基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_009136 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:118521211-118522598 (-) |
| 描述 | Similar to GATA28: GATA transcription factor 28 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_009136 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g51600 |
转录激活因子，特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | |
At3g21175 |
转录激活因子，特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0698900 |
转录激活因子，特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0148500 |
转录激活因子，特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2XKR7 |
转录激活因子，特异性结合基因启动子内的 5'-GATA-3' 或 5'-GAT-3' 基序。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.934; 覆盖度=103.401; E 值=4.71e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.934; 覆盖度=103.401; E 值=4.71e-103; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.934; 覆盖度=103.401; E 值=4.71e-103; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.934; 覆盖度=103.401; E 值=4.71e-103; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.934; 覆盖度=103.401; E 值=4.71e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.934; 覆盖度=103.401; E 值=4.71e-103; UniProt GO evidence=IPI:IntAct | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.061; 覆盖度=84.014; E 值=3.2e-79; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G51600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.934; 覆盖度=103.401; E 值=4.71e-103 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G21175 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=56.25; 覆盖度=103.401; E 值=2.25e-100 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0148500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.656; 覆盖度=62.245; E 值=2.2e-71 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0698900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.061; 覆盖度=84.014; E 值=3.2e-79 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |