Phenotype–resequencing pairing is incomplete: a verified crosswalk between paper Rxx IDs and public F1-xx / 164L / X5H IDs is missing. Number or row order is not used to guess identities. Variant and source phenotype records remain separate; matched-sample joint analysis is unavailable. Integration status
CRA009020 · PASS SNP / INDEL
Gene-level variant query
Enter a gene ID to view candidate SNPs/INDELs in the OH1004 and TK1151 reference coordinates and carriers among 129 CRA009020 resequenced samples: 127 F1 offspring plus parents 164L and X5H. These are not 129 independent varieties.
Task is running normally, please waitElapsed 00:00
1matched genes
143distinct reference variant records
133 / 10SNP / INDEL
129carrier samples
Variant details and carrier samples
143 distinct reference variant records and 143 gene–variant association rows match this filter; pagination uses association rows. View the 129-sample metadata
| Gene / reference | Position | REF / ALT | Type | QUAL / DP / AF | ALT carrier samples/materials |
|---|---|---|---|---|---|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738654 | G > T | SNP PASS | QUAL 7722.13 DP 1069 · AF 0.34108527 129/129 called · 56 het |
72 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-100 0/1F1-103 0/1F1-104 0/1F1-106 0/1F1-109 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-115 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-122 0/1F1-124 0/1F1-127 0/1F1-129 0/1F1-13 0/1F1-132 0/1F1-139 0/1F1-140 0/1F1-142 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-18 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 1/1F1-36 0/1F1-37 1/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 1/1F1-48 0/1F1-51 1/1F1-56 0/1F1-58 0/1F1-6 0/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-65 0/1F1-66 1/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-73 1/1F1-74 1/1F1-75 1/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-84 0/1F1-86 0/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-96 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738658 | A > T | SNP PASS | QUAL 8154.96 DP 1078 · AF 0.34496124 129/129 called · 45 het |
67 carrier samples View listF1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 1/1F1-102 1/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-11 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-116 0/1F1-119 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-123 1/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-13 0/1F1-130 1/1F1-131 1/1F1-133 1/1F1-134 0/1F1-135 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 1/1F1-64 1/1F1-65 0/1F1-68 1/1F1-71 0/1F1-76 0/1F1-79 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-90 0/1F1-92 0/1F1-95 1/1F1-97 0/1F1-98 0/1F1-99 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738690 | G > A | SNP PASS | QUAL 7715.82 DP 1124 · AF 0.30232558 129/129 called · 44 het |
61 carrier samples View listF1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 1/1F1-102 0/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-11 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-119 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-123 1/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-13 0/1F1-130 1/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-44 0/1F1-49 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 0/1F1-64 1/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-71 0/1F1-76 0/1F1-79 0/1F1-81 0/1F1-82 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-90 0/1F1-92 0/1F1-95 1/1F1-99 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738710 | A > G | SNP PASS | QUAL 76.20 DP 1142 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-140 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738876 | C > T | SNP PASS | QUAL 38.66 DP 1066 · AF 0.0039370079 127/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listX5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738957 | C > T | SNP PASS | QUAL 9884.26 DP 1059 · AF 0.42578125 128/129 called · 55 het |
82 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-108 0/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-124 1/1F1-125 1/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-21 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 1/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-44 1/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 1/1F1-79 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-92 1/1F1-95 1/1F1-96 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738966 | C > T | SNP PASS | QUAL 10254.50 DP 1073 · AF 0.41796875 128/129 called · 55 het |
81 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-108 0/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-119 1/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-124 1/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-21 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 1/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-36 0/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-44 1/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 1/1F1-79 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-92 1/1F1-95 1/1F1-96 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738976 | C > A | SNP PASS | QUAL 74.03 DP 1098 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-68 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738976 | C > T | SNP PASS | QUAL 74.03 DP 1098 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-74 0/2
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739009 | C > T | SNP PASS | QUAL 17609.90 DP 1056 · AF 0.76356589 129/129 called · 37 het |
117 carrier samples View list164L 1/1F1-1 0/1F1-10 1/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-102 1/1F1-104 0/1F1-107 1/1F1-108 1/1F1-109 1/1F1-11 1/1F1-110 1/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 1/1F1-114 1/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 1/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 1/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 1/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-143 1/1F1-144 1/1F1-145 0/1F1-146 1/1F1-147 1/1F1-148 0/1F1-149 1/1F1-15 0/1F1-16 1/1F1-18 1/1F1-19 1/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-21 0/1F1-26 1/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 1/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-43 0/1F1-44 1/1F1-45 1/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 1/1F1-5 1/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-55 1/1F1-56 1/1F1-58 1/1F1-6 1/1F1-61 1/1F1-62 0/1F1-63 1/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 0/1F1-68 1/1F1-71 1/1F1-72 1/1F1-73 1/1F1-74 1/1F1-75 1/1F1-76 1/1F1-78 1/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 1/1F1-90 1/1F1-91 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-96 1/1F1-97 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739012 | T > A | SNP PASS | QUAL 17394.30 DP 1057 · AF 0.42635659 129/129 called · 58 het |
84 carrier samples View list164L 1/2F1-1 0/1F1-10 1/2F1-102 1/1F1-104 0/1F1-108 1/2F1-109 1/1F1-110 1/2F1-111 1/2F1-113 1/1F1-114 1/2F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-12 1/2F1-124 0/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 1/1F1-133 1/2F1-134 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 1/2F1-145 0/1F1-146 1/2F1-147 1/2F1-148 0/1F1-149 1/1F1-16 1/2F1-18 1/1F1-2 1/2F1-20 1/1F1-26 1/1F1-29 1/2F1-30 1/2F1-32 1/2F1-34 0/1F1-38 0/1F1-41 1/2F1-42 1/2F1-45 1/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 1/2F1-5 1/1F1-51 0/1F1-53 1/2F1-56 1/2F1-58 1/1F1-6 1/2F1-61 1/1F1-62 0/1F1-64 1/1F1-65 1/2F1-66 0/1F1-71 1/2F1-72 1/2F1-73 1/1F1-74 1/2F1-75 1/2F1-78 1/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 1/2F1-83 1/1F1-84 1/2F1-85 1/1F1-88 1/2F1-89 1/1F1-9 1/2F1-90 1/2F1-91 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1F1-98 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739012 | T > C | SNP PASS | QUAL 17394.30 DP 1057 · AF 0.32945736 129/129 called · 43 het |
64 carrier samples View list164L 1/2F1-10 1/2F1-100 2/2F1-101 2/2F1-107 2/2F1-108 1/2F1-11 2/2F1-110 1/2F1-111 1/2F1-112 0/2F1-114 1/2F1-115 2/2F1-119 0/2F1-12 1/2F1-131 2/2F1-132 2/2F1-133 1/2F1-135 2/2F1-137 2/2F1-141 2/2F1-143 1/2F1-144 2/2F1-146 1/2F1-147 1/2F1-15 0/2F1-16 1/2F1-19 2/2F1-2 1/2F1-21 0/2F1-29 1/2F1-30 1/2F1-31 2/2F1-32 1/2F1-33 2/2F1-36 0/2F1-37 0/2F1-40 0/2F1-41 1/2F1-42 1/2F1-43 0/2F1-44 2/2F1-49 1/2F1-53 1/2F1-55 2/2F1-56 1/2F1-6 1/2F1-63 2/2F1-65 1/2F1-68 2/2F1-71 1/2F1-72 1/2F1-74 1/2F1-75 1/2F1-76 2/2F1-8 0/2F1-82 1/2F1-84 1/2F1-87 2/2F1-88 1/2F1-9 1/2F1-90 1/2F1-95 2/2F1-99 0/2X5H 0/2
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739054 | C > T | SNP PASS | QUAL 8502.03 DP 1066 · AF 0.36046512 129/129 called · 43 het |
68 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-100 1/1F1-101 0/1F1-104 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-129 0/1F1-13 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-141 1/1F1-144 1/1F1-146 1/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-18 1/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-26 0/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-44 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 1/1F1-58 0/1F1-6 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 0/1F1-68 1/1F1-71 1/1F1-73 0/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-82 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 0/1F1-95 1/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739086 | CAAAAAAAAAAA > CAAAAAAAAAAAAAA | INDEL PASS | QUAL 7775.94 DP 975 · AF 0.10655738 122/129 called · 26 het |
26 carrier samples View listF1-10 1/2F1-102 0/2F1-103 0/2F1-108 0/2F1-111 1/2F1-112 1/2F1-113 1/2F1-114 0/2F1-116 0/2F1-12 1/2F1-126 0/2F1-127 0/2F1-128 0/2F1-130 1/2F1-134 0/2F1-139 1/2F1-140 0/2F1-48 0/2F1-5 1/2F1-58 0/2F1-80 0/2F1-81 1/2F1-82 1/2F1-85 1/2F1-88 1/2F1-89 1/2
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739086 | CAAAAAAAAAAA > CAAAAAAAAAAAAAAA | INDEL PASS | QUAL 7775.94 DP 975 · AF 0.23360656 122/129 called · 39 het |
48 carrier samples View list164L 0/1F1-10 1/2F1-109 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 1/2F1-112 1/2F1-113 1/2F1-115 1/1F1-12 1/2F1-13 0/1F1-130 1/2F1-132 1/1F1-139 1/2F1-145 0/1F1-147 0/1F1-149 0/1F1-15 1/1F1-19 0/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 0/1F1-44 1/1F1-49 1/1F1-5 1/2F1-53 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-73 0/1F1-74 0/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-81 1/2F1-82 1/2F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 1/2F1-88 1/2F1-89 1/2F1-9 1/1F1-91 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739097 | ATT > AAATTT | INDEL PASS | QUAL 4067.00 DP 1001 · AF 0.23412698 126/129 called · 39 het |
49 carrier samples View list164L 1/2F1-10 0/1F1-102 1/1F1-103 0/1F1-108 1/2F1-109 1/2F1-11 0/1F1-110 1/2F1-111 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-116 0/1F1-12 1/2F1-124 0/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-13 1/2F1-130 1/1F1-132 1/1F1-134 0/1F1-139 1/1F1-143 0/1F1-145 0/1F1-147 1/2F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 1/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 1/1F1-49 1/1F1-5 0/1F1-58 1/2F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-73 1/2F1-76 0/1F1-78 1/2F1-80 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-89 1/2F1-9 1/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739097 | ATT > ATTT | INDEL PASS | QUAL 4067.00 DP 1001 · AF 0.19444444 126/129 called · 35 het |
42 carrier samples View list164L 1/2F1-1 0/2F1-100 0/2F1-104 2/2F1-107 0/2F1-108 1/2F1-109 1/2F1-110 1/2F1-115 0/2F1-119 0/2F1-12 1/2F1-129 0/2F1-13 1/2F1-146 0/2F1-147 1/2F1-18 2/2F1-2 0/2F1-20 2/2F1-26 2/2F1-30 0/2F1-32 0/2F1-34 0/2F1-41 0/2F1-42 0/2F1-51 0/2F1-58 1/2F1-6 0/2F1-61 0/2F1-62 0/2F1-64 0/2F1-65 0/2F1-66 0/2F1-68 0/2F1-73 1/2F1-74 0/2F1-75 2/2F1-78 1/2F1-87 0/2F1-89 1/2F1-90 2/2F1-93 0/2F1-95 2/2
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739097 | A > T | SNP PASS | QUAL 4689.72 DP 1001 · AF 0.21825397 126/129 called · 37 het |
46 carrier samples View listF1-100 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-114 0/1F1-129 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 0/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-140 0/1F1-141 0/1F1-142 1/1F1-144 1/1F1-146 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-16 1/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-44 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-56 1/1F1-6 0/1F1-63 0/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-71 1/1F1-76 0/1F1-79 0/1F1-82 0/1F1-87 0/1F1-88 0/1F1-91 0/1F1-95 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739098 | T > A | SNP PASS | QUAL 38.75 DP 988 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739105 | A > G | SNP PASS | QUAL 191.87 DP 972 · AF 0.007751938 129/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-149 0/1F1-80 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739140 | T > C | SNP PASS | QUAL 1590.16 DP 974 · AF 0.0859375 128/129 called · 20 het |
21 carrier samples View listF1-102 0/1F1-103 1/1F1-109 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-119 0/1F1-124 0/1F1-125 0/1F1-127 0/1F1-133 0/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-149 0/1F1-73 0/1F1-81 0/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739141 | A > T | SNP PASS | QUAL 667.88 DP 970 · AF 0.0390625 128/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-109 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-149 0/1F1-73 0/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-96 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739157 | T > A | SNP PASS | QUAL 8484.54 DP 975 · AF 0.40944882 127/129 called · 58 het |
81 carrier samples View list164L 0/1F1-10 1/1F1-102 0/1F1-103 1/1F1-108 0/1F1-109 0/1F1-110 0/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-123 1/1F1-124 0/1F1-125 0/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-13 0/1F1-130 1/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-134 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-149 1/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 0/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 1/1F1-5 1/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 1/1F1-73 0/1F1-74 1/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 1/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-9 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739295 | G > C | SNP PASS | QUAL 2614.02 DP 976 · AF 0.12790698 129/129 called · 23 het |
28 carrier samples View listF1-100 0/1F1-101 0/1F1-103 0/1F1-107 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-117 0/1F1-131 1/1F1-135 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-45 0/1F1-53 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-87 0/1F1-88 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739313 | TAAAAAAA > TAAAAAAAA | INDEL PASS | QUAL 5080.84 DP 984 · AF 0.30081301 123/129 called · 42 het |
58 carrier samples View listF1-100 0/1F1-101 1/1F1-102 0/1F1-103 1/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-108 1/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-119 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-124 1/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-130 0/1F1-134 1/1F1-136 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 1/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-18 0/1F1-26 0/1F1-38 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-72 0/1F1-74 1/1F1-75 0/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-79 1/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-90 0/1F1-91 1/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1F1-98 1/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739580 | A > G | SNP PASS | QUAL 7950.08 DP 1121 · AF 0.33333333 129/129 called · 66 het |
76 carrier samples View listF1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-107 0/1F1-11 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-125 0/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 0/1F1-133 1/1F1-136 0/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-19 0/1F1-2 0/1F1-21 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 1/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-79 0/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-86 0/1F1-90 1/1F1-91 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1F1-99 0/1X5H 1/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739590 | C > T | SNP PASS | QUAL 2948.64 DP 1134 · AF 0.10546875 128/129 called · 25 het |
26 carrier samples View listF1-1 0/1F1-107 0/1F1-133 0/1F1-140 0/1F1-141 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739653 | G > A | SNP PASS | QUAL 54.79 DP 1157 · AF 0.0078125 128/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-102 0/1F1-81 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739680 | G > A | SNP PASS | QUAL 80.71 DP 1212 · AF 0.007751938 129/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-103 0/1F1-143 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739687 | T > C | SNP PASS | QUAL 443.83 DP 1197 · AF 0.042635659 129/129 called · 11 het |
11 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739706 | A > T | SNP PASS | QUAL 13979.70 DP 1210 · AF 0.54263566 129/129 called · 54 het |
97 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-104 1/1F1-105 0/1F1-106 1/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-109 1/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 1/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 1/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-139 0/1F1-140 1/1F1-143 0/1F1-146 1/1F1-147 0/1F1-149 0/1F1-18 1/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-20 0/1F1-26 1/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 0/1F1-34 1/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-44 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 1/1F1-58 1/1F1-6 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 1/1F1-68 1/1F1-71 1/1F1-72 0/1F1-73 1/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-77 0/1F1-78 1/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-85 1/1F1-86 1/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-90 1/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 1/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739725 | G > A | SNP PASS | QUAL 30.51 DP 1224 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-134 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739741 | T > C | SNP PASS | QUAL 7773.48 DP 1209 · AF 0.32170543 129/129 called · 57 het |
70 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-103 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-118 0/1F1-12 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-129 0/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 1/1F1-136 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-15 1/1F1-16 1/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-33 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-46 0/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-76 1/1F1-77 0/1F1-79 0/1F1-8 1/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739768 | C > A | SNP PASS | QUAL 5293.89 DP 1186 · AF 0.22868217 129/129 called · 49 het |
54 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-103 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-124 0/1F1-129 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-142 0/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-15 1/1F1-16 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 0/1F1-5 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-81 0/1F1-84 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739778 | C > T | SNP PASS | QUAL 11826.10 DP 1162 · AF 0.49612403 129/129 called · 64 het |
96 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-104 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-109 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 1/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 1/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-139 0/1F1-140 1/1F1-142 0/1F1-143 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-18 1/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-26 1/1F1-29 0/1F1-30 1/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 1/1F1-38 0/1F1-41 1/1F1-42 0/1F1-45 1/1F1-46 0/1F1-49 1/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-56 0/1F1-58 1/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-64 1/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-73 1/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-77 0/1F1-78 1/1F1-79 1/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-86 1/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 1/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739783 | G > A | SNP PASS | QUAL 1172.29 DP 1175 · AF 0.050387597 129/129 called · 13 het |
13 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739784 | C > T | SNP PASS | QUAL 789.01 DP 1167 · AF 0.03875969 129/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739786 | G > A | SNP PASS | QUAL 61.93 DP 1158 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-134 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739794 | G > C | SNP PASS | QUAL 1282.64 DP 1139 · AF 0.050387597 129/129 called · 13 het |
13 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739801 | C > G | SNP PASS | QUAL 4595.16 DP 1166 · AF 0.21484375 128/129 called · 41 het |
48 carrier samples View listF1-1 0/1F1-103 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-112 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-127 1/1F1-130 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-141 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-21 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739806 | T > A | SNP PASS | QUAL 5368.53 DP 1176 · AF 0.21875 128/129 called · 40 het |
48 carrier samples View listF1-1 0/1F1-103 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-112 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-127 1/1F1-130 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-21 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739821 | TAAAAAAAAA > TAAAAAAAAAA | INDEL PASS | QUAL 6548.48 DP 1161 · AF 0.13306452 124/129 called · 29 het |
31 carrier samples View listF1-101 0/2F1-102 0/2F1-108 0/2F1-11 1/2F1-114 1/2F1-123 0/2F1-134 0/2F1-139 0/2F1-19 1/2F1-2 0/2F1-29 0/2F1-31 2/2F1-32 0/2F1-33 1/2F1-42 0/2F1-44 1/2F1-55 1/2F1-56 2/2F1-6 0/2F1-63 1/2F1-64 0/2F1-65 0/2F1-68 0/2F1-71 0/2F1-81 0/2F1-85 0/2F1-88 0/2F1-91 0/2F1-98 0/2F1-99 0/2X5H 0/2
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739821 | TAAAAAAAAA > TAAAAAAAAAAAA | INDEL PASS | QUAL 6548.48 DP 1161 · AF 0.20564516 124/129 called · 41 het |
46 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-106 0/1F1-11 1/2F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 1/2F1-115 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-124 0/1F1-126 0/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-141 0/1F1-144 0/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-19 1/2F1-20 0/1F1-21 1/1F1-33 1/2F1-36 1/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 1/1F1-44 1/2F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 1/2F1-62 0/1F1-63 1/2F1-7 1/1F1-72 1/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-9 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739824 | A > C | SNP PASS | QUAL 459.91 DP 1179 · AF 0.036585366 123/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-105 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739827 | A > T | SNP PASS | QUAL 245.79 DP 1183 · AF 0.020325203 123/129 called · 5 het |
5 carrier samples View listF1-106 0/1F1-122 0/1F1-77 0/1F1-86 0/1F1-97 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739831 | G > A | SNP PASS | QUAL 10711.30 DP 1062 · AF 0.54365079 126/129 called · 51 het |
94 carrier samples View list164L 0/1F1-1 1/1F1-10 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-104 1/1F1-105 1/1F1-106 1/1F1-107 1/1F1-108 0/1F1-109 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 1/1F1-114 0/1F1-117 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 1/1F1-121 1/1F1-122 1/1F1-125 1/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-128 1/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 1/1F1-132 0/1F1-133 1/1F1-140 1/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-143 1/1F1-144 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-148 1/1F1-149 1/1F1-18 1/1F1-20 0/1F1-26 1/1F1-29 0/1F1-30 1/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-45 1/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-51 1/1F1-53 1/1F1-56 0/1F1-58 1/1F1-6 0/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 1/1F1-68 0/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-73 1/1F1-75 0/1F1-77 1/1F1-78 1/1F1-79 0/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-86 0/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739833 | A > T | SNP PASS | QUAL 1288.47 DP 1104 · AF 0.055555556 126/129 called · 10 het |
12 carrier samples View listF1-101 0/1F1-105 1/1F1-120 0/1F1-121 0/1F1-122 0/1F1-125 1/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-79 0/1F1-92 0/1F1-96 0/1F1-98 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739834 | A > T | SNP PASS | QUAL 7813.58 DP 1108 · AF 0.34126984 126/129 called · 50 het |
68 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-106 0/1F1-108 0/1F1-109 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 1/1F1-117 0/1F1-12 0/1F1-120 1/1F1-121 1/1F1-122 1/1F1-125 1/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 1/1F1-132 0/1F1-140 1/1F1-143 0/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-149 1/1F1-18 1/1F1-20 0/1F1-26 1/1F1-29 0/1F1-30 1/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-49 0/1F1-51 0/1F1-56 0/1F1-58 0/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-73 0/1F1-75 0/1F1-77 0/1F1-78 1/1F1-79 0/1F1-80 0/1F1-86 0/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739835 | T > A | SNP PASS | QUAL 2097.87 DP 1122 · AF 0.12301587 126/129 called · 25 het |
28 carrier samples View listF1-106 0/1F1-107 1/1F1-117 0/1F1-119 0/1F1-127 1/1F1-141 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 0/1F1-148 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-45 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-91 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739841 | T > C | SNP PASS | QUAL 2836.98 DP 1190 · AF 0.16666667 126/129 called · 30 het |
36 carrier samples View listF1-105 0/1F1-107 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-127 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-141 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-21 1/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739844 | A > G | SNP PASS | QUAL 3712.83 DP 1166 · AF 0.20155039 129/129 called · 38 het |
45 carrier samples View listF1-1 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-112 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-127 1/1F1-130 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-141 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-21 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739948 | T > A | SNP PASS | QUAL 1053.37 DP 1254 · AF 0.046875 128/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739951 | G > A | SNP PASS | QUAL 76.58 DP 1242 · AF 0.0078125 128/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-103 0/1F1-143 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739957 | C > T | SNP PASS | QUAL 1290.19 DP 1267 · AF 0.046511628 129/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739969 | T > C | SNP PASS | QUAL 1102.37 DP 1241 · AF 0.046511628 129/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739975 | A > G | SNP PASS | QUAL 1087.03 DP 1246 · AF 0.046511628 129/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739993 | C > T | SNP PASS | QUAL 994.52 DP 1166 · AF 0.04296875 128/129 called · 11 het |
11 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739997 | A > G | SNP PASS | QUAL 207.33 DP 1167 · AF 0.003968254 126/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-127 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740058 | G > T | SNP PASS | QUAL 2438.44 DP 1242 · AF 0.11417323 127/129 called · 27 het |
28 carrier samples View listF1-1 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-119 0/1F1-127 0/1F1-133 0/1F1-141 1/1F1-144 0/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-61 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740059 | G > A | SNP PASS | QUAL 2529.39 DP 1248 · AF 0.11417323 127/129 called · 27 het |
28 carrier samples View listF1-1 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-119 0/1F1-127 0/1F1-133 0/1F1-141 1/1F1-144 0/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-61 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740060 | G > A | SNP PASS | QUAL 189.29 DP 1244 · AF 0.0078740157 127/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-45 0/1F1-93 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740074 | T > G | SNP PASS | QUAL 141.26 DP 1248 · AF 0.027559055 127/129 called · 7 het |
7 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740075 | T > A | SNP PASS | QUAL 137.84 DP 1243 · AF 0.027559055 127/129 called · 7 het |
7 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740076 | G > A | SNP PASS | QUAL 150.45 DP 1251 · AF 0.027559055 127/129 called · 7 het |
7 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740079 | A > T | SNP PASS | QUAL 144.16 DP 1262 · AF 0.023622047 127/129 called · 6 het |
6 carrier samples View listF1-105 0/1F1-118 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740082 | T > G | SNP PASS | QUAL 143.32 DP 1255 · AF 0.027559055 127/129 called · 7 het |
7 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740107 | A > G | SNP PASS | QUAL 777.72 DP 1232 · AF 0.043650794 126/129 called · 11 het |
11 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740110 | G > T | SNP PASS | QUAL 812.84 DP 1226 · AF 0.043650794 126/129 called · 11 het |
11 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740129 | G > A | SNP PASS | QUAL 861.12 DP 1227 · AF 0.0390625 128/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740132 | A > G | SNP PASS | QUAL 844.77 DP 1234 · AF 0.03515625 128/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740133 | C > G | SNP PASS | QUAL 251.82 DP 1232 · AF 0.01171875 128/129 called · 3 het |
3 carrier samples View listF1-108 0/1F1-134 0/1F1-74 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740141 | A > G | SNP PASS | QUAL 33.11 DP 1273 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-85 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740147 | T > G | SNP PASS | QUAL 923.82 DP 1249 · AF 0.05078125 128/129 called · 13 het |
13 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740154 | G > A | SNP PASS | QUAL 3706.04 DP 1249 · AF 0.15891473 129/129 called · 35 het |
38 carrier samples View list164L 0/1F1-10 1/1F1-101 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-113 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-12 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-126 0/1F1-132 0/1F1-139 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 1/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-76 1/1F1-84 0/1F1-9 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740160 | T > A | SNP PASS | QUAL 370.27 DP 1247 · AF 0.019379845 129/129 called · 3 het |
4 carrier samples View listF1-53 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-85 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740162 | T > G | SNP PASS | QUAL 954.51 DP 1240 · AF 0.046511628 129/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740195 | T > A | SNP PASS | QUAL 799.67 DP 1170 · AF 0.03875969 129/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740202 | T > C | SNP PASS | QUAL 688.76 DP 1153 · AF 0.03875969 129/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-103 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740203 | C > A | SNP PASS | QUAL 5731.34 DP 1158 · AF 0.2421875 128/129 called · 48 het |
55 carrier samples View list164L 0/1F1-10 1/1F1-101 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-116 1/1F1-117 0/1F1-12 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-126 0/1F1-127 0/1F1-13 0/1F1-130 0/1F1-132 1/1F1-134 0/1F1-139 0/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 0/1F1-49 1/1F1-5 1/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-76 1/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740216 | A > T | SNP PASS | QUAL 696.75 DP 1157 · AF 0.034883721 129/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-101 0/1F1-113 0/1F1-116 0/1F1-123 0/1F1-126 0/1F1-139 0/1F1-5 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740223 | C > G | SNP PASS | QUAL 2717.91 DP 1130 · AF 0.11627907 129/129 called · 26 het |
28 carrier samples View listF1-1 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-119 0/1F1-127 0/1F1-133 0/1F1-141 1/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-77 0/1F1-82 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740253 | T > A | SNP PASS | QUAL 582.90 DP 1158 · AF 0.03125 128/129 called · 8 het |
8 carrier samples View listF1-103 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740283 | A > C | SNP PASS | QUAL 1598.86 DP 1212 · AF 0.0546875 128/129 called · 12 het |
13 carrier samples View listF1-117 0/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-148 0/1F1-38 0/1F1-44 0/1F1-53 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-90 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740294 | G > A | SNP PASS | QUAL 2809.78 DP 1206 · AF 0.09765625 128/129 called · 23 het |
24 carrier samples View listF1-118 0/1F1-119 0/1F1-139 0/1F1-146 0/1F1-19 0/1F1-2 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 0/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-71 1/1F1-85 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740327 | T > C | SNP PASS | QUAL 493.35 DP 1179 · AF 0.01171875 128/129 called · 3 het |
3 carrier samples View listF1-13 0/1F1-130 0/1F1-49 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740341 | T > C | SNP PASS | QUAL 80.95 DP 1213 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740394 | G > A | SNP PASS | QUAL 209.57 DP 1212 · AF 0.011627907 129/129 called · 3 het |
3 carrier samples View listF1-142 0/1F1-38 0/1F1-46 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740422 | A > G | SNP PASS | QUAL 10117.60 DP 1224 · AF 0.43410853 129/129 called · 56 het |
84 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 1/1F1-106 1/1F1-107 1/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 1/1F1-115 1/1F1-118 0/1F1-119 1/1F1-12 0/1F1-124 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-133 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-141 1/1F1-144 1/1F1-145 0/1F1-146 0/1F1-147 1/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-16 1/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-34 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-40 1/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 1/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-7 1/1F1-71 0/1F1-72 1/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 1/1F1-77 0/1F1-8 1/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-85 0/1F1-86 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1F1-99 0/1X5H 1/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740427 | G > C | SNP PASS | QUAL 374.23 DP 1225 · AF 0.027131783 129/129 called · 7 het |
7 carrier samples View listF1-105 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740442 | C > T | SNP PASS | QUAL 24686.70 DP 1227 · AF 0.95736434 129/129 called · 11 het |
129 carrier samples View list164L 1/1F1-1 1/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-102 1/1F1-103 1/1F1-104 1/1F1-105 1/1F1-106 1/1F1-107 1/1F1-108 1/1F1-109 1/1F1-11 1/1F1-110 1/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 1/1F1-114 1/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-119 1/1F1-12 1/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 1/1F1-123 1/1F1-124 1/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 1/1F1-129 1/1F1-13 1/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 1/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 1/1F1-141 1/1F1-142 1/1F1-143 1/1F1-144 1/1F1-145 1/1F1-146 1/1F1-147 1/1F1-148 1/1F1-149 1/1F1-15 1/1F1-16 1/1F1-18 1/1F1-19 1/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-21 1/1F1-26 1/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 1/1F1-34 1/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-43 1/1F1-44 1/1F1-45 1/1F1-46 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 1/1F1-51 1/1F1-53 1/1F1-55 1/1F1-56 1/1F1-58 1/1F1-6 1/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-63 1/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 1/1F1-68 1/1F1-7 1/1F1-71 1/1F1-72 1/1F1-73 1/1F1-74 1/1F1-75 1/1F1-76 1/1F1-77 1/1F1-78 1/1F1-79 1/1F1-8 1/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 1/1F1-86 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 1/1F1-90 1/1F1-91 1/1F1-92 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 1/1F1-99 1/1X5H 1/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740476 | C > T | SNP PASS | QUAL 291.67 DP 1282 · AF 0.023255814 129/129 called · 6 het |
6 carrier samples View listF1-105 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740491 | A > G | SNP PASS | QUAL 166.79 DP 1289 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740525 | A > T | SNP PASS | QUAL 11200.20 DP 1241 · AF 0.42635659 129/129 called · 54 het |
82 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 1/1F1-115 1/1F1-118 0/1F1-119 1/1F1-12 1/1F1-124 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-133 1/1F1-134 0/1F1-139 1/1F1-141 1/1F1-144 1/1F1-146 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-16 1/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-34 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 1/1F1-44 1/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 1/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-7 1/1F1-72 0/1F1-75 0/1F1-76 1/1F1-77 0/1F1-8 1/1F1-80 0/1F1-81 0/1F1-82 1/1F1-83 0/1F1-85 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1F1-99 0/1X5H 1/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740571 | A > C | SNP PASS | QUAL 107.59 DP 1274 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740637 | T > G | SNP PASS | QUAL 396.31 DP 1312 · AF 0.0234375 128/129 called · 6 het |
6 carrier samples View listF1-101 0/1F1-116 0/1F1-126 0/1F1-139 0/1F1-5 0/1F1-98 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740651 | G > T | SNP PASS | QUAL 48.99 DP 1310 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-105 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740716 | G > T | SNP PASS | QUAL 599.78 DP 1299 · AF 0.019379845 129/129 called · 5 het |
5 carrier samples View listF1-101 0/1F1-126 0/1F1-139 0/1F1-5 0/1F1-98 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740728 | A > T | SNP PASS | QUAL 14494.00 DP 1220 · AF 0.56589147 129/129 called · 52 het |
99 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-100 1/1F1-101 0/1F1-102 1/1F1-103 1/1F1-104 1/1F1-105 1/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-109 1/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-115 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 1/1F1-121 1/1F1-122 1/1F1-124 0/1F1-125 1/1F1-126 0/1F1-129 1/1F1-13 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-145 0/1F1-146 1/1F1-147 0/1F1-149 1/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 1/1F1-19 1/1F1-2 1/1F1-20 0/1F1-26 1/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-44 1/1F1-45 0/1F1-51 0/1F1-55 0/1F1-56 1/1F1-58 1/1F1-6 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 0/1F1-68 1/1F1-71 1/1F1-72 0/1F1-73 1/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-79 1/1F1-80 0/1F1-81 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-86 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-92 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740748 | C > A | SNP PASS | QUAL 295.52 DP 1207 · AF 0.019379845 129/129 called · 5 het |
5 carrier samples View listF1-105 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-134 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740752 | C > G | SNP PASS | QUAL 305.19 DP 1205 · AF 0.023255814 129/129 called · 6 het |
6 carrier samples View listF1-105 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740761 | T > G | SNP PASS | QUAL 148.43 DP 1211 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-140 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740764 | C > A | SNP PASS | QUAL 362.72 DP 1215 · AF 0.0234375 128/129 called · 6 het |
6 carrier samples View listF1-105 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740785 | A > G | SNP PASS | QUAL 24485.90 DP 1231 · AF 0.94921875 128/129 called · 13 het |
128 carrier samples View list164L 1/1F1-1 1/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-102 1/1F1-103 1/1F1-104 1/1F1-105 1/1F1-106 1/1F1-107 1/1F1-108 0/1F1-109 1/1F1-11 1/1F1-110 1/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 1/1F1-114 1/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-119 1/1F1-12 1/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 1/1F1-123 1/1F1-124 1/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 1/1F1-129 1/1F1-13 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 1/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 1/1F1-141 1/1F1-142 1/1F1-143 1/1F1-144 1/1F1-145 1/1F1-146 1/1F1-148 1/1F1-149 1/1F1-15 1/1F1-16 1/1F1-18 1/1F1-19 1/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-21 1/1F1-26 1/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 1/1F1-34 1/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-43 1/1F1-44 1/1F1-45 1/1F1-46 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 1/1F1-51 1/1F1-53 1/1F1-55 1/1F1-56 1/1F1-58 1/1F1-6 1/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-63 1/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 1/1F1-68 1/1F1-7 1/1F1-71 1/1F1-72 1/1F1-73 1/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-76 1/1F1-77 1/1F1-78 1/1F1-79 1/1F1-8 1/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 1/1F1-86 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 1/1F1-90 1/1F1-91 1/1F1-92 1/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 1/1F1-99 1/1X5H 1/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740819 | ATAGTCA > ATAGTCAATTAGTCA | INDEL PASS | QUAL 2823.40 DP 1218 · AF 0.07751938 129/129 called · 20 het |
20 carrier samples View listF1-101 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-115 0/1F1-119 0/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-130 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-139 0/1F1-5 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-81 0/1F1-90 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1F1-98 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740833 | G > C | SNP PASS | QUAL 40.63 DP 1178 · AF 0.0078125 128/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-119 0/1F1-134 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740841 | A > C | SNP PASS | QUAL 2608.90 DP 1153 · AF 0.1171875 128/129 called · 26 het |
28 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-115 0/1F1-12 0/1F1-124 0/1F1-132 0/1F1-19 1/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 1/1F1-43 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-9 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740855 | T > A | SNP PASS | QUAL 650.83 DP 1126 · AF 0.031007752 129/129 called · 8 het |
8 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740877 | G > A | SNP PASS | QUAL 128.93 DP 1165 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-113 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740891 | C > T | SNP PASS | QUAL 618.12 DP 1163 · AF 0.02734375 128/129 called · 7 het |
7 carrier samples View listF1-105 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740896 | A > G | SNP PASS | QUAL 572.14 DP 1153 · AF 0.02734375 128/129 called · 7 het |
7 carrier samples View listF1-105 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740900 | A > C | SNP PASS | QUAL 706.30 DP 1124 · AF 0.03125 128/129 called · 8 het |
8 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740901 | G > A | SNP PASS | QUAL 690.67 DP 1129 · AF 0.03125 128/129 called · 8 het |
8 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740923 | G > A | SNP PASS | QUAL 766.93 DP 1110 · AF 0.03515625 128/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740929 | C > T | SNP PASS | QUAL 61.05 DP 1124 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-103 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740954 | C > T | SNP PASS | QUAL 864.43 DP 1169 · AF 0.039370079 127/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740982 | C > A | SNP PASS | QUAL 2688.12 DP 1170 · AF 0.1023622 127/129 called · 24 het |
25 carrier samples View list164L 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-115 0/1F1-132 0/1F1-147 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-55 1/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-9 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740988 | T > A | SNP PASS | QUAL 354.03 DP 1165 · AF 0.015625 128/129 called · 4 het |
4 carrier samples View listF1-105 0/1F1-123 0/1F1-130 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157740997 | G > T | SNP PASS | QUAL 80.11 DP 1172 · AF 0.0039370079 127/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-103 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741021 | G > A | SNP PASS | QUAL 687.90 DP 1121 · AF 0.039370079 127/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741031 | A > C | SNP PASS | QUAL 537.20 DP 1137 · AF 0.03968254 126/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741034 | C > T | SNP PASS | QUAL 30.08 DP 1146 · AF 0.0039370079 127/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-103 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741038 | G > C | SNP PASS | QUAL 546.49 DP 1152 · AF 0.035433071 127/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741039 | G > T | SNP PASS | QUAL 536.42 DP 1153 · AF 0.035433071 127/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741040 | T > C | SNP PASS | QUAL 551.43 DP 1149 · AF 0.035433071 127/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741055 | C > G | SNP PASS | QUAL 9830.09 DP 1148 · AF 0.41732283 127/129 called · 62 het |
84 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-100 0/1F1-101 1/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-104 1/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-108 1/1F1-109 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-119 0/1F1-12 1/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-124 0/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-129 1/1F1-13 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-145 0/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 1/1F1-2 1/1F1-20 0/1F1-26 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-44 0/1F1-51 0/1F1-56 0/1F1-58 1/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-73 1/1F1-75 0/1F1-77 0/1F1-78 1/1F1-79 1/1F1-84 0/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-96 0/1F1-97 1/1F1-98 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741072 | G > A | SNP PASS | QUAL 36.32 DP 1138 · AF 0.0078740157 127/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-103 0/1F1-143 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741080 | T > C | SNP PASS | QUAL 20516.40 DP 1135 · AF 0.84645669 127/129 called · 33 het |
124 carrier samples View list164L 1/1F1-1 1/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-102 1/1F1-103 1/1F1-104 1/1F1-105 1/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-108 1/1F1-109 1/1F1-11 0/1F1-110 1/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 1/1F1-114 1/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-119 1/1F1-12 1/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-123 1/1F1-124 1/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 1/1F1-129 1/1F1-13 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 1/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-136 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-140 1/1F1-141 1/1F1-142 1/1F1-143 1/1F1-144 1/1F1-145 1/1F1-146 0/1F1-147 1/1F1-148 1/1F1-149 1/1F1-15 1/1F1-16 1/1F1-18 1/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-21 1/1F1-26 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-34 1/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 1/1F1-51 1/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-58 1/1F1-6 0/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-63 0/1F1-66 1/1F1-68 0/1F1-7 1/1F1-71 0/1F1-72 1/1F1-73 1/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-76 1/1F1-77 1/1F1-78 1/1F1-79 1/1F1-8 1/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-86 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 1/1F1-90 1/1F1-91 1/1F1-92 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 1/1F1-99 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741095 | T > C | SNP PASS | QUAL 42.20 DP 1096 · AF 0.003968254 126/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-123 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741096 | AT > ATT | INDEL PASS | QUAL 1839.56 DP 1108 · AF 0.095238095 126/129 called · 20 het |
22 carrier samples View listF1-100 0/1F1-102 1/1F1-103 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-119 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-126 0/1F1-130 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-139 0/1F1-16 0/1F1-5 0/1F1-75 0/1F1-81 0/1F1-86 0/1F1-90 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-98 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741100 | A > G | SNP PASS | QUAL 390.09 DP 1119 · AF 0.031746032 126/129 called · 8 het |
8 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741115 | G > A | SNP PASS | QUAL 68.05 DP 1165 · AF 0.003968254 126/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-98 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741122 | T > A | SNP PASS | QUAL 68.63 DP 1163 · AF 0.003968254 126/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741125 | G > A | SNP PASS | QUAL 70.26 DP 1160 · AF 0.003968254 126/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-123 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741142 | T > C | SNP PASS | QUAL 21030.70 DP 1170 · AF 0.84251969 127/129 called · 34 het |
124 carrier samples View list164L 1/1F1-1 1/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-102 1/1F1-103 1/1F1-104 1/1F1-105 1/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-108 1/1F1-109 1/1F1-11 0/1F1-110 1/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 1/1F1-114 1/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-119 1/1F1-12 1/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 1/1F1-123 1/1F1-124 1/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-129 1/1F1-13 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 1/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 1/1F1-141 1/1F1-142 1/1F1-143 1/1F1-144 1/1F1-145 1/1F1-146 0/1F1-147 1/1F1-148 1/1F1-149 1/1F1-15 1/1F1-16 1/1F1-18 1/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-21 1/1F1-26 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-34 1/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 1/1F1-48 1/1F1-5 1/1F1-51 1/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-58 1/1F1-6 0/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-63 0/1F1-64 0/1F1-66 1/1F1-68 0/1F1-7 1/1F1-71 0/1F1-72 1/1F1-73 1/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-76 1/1F1-77 1/1F1-78 1/1F1-79 1/1F1-8 1/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-86 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 1/1F1-90 1/1F1-91 1/1F1-92 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 1/1F1-99 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741188 | G > A | SNP PASS | QUAL 33.75 DP 1146 · AF 0.0078125 128/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-118 0/1F1-130 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741190 | GTCT > GT | INDEL PASS | QUAL 4929.44 DP 1149 · AF 0.171875 128/129 called · 40 het |
42 carrier samples View listF1-10 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-117 0/1F1-124 0/1F1-132 0/1F1-140 1/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-33 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-72 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741192 | C > T | SNP PASS | QUAL 720.39 DP 950 · AF 0.048 125/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741238 | T > A | SNP PASS | QUAL 46.00 DP 1091 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-123 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741240 | G > A | SNP PASS | QUAL 553.97 DP 1056 · AF 0.03515625 128/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741241 | G > T | SNP PASS | QUAL 20056.10 DP 1051 · AF 0.86328125 128/129 called · 33 het |
127 carrier samples View list164L 1/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-102 1/1F1-103 1/1F1-104 1/1F1-105 1/1F1-106 1/1F1-107 1/1F1-108 1/1F1-109 1/1F1-11 0/1F1-110 1/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 0/1F1-114 1/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-119 1/1F1-12 1/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 1/1F1-123 1/1F1-124 1/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 1/1F1-129 1/1F1-13 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 1/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 1/1F1-141 1/1F1-142 1/1F1-143 1/1F1-144 1/1F1-145 1/1F1-146 0/1F1-147 1/1F1-148 1/1F1-149 1/1F1-15 1/1F1-16 1/1F1-18 1/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-21 1/1F1-26 1/1F1-29 1/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-34 1/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 1/1F1-51 1/1F1-53 1/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-58 1/1F1-6 0/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-63 0/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 1/1F1-68 1/1F1-7 1/1F1-71 0/1F1-72 1/1F1-73 1/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-76 1/1F1-77 1/1F1-78 1/1F1-79 1/1F1-8 1/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-86 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 1/1F1-90 1/1F1-91 1/1F1-92 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 1/1F1-99 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741256 | T > G | SNP PASS | QUAL 46.01 DP 1039 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-123 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741262 | A > C | SNP PASS | QUAL 432.55 DP 1026 · AF 0.02734375 128/129 called · 7 het |
7 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-130 0/1F1-149 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157741265 | T > C | SNP PASS | QUAL 435.91 DP 1023 · AF 0.03125 128/129 called · 8 het |
8 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-130 0/1F1-149 0/1F1-20 0/1
|
AF is ALT-specific AC/AN within the selected reference, and NS is the number of samples with complete genotype calls; AF is blank when AC or AN is missing. The two references are calculated separately. These are CRA009020 F1 population candidate variants filtered at QUAL >= 30 and INFO/DP >= 10, not experimental validation or causal claims.