基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_003262 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:72323292-72324330 (+) |
| 描述 | Similar to GER2: Putative GDP-L-fucose synthase 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_003262 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g17890 |
催化 GDP-4-脱氢-6-脱氧-D-甘露糖向 GDP-岩藻糖的两步 NADP 依赖性转化,涉及差向异构酶和还原酶反应。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g73250 |
催化GDP-4-脱氢-6-脱氧-D-甘露糖向GDP-岩藻糖的两步NADP依赖性转化,涉及表异构酶和还原酶反应。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0652400 |
催化GDP-4-脱氢-6-脱氧-D-甘露糖向GDP-岩藻糖的两步NADP依赖性转化,涉及表异构酶和还原酶反应。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0652300 |
催化GDP-4-脱氢-6-脱氧-D-甘露糖向GDP-岩藻糖的两步NADP依赖性转化,涉及表异构酶和还原酶反应。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006005 | L-fucose biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=77.143; 覆盖度=98.131; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042351 | 'de novo' GDP-L-fucose biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=78.778; 覆盖度=96.885; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=78.778; 覆盖度=96.885; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016853 | isomerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=78.778; 覆盖度=96.885; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050577 | GDP-L-fucose synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=78.778; 覆盖度=96.885; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070401 | NADP+ binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.076; 覆盖度=94.393; E 值=7.74e-128; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G17890 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=78.778; 覆盖度=96.885; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G73250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=77.143; 覆盖度=98.131; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0652300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=58.361; 覆盖度=95.016; E 值=9.04e-130 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0652400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=74.434; 覆盖度=96.262; E 值=3.3e-180 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rhi:NGR_a00420 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=59.076; 覆盖度=94.393; E 值=7.74e-128 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |