Phenotype–resequencing pairing is incomplete: a verified crosswalk between paper Rxx IDs and public F1-xx / 164L / X5H IDs is missing. Number or row order is not used to guess identities. Variant and source phenotype records remain separate; matched-sample joint analysis is unavailable. Integration status
CRA009020 · PASS SNP / INDEL
Gene-level variant query
Enter a gene ID to view candidate SNPs/INDELs in the OH1004 and TK1151 reference coordinates and carriers among 129 CRA009020 resequenced samples: 127 F1 offspring plus parents 164L and X5H. These are not 129 independent varieties.
Task is running normally, please waitElapsed 00:00
2matched genes
295distinct reference variant records
270 / 25SNP / INDEL
129carrier samples
Variant details and carrier samples
295 distinct reference variant records and 295 gene–variant association rows match this filter; pagination uses association rows. Both references use the same 129 samples; their combined rows are not deduplicated biological sites or a count of materials. View the 129-sample metadata
| Gene / reference | Position | REF / ALT | Type | QUAL / DP / AF | ALT carrier samples/materials |
|---|---|---|---|---|---|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4829784 | T > C | SNP PASS | QUAL 162.79 DP 1289 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4829799 | G > A | SNP PASS | QUAL 354.42 DP 1284 · AF 0.023255814 129/129 called · 6 het |
6 carrier samples View listF1-105 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4829833 | A > G | SNP PASS | QUAL 841.05 DP 1229 · AF 0.042635659 129/129 called · 11 het |
11 carrier samples View listF1-10 0/1F1-112 0/1F1-116 0/1F1-118 0/1F1-120 0/1F1-130 0/1F1-136 0/1F1-138 0/1F1-49 0/1F1-92 0/1F1-94 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4829848 | C > G | SNP PASS | QUAL 430.31 DP 1228 · AF 0.027131783 129/129 called · 7 het |
7 carrier samples View listF1-105 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4829853 | T > C | SNP PASS | QUAL 9934.80 DP 1227 · AF 0.43023256 129/129 called · 55 het |
83 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 1/1F1-106 1/1F1-107 1/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 1/1F1-115 1/1F1-118 0/1F1-119 1/1F1-12 0/1F1-124 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-133 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-141 1/1F1-144 1/1F1-145 0/1F1-146 0/1F1-147 1/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-16 1/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-34 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-40 1/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-61 0/1F1-62 1/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-7 1/1F1-71 0/1F1-72 1/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 1/1F1-77 0/1F1-8 1/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-85 0/1F1-86 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1F1-99 0/1X5H 1/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4829881 | C > T | SNP PASS | QUAL 207.53 DP 1215 · AF 0.011627907 129/129 called · 3 het |
3 carrier samples View listF1-142 0/1F1-38 0/1F1-46 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4829934 | A > G | SNP PASS | QUAL 66.95 DP 1220 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4829948 | A > G | SNP PASS | QUAL 503.32 DP 1185 · AF 0.01171875 128/129 called · 3 het |
3 carrier samples View listF1-13 0/1F1-130 0/1F1-49 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4829981 | C > T | SNP PASS | QUAL 2752.02 DP 1208 · AF 0.09765625 128/129 called · 23 het |
24 carrier samples View listF1-118 0/1F1-119 0/1F1-139 0/1F1-146 0/1F1-19 0/1F1-2 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 0/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-71 1/1F1-85 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4829992 | T > G | SNP PASS | QUAL 1515.95 DP 1214 · AF 0.0546875 128/129 called · 12 het |
13 carrier samples View listF1-117 0/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-148 0/1F1-38 0/1F1-44 0/1F1-53 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-90 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830022 | A > T | SNP PASS | QUAL 596.91 DP 1160 · AF 0.03125 128/129 called · 8 het |
8 carrier samples View listF1-103 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830052 | G > C | SNP PASS | QUAL 2677.78 DP 1134 · AF 0.11627907 129/129 called · 26 het |
28 carrier samples View listF1-1 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-119 0/1F1-127 0/1F1-133 0/1F1-141 1/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-77 0/1F1-82 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830059 | T > A | SNP PASS | QUAL 697.04 DP 1162 · AF 0.034883721 129/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-101 0/1F1-113 0/1F1-116 0/1F1-123 0/1F1-126 0/1F1-139 0/1F1-5 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830072 | G > T | SNP PASS | QUAL 5836.97 DP 1163 · AF 0.24609375 128/129 called · 47 het |
55 carrier samples View list164L 0/1F1-10 1/1F1-101 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-116 1/1F1-117 0/1F1-12 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-126 0/1F1-127 0/1F1-13 0/1F1-130 0/1F1-132 1/1F1-134 0/1F1-139 0/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 0/1F1-49 1/1F1-5 1/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-76 1/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830073 | A > G | SNP PASS | QUAL 764.75 DP 1158 · AF 0.03875969 129/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-103 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830080 | A > T | SNP PASS | QUAL 833.76 DP 1174 · AF 0.03875969 129/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830113 | A > C | SNP PASS | QUAL 994.62 DP 1244 · AF 0.046511628 129/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830115 | A > T | SNP PASS | QUAL 389.25 DP 1251 · AF 0.019379845 129/129 called · 3 het |
4 carrier samples View listF1-53 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-85 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830121 | C > T | SNP PASS | QUAL 3709.28 DP 1253 · AF 0.15891473 129/129 called · 35 het |
38 carrier samples View list164L 0/1F1-10 1/1F1-101 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-113 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-12 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-126 0/1F1-132 0/1F1-139 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 1/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-76 1/1F1-84 0/1F1-9 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830128 | A > C | SNP PASS | QUAL 969.05 DP 1253 · AF 0.05078125 128/129 called · 13 het |
13 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830134 | T > C | SNP PASS | QUAL 33.11 DP 1277 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-85 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830142 | G > C | SNP PASS | QUAL 250.82 DP 1236 · AF 0.01171875 128/129 called · 3 het |
3 carrier samples View listF1-108 0/1F1-134 0/1F1-74 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830143 | T > C | SNP PASS | QUAL 903.89 DP 1238 · AF 0.03515625 128/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830146 | C > T | SNP PASS | QUAL 915.23 DP 1231 · AF 0.0390625 128/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830165 | C > A | SNP PASS | QUAL 861.62 DP 1232 · AF 0.047619048 126/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830168 | T > C | SNP PASS | QUAL 826.43 DP 1238 · AF 0.047619048 126/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830193 | A > C | SNP PASS | QUAL 527.34 DP 1259 · AF 0.043307087 127/129 called · 11 het |
11 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830196 | T > A | SNP PASS | QUAL 531.36 DP 1265 · AF 0.043307087 127/129 called · 11 het |
11 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830215 | C > T | SNP PASS | QUAL 189.28 DP 1247 · AF 0.0078740157 127/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-45 0/1F1-93 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830216 | C > T | SNP PASS | QUAL 2489.30 DP 1251 · AF 0.11417323 127/129 called · 27 het |
28 carrier samples View listF1-1 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-119 0/1F1-127 0/1F1-133 0/1F1-141 1/1F1-144 0/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-61 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830217 | C > A | SNP PASS | QUAL 2437.59 DP 1246 · AF 0.11417323 127/129 called · 27 het |
28 carrier samples View listF1-1 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-119 0/1F1-127 0/1F1-133 0/1F1-141 1/1F1-144 0/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-61 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830278 | T > C | SNP PASS | QUAL 160.38 DP 1173 · AF 0.003968254 126/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-127 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830282 | G > A | SNP PASS | QUAL 1028.87 DP 1170 · AF 0.046875 128/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830300 | T > C | SNP PASS | QUAL 1082.80 DP 1251 · AF 0.046511628 129/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830306 | A > G | SNP PASS | QUAL 1176.54 DP 1245 · AF 0.046511628 129/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830318 | G > A | SNP PASS | QUAL 1084.97 DP 1271 · AF 0.046511628 129/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830327 | A > T | SNP PASS | QUAL 1029.14 DP 1256 · AF 0.046875 128/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830431 | T > C | SNP PASS | QUAL 3964.00 DP 1165 · AF 0.19767442 129/129 called · 37 het |
44 carrier samples View listF1-1 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-112 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-127 1/1F1-130 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-141 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-21 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830434 | A > G | SNP PASS | QUAL 3417.30 DP 1181 · AF 0.17460317 126/129 called · 32 het |
38 carrier samples View listF1-105 0/1F1-107 0/1F1-112 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-127 1/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-141 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-21 0/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830439 | caattttt > c | INDEL PASS | QUAL 583.85 DP 1163 · AF 0.021551724 116/129 called · 5 het |
5 carrier samples View listF1-134 0/2F1-16 0/2F1-8 0/2F1-82 0/2F1-99 0/2
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830439 | caattttt > cTTTaattttt | INDEL PASS | QUAL 583.85 DP 1163 · AF 0.051724138 116/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-106 0/1F1-119 0/1F1-133 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-21 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-7 0/1F1-84 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830440 | A > T | SNP PASS | QUAL 1980.95 DP 1075 · AF 0.13306452 124/129 called · 25 het |
29 carrier samples View listF1-107 1/1F1-117 0/1F1-119 0/1F1-127 0/1F1-133 0/1F1-141 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 0/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-91 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830440 | a > aTTT | INDEL PASS | QUAL 5270.28 DP 1154 · AF 0.26229508 122/129 called · 50 het |
57 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-106 0/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/2F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-124 0/1F1-126 0/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-139 1/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-33 1/2F1-36 1/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-68 0/1F1-7 1/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 1/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-84 1/1F1-86 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830440 | a > aTTTC | INDEL PASS | QUAL 5270.28 DP 1154 · AF 0.0081967213 122/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-112 1/2F1-33 1/2
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830441 | A > C | SNP PASS | QUAL 8681.63 DP 1071 · AF 0.11290323 124/129 called · 26 het |
27 carrier samples View list164L 0/2F1-10 0/2F1-11 1/2F1-110 0/2F1-111 0/2F1-115 1/2F1-12 0/2F1-132 0/2F1-145 1/2F1-147 0/2F1-15 1/2F1-16 1/2F1-19 1/2F1-20 0/2F1-33 1/2F1-36 1/2F1-37 1/2F1-40 1/2F1-43 1/2F1-44 1/2F1-49 0/2F1-55 1/2F1-63 1/2F1-7 2/2F1-76 1/2F1-9 0/2F1-95 1/2
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830441 | A > T | SNP PASS | QUAL 8681.63 DP 1071 · AF 0.45564516 124/129 called · 53 het |
83 carrier samples View listF1-100 1/1F1-102 0/1F1-103 1/1F1-104 0/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-108 0/1F1-11 1/2F1-112 1/1F1-115 1/2F1-116 1/1F1-117 0/1F1-118 1/1F1-119 1/1F1-123 1/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-129 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-136 1/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-139 0/1F1-141 0/1F1-142 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-145 1/2F1-146 0/1F1-148 0/1F1-15 1/2F1-16 1/2F1-19 1/2F1-2 1/1F1-21 1/1F1-29 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 1/2F1-36 1/2F1-37 1/2F1-38 1/1F1-40 1/2F1-42 0/1F1-43 1/2F1-44 1/2F1-45 1/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-55 1/2F1-56 0/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 1/2F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-74 1/1F1-75 0/1F1-76 1/2F1-77 0/1F1-79 0/1F1-8 1/1F1-81 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 0/1F1-86 0/1F1-87 0/1F1-88 0/1F1-90 0/1F1-91 1/1F1-92 0/1F1-94 0/1F1-95 1/2F1-99 1/1X5H 1/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830442 | T > A | SNP PASS | QUAL 1533.86 DP 1133 · AF 0.06504065 123/129 called · 8 het |
12 carrier samples View listF1-101 0/1F1-105 1/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-125 1/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-79 0/1F1-92 0/1F1-96 0/1F1-98 1/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830443 | tt > tCt | INDEL PASS | QUAL 3259.80 DP 1189 · AF 0.22131148 122/129 called · 44 het |
49 carrier samples View listF1-101 0/1F1-102 0/1F1-108 0/1F1-11 1/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-123 0/1F1-126 0/1F1-134 0/1F1-139 1/1F1-146 0/1F1-16 0/1F1-19 1/1F1-2 1/1F1-29 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-5 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 0/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-71 0/1F1-74 0/1F1-76 0/1F1-81 0/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-87 0/1F1-88 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830444 | T > C | SNP PASS | QUAL 2965.66 DP 1130 · AF 0.14516129 124/129 called · 20 het |
28 carrier samples View listF1-100 1/1F1-103 1/1F1-112 0/1F1-116 0/1F1-118 1/1F1-119 0/1F1-129 0/1F1-131 1/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 1/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-142 0/1F1-145 0/1F1-15 0/1F1-42 0/1F1-5 0/1F1-74 0/1F1-79 0/1F1-81 0/1F1-87 0/1F1-88 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830448 | T > A | SNP PASS | QUAL 243.48 DP 1190 · AF 0.02 125/129 called · 5 het |
5 carrier samples View listF1-106 0/1F1-122 0/1F1-77 0/1F1-86 0/1F1-97 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830451 | T > G | SNP PASS | QUAL 466.18 DP 1185 · AF 0.031746032 126/129 called · 8 het |
8 carrier samples View listF1-105 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830469 | A > T | SNP PASS | QUAL 5398.36 DP 1183 · AF 0.2265625 128/129 called · 40 het |
49 carrier samples View listF1-1 0/1F1-103 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-112 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-127 1/1F1-130 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-21 1/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830474 | G > C | SNP PASS | QUAL 4539.87 DP 1175 · AF 0.21875 128/129 called · 42 het |
49 carrier samples View listF1-1 0/1F1-103 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-112 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-127 1/1F1-130 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-141 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-21 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830481 | C > G | SNP PASS | QUAL 1182.54 DP 1145 · AF 0.050387597 129/129 called · 13 het |
13 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830491 | G > A | SNP PASS | QUAL 711.49 DP 1170 · AF 0.034883721 129/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830492 | C > T | SNP PASS | QUAL 1013.38 DP 1178 · AF 0.046511628 129/129 called · 12 het |
12 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830497 | A > G | SNP PASS | QUAL 12638.80 DP 1166 · AF 0.49224806 129/129 called · 65 het |
96 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-118 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-122 0/1F1-123 1/1F1-124 1/1F1-129 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-136 1/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-139 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-144 1/1F1-145 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-15 1/1F1-16 1/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-29 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-42 0/1F1-43 1/1F1-44 1/1F1-46 0/1F1-48 1/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-7 1/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-76 1/1F1-77 0/1F1-8 1/1F1-80 0/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-99 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830507 | G > T | SNP PASS | QUAL 5328.50 DP 1184 · AF 0.22868217 129/129 called · 49 het |
54 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-103 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-124 0/1F1-129 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-142 0/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-15 1/1F1-16 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 0/1F1-5 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-81 0/1F1-84 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830534 | A > G | SNP PASS | QUAL 7734.61 DP 1208 · AF 0.31782946 129/129 called · 56 het |
69 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-103 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-118 0/1F1-12 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-129 0/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 1/1F1-136 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-145 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-15 1/1F1-16 1/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-33 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-46 0/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-76 1/1F1-77 0/1F1-79 0/1F1-8 1/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830550 | C > T | SNP PASS | QUAL 30.51 DP 1223 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-134 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830569 | A > T | SNP PASS | QUAL 11447.80 DP 1208 · AF 0.45348837 129/129 called · 53 het |
85 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-105 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-118 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-129 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-136 1/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-139 0/1F1-141 1/1F1-142 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-145 1/1F1-147 0/1F1-148 1/1F1-149 0/1F1-15 1/1F1-16 1/1F1-19 0/1F1-21 1/1F1-33 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 1/1F1-46 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-7 1/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-76 1/1F1-77 0/1F1-79 1/1F1-8 1/1F1-80 0/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-84 1/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 1/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830588 | A > G | SNP PASS | QUAL 393.96 DP 1197 · AF 0.042635659 129/129 called · 11 het |
11 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830595 | C > T | SNP PASS | QUAL 55.54 DP 1212 · AF 0.007751938 129/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-103 0/1F1-143 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830622 | C > T | SNP PASS | QUAL 58.80 DP 1157 · AF 0.0078125 128/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-102 0/1F1-81 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830685 | G > A | SNP PASS | QUAL 2891.68 DP 1134 · AF 0.10546875 128/129 called · 25 het |
26 carrier samples View listF1-1 0/1F1-107 0/1F1-133 0/1F1-140 0/1F1-141 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830695 | T > C | SNP PASS | QUAL 8126.83 DP 1121 · AF 0.3372093 129/129 called · 67 het |
77 carrier samples View listF1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-107 0/1F1-11 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-125 0/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 0/1F1-130 0/1F1-133 1/1F1-136 0/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-19 0/1F1-2 0/1F1-21 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 1/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-79 0/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-86 0/1F1-90 1/1F1-91 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1F1-99 0/1X5H 1/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830954 | atttttttt > attttttt | INDEL PASS | QUAL 9338.40 DP 967 · AF 0.59448819 127/129 called · 41 het |
96 carrier samples View list164L 1/1F1-1 1/1F1-10 1/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-104 1/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-109 1/1F1-11 1/1F1-110 1/1F1-111 1/1F1-112 1/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-118 1/1F1-119 0/1F1-12 1/1F1-123 0/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 0/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-136 0/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-144 1/1F1-145 1/1F1-146 1/1F1-147 1/1F1-148 0/1F1-149 1/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 1/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 1/1F1-34 1/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-43 1/1F1-44 1/1F1-46 0/1F1-48 1/1F1-49 1/1F1-5 0/1F1-51 1/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-58 0/1F1-6 1/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-63 1/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 1/1F1-68 1/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-73 1/1F1-75 0/1F1-76 1/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-8 1/1F1-80 1/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-89 1/1F1-9 1/1F1-90 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 1/1F1-96 0/1X5H 1/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830961 | T > A | SNP PASS | QUAL 899.26 DP 979 · AF 0.044354839 124/129 called · 5 het |
8 carrier samples View listF1-107 0/1F1-131 1/1F1-135 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-16 0/1F1-87 0/1F1-88 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4830981 | C > G | SNP PASS | QUAL 2641.47 DP 975 · AF 0.12790698 129/129 called · 23 het |
28 carrier samples View listF1-100 0/1F1-101 0/1F1-103 0/1F1-107 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-117 0/1F1-131 1/1F1-135 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-45 0/1F1-53 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-87 0/1F1-88 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831119 | A > T | SNP PASS | QUAL 8607.38 DP 975 · AF 0.41338583 127/129 called · 57 het |
81 carrier samples View list164L 0/1F1-10 1/1F1-102 0/1F1-103 1/1F1-108 0/1F1-109 0/1F1-110 0/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-123 1/1F1-124 0/1F1-125 0/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-13 0/1F1-130 1/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-134 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-149 1/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 0/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 1/1F1-5 1/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 1/1F1-73 0/1F1-74 1/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 1/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-9 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831135 | T > A | SNP PASS | QUAL 744.86 DP 969 · AF 0.0390625 128/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-109 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-149 0/1F1-73 0/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-96 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831136 | A > G | SNP PASS | QUAL 1739.20 DP 973 · AF 0.0859375 128/129 called · 20 het |
21 carrier samples View listF1-102 0/1F1-103 1/1F1-109 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-119 0/1F1-124 0/1F1-125 0/1F1-127 0/1F1-133 0/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-149 0/1F1-73 0/1F1-81 0/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831171 | T > C | SNP PASS | QUAL 171.88 DP 967 · AF 0.007751938 129/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-149 0/1F1-80 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831178 | A > T | SNP PASS | QUAL 41.07 DP 974 · AF 0.003968254 126/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831178 | a > aTTT | INDEL PASS | QUAL 7161.06 DP 974 · AF 0.10162602 123/129 called · 23 het |
24 carrier samples View listF1-10 1/2F1-102 0/2F1-108 0/2F1-111 1/2F1-112 1/2F1-114 0/2F1-116 0/2F1-12 1/2F1-126 0/2F1-127 0/2F1-128 0/2F1-130 1/2F1-134 0/2F1-139 1/2F1-140 0/2F1-48 0/2F1-5 1/2F1-58 0/2F1-78 1/2F1-80 2/2F1-81 1/2F1-82 0/2F1-85 1/2F1-89 1/2
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831178 | a > aTTTT | INDEL PASS | QUAL 7161.06 DP 974 · AF 0.20731707 123/129 called · 39 het |
45 carrier samples View list164L 0/1F1-10 1/2F1-109 0/1F1-11 0/1F1-110 1/1F1-111 1/2F1-112 1/2F1-113 0/1F1-115 0/1F1-12 1/2F1-13 0/1F1-130 1/2F1-132 1/1F1-139 1/2F1-145 0/1F1-147 0/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-19 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-49 0/1F1-5 1/2F1-53 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 1/1F1-73 0/1F1-74 0/1F1-76 0/1F1-78 1/2F1-81 1/2F1-83 0/1F1-84 1/1F1-85 1/2F1-88 0/1F1-89 1/2F1-9 1/1F1-91 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831179 | A > T | SNP PASS | QUAL 7688.57 DP 968 · AF 0.48015873 126/129 called · 47 het |
84 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 1/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-105 1/1F1-106 1/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 1/1F1-118 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 1/1F1-121 1/1F1-122 1/1F1-123 1/1F1-124 0/1F1-125 0/1F1-126 1/1F1-127 0/1F1-128 1/1F1-13 0/1F1-130 1/1F1-132 1/1F1-136 0/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-140 0/1F1-145 1/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 1/1F1-15 0/1F1-21 1/1F1-33 1/1F1-36 1/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 1/1F1-46 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-58 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 1/1F1-73 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-79 0/1F1-8 1/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 1/1F1-86 1/1F1-89 0/1F1-9 1/1F1-91 0/1F1-92 1/1F1-94 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1F1-98 1/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831179 | atttttttttt > aTTTtttttttttt | INDEL PASS | QUAL 6459.46 DP 968 · AF 0.265625 128/129 called · 44 het |
