComplexPortal | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045047 | protein targeting to ER | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.298; 覆盖度=95.0; E 值=4.49e-47; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.545; 覆盖度=84.167; E 值=5.76e-21; UniProt GO evidence=TAS:Reactome | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.545; 覆盖度=84.167; E 值=5.76e-21; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.298; 覆盖度=95.0; E 值=4.49e-47; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005786 | signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.298; 覆盖度=95.0; E 值=4.49e-47; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.298; 覆盖度=95.0; E 值=4.49e-47; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034774 | secretory granule lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.545; 覆盖度=84.167; E 值=5.76e-21; UniProt GO evidence=TAS:Reactome | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.545; 覆盖度=84.167; E 值=5.76e-21; UniProt GO evidence=HDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008312 | 7S RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.298; 覆盖度=95.0; E 值=4.49e-47; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030942 | endoplasmic reticulum signal peptide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.298; 覆盖度=95.0; E 值=4.49e-47; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G43640 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.298; 覆盖度=95.0; E 值=4.49e-47 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0623700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.385; 覆盖度=90.833; E 值=1.41e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:6727 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.545; 覆盖度=84.167; E 值=5.76e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mcf:101864926 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.078; 覆盖度=85.0; E 值=1.71e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pon:100172315 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.545; 覆盖度=84.167; E 值=5.76e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |