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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_021135
当前查询版本OH1004
位置Chr04:122203258-122206905 (-)
描述Similar to FRS5: Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_021135 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g38180 假定的转录激活剂参与调节发育的光控制。 暂无已核实直接文献
At2g27110 假定的转录激活剂参与调节发育的光控制。 暂无已核实直接文献
At1g52520 假定的转录激活剂参与调节发育的光控制。
At3g06250 假定的转录激活剂参与调节发育的光控制。 暂无已核实直接文献
At4g15090 转录激活剂,可识别并结合 DNA 共有序列 5'-CACGCGC-3'。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006355regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.193; 覆盖度=71.608; E 值=2.4e-56; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009639response to red or far red light生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=24.074; 覆盖度=81.407; E 值=3.14e-44; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010017red or far-red light signaling pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=24.074; 覆盖度=81.407; E 值=3.14e-44; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010018far-red light signaling pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=24.074; 覆盖度=81.407; E 值=3.14e-44; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010218response to far red light生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=24.074; 覆盖度=81.407; E 值=3.14e-44; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042753positive regulation of circadian rhythm生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=24.074; 覆盖度=81.407; E 值=3.14e-44; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0045893positive regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=24.074; 覆盖度=81.407; E 值=3.14e-44; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1900056negative regulation of leaf senescence生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=24.074; 覆盖度=81.407; E 值=3.14e-44; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.193; 覆盖度=71.608; E 值=2.4e-56; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009506plasmodesma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=26.206; 覆盖度=78.141; E 值=3.89e-49; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003700DNA-binding transcription factor activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=24.074; 覆盖度=81.407; E 值=3.14e-44; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.193; 覆盖度=71.608; E 值=2.4e-56; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G52520KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.496; 覆盖度=73.492; E 值=1.26e-46UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G27110KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=26.206; 覆盖度=78.141; E 值=3.89e-49UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G06250KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=24.267; 覆盖度=77.136; E 值=5.78e-45UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G15090KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=24.074; 覆盖度=81.407; E 值=3.14e-44UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G38180KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.193; 覆盖度=71.608; E 值=2.4e-56UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release