56 carrier samples View list164L 1/2F1-10 0/1F1-102 1/2F1-103 0/1F1-108 0/1F1-109 0/1F1-11 0/1F1-110 1/2F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 1/1F1-114 0/1F1-115 1/2F1-116 0/1F1-12 0/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-13 1/1F1-130 1/1F1-132 1/1F1-134 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-143 0/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 1/2F1-43 0/1F1-44 0/1F1-45 1/2F1-48 0/1F1-49 1/1F1-5 1/1F1-55 0/1F1-58 1/2F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 1/1F1-73 1/2F1-76 0/1F1-78 1/2F1-80 1/2F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-84 1/2F1-85 1/1F1-88 0/1F1-89 1/2F1-9 1/1F1-91 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831179 | atttttttttt > aTtttttttttt | INDEL PASS | QUAL 6459.46 DP 968 · AF 0.21875 128/129 called · 42 het |
49 carrier samples View list164L 1/2F1-1 0/2F1-100 0/2F1-102 1/2F1-104 2/2F1-107 0/2F1-110 1/2F1-115 1/2F1-118 0/2F1-119 0/2F1-120 0/2F1-129 0/2F1-146 0/2F1-148 0/2F1-149 0/2F1-18 2/2F1-2 0/2F1-20 2/2F1-26 2/2F1-30 0/2F1-32 0/2F1-34 2/2F1-38 0/2F1-40 1/2F1-41 0/2F1-42 0/2F1-45 1/2F1-46 0/2F1-51 0/2F1-58 1/2F1-6 0/2F1-61 0/2F1-62 0/2F1-64 0/2F1-65 0/2F1-66 0/2F1-68 0/2F1-73 1/2F1-74 0/2F1-75 0/2F1-78 1/2F1-80 1/2F1-84 1/2F1-87 0/2F1-89 1/2F1-90 2/2F1-93 0/2F1-95 2/2F1-98 0/2
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831222 | G > A | SNP PASS | QUAL 8491.05 DP 1065 · AF 0.36046512 129/129 called · 43 het |
68 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-100 1/1F1-101 0/1F1-104 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-129 0/1F1-13 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-141 1/1F1-144 1/1F1-146 1/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-18 1/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-26 0/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-44 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 1/1F1-58 0/1F1-6 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 0/1F1-68 1/1F1-71 1/1F1-73 0/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-82 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 0/1F1-95 1/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831264 | A > G | SNP PASS | QUAL 17478.80 DP 1055 · AF 0.32945736 129/129 called · 43 het |
64 carrier samples View list164L 1/2F1-10 1/2F1-100 2/2F1-101 2/2F1-107 2/2F1-108 1/2F1-11 2/2F1-110 1/2F1-111 1/2F1-112 0/2F1-114 1/2F1-115 2/2F1-119 0/2F1-12 1/2F1-131 2/2F1-132 2/2F1-133 1/2F1-135 2/2F1-137 2/2F1-141 2/2F1-143 1/2F1-144 2/2F1-146 1/2F1-147 1/2F1-15 0/2F1-16 1/2F1-19 2/2F1-2 1/2F1-21 0/2F1-29 1/2F1-30 1/2F1-31 2/2F1-32 1/2F1-33 2/2F1-36 0/2F1-37 0/2F1-40 0/2F1-41 1/2F1-42 1/2F1-43 0/2F1-44 2/2F1-49 1/2F1-53 1/2F1-55 2/2F1-56 1/2F1-6 1/2F1-63 2/2F1-65 1/2F1-68 2/2F1-71 1/2F1-72 1/2F1-74 1/2F1-75 1/2F1-76 2/2F1-8 0/2F1-82 1/2F1-84 1/2F1-87 2/2F1-88 1/2F1-9 1/2F1-90 1/2F1-95 2/2F1-99 0/2X5H 0/2
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831264 | A > T | SNP PASS | QUAL 17478.80 DP 1055 · AF 0.42635659 129/129 called · 58 het |
84 carrier samples View list164L 1/2F1-1 0/1F1-10 1/2F1-102 1/1F1-104 0/1F1-108 1/2F1-109 1/1F1-110 1/2F1-111 1/2F1-113 1/1F1-114 1/2F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-12 1/2F1-124 0/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 1/1F1-133 1/2F1-134 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 1/2F1-145 0/1F1-146 1/2F1-147 1/2F1-148 0/1F1-149 1/1F1-16 1/2F1-18 1/1F1-2 1/2F1-20 1/1F1-26 1/1F1-29 1/2F1-30 1/2F1-32 1/2F1-34 0/1F1-38 0/1F1-41 1/2F1-42 1/2F1-45 1/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 1/2F1-5 1/1F1-51 0/1F1-53 1/2F1-56 1/2F1-58 1/1F1-6 1/2F1-61 1/1F1-62 0/1F1-64 1/1F1-65 1/2F1-66 0/1F1-71 1/2F1-72 1/2F1-73 1/1F1-74 1/2F1-75 1/2F1-78 1/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 1/2F1-83 1/1F1-84 1/2F1-85 1/1F1-88 1/2F1-89 1/1F1-9 1/2F1-90 1/2F1-91 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1F1-98 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831267 | G > A | SNP PASS | QUAL 17838.20 DP 1054 · AF 0.76356589 129/129 called · 37 het |
117 carrier samples View list164L 1/1F1-1 0/1F1-10 1/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-102 1/1F1-104 0/1F1-107 1/1F1-108 1/1F1-109 1/1F1-11 1/1F1-110 1/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 1/1F1-114 1/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 1/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 1/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 1/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-143 1/1F1-144 1/1F1-145 0/1F1-146 1/1F1-147 1/1F1-148 0/1F1-149 1/1F1-15 0/1F1-16 1/1F1-18 1/1F1-19 1/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-21 0/1F1-26 1/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 1/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-43 0/1F1-44 1/1F1-45 1/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 1/1F1-5 1/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-55 1/1F1-56 1/1F1-58 1/1F1-6 1/1F1-61 1/1F1-62 0/1F1-63 1/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 0/1F1-68 1/1F1-71 1/1F1-72 1/1F1-73 1/1F1-74 1/1F1-75 1/1F1-76 1/1F1-78 1/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 1/1F1-90 1/1F1-91 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-96 1/1F1-97 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831300 | G > A | SNP PASS | QUAL 86.13 DP 1096 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-74 0/2
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831300 | G > T | SNP PASS | QUAL 86.13 DP 1096 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-68 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831310 | G > A | SNP PASS | QUAL 9964.08 DP 1072 · AF 0.41796875 128/129 called · 55 het |
81 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-108 0/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-119 1/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-124 1/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-21 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 1/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-36 0/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-44 1/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 1/1F1-79 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-92 1/1F1-95 1/1F1-96 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831319 | G > A | SNP PASS | QUAL 9704.79 DP 1058 · AF 0.42578125 128/129 called · 55 het |
82 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-108 0/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-124 1/1F1-125 1/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-21 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 1/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-44 1/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 1/1F1-79 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-92 1/1F1-95 1/1F1-96 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831400 | G > A | SNP PASS | QUAL 38.66 DP 1066 · AF 0.0039370079 127/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listX5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831566 | T > C | SNP PASS | QUAL 92.20 DP 1142 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-140 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831586 | C > T | SNP PASS | QUAL 7509.94 DP 1126 · AF 0.30078125 128/129 called · 43 het |
60 carrier samples View listF1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 1/1F1-102 0/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-11 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-119 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-123 1/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-13 0/1F1-130 1/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-44 0/1F1-49 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 0/1F1-64 1/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-71 0/1F1-76 0/1F1-79 0/1F1-81 0/1F1-82 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-90 0/1F1-92 0/1F1-95 1/1F1-99 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831618 | T > A | SNP PASS | QUAL 8370.56 DP 1080 · AF 0.34496124 129/129 called · 45 het |
67 carrier samples View listF1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 1/1F1-102 1/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-11 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-116 0/1F1-119 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-123 1/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-13 0/1F1-130 1/1F1-131 1/1F1-133 1/1F1-134 0/1F1-135 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 1/1F1-64 1/1F1-65 0/1F1-68 1/1F1-71 0/1F1-76 0/1F1-79 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-90 0/1F1-92 0/1F1-95 1/1F1-97 0/1F1-98 0/1F1-99 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831622 | C > A | SNP PASS | QUAL 7731.23 DP 1073 · AF 0.328125 128/129 called · 58 het |
71 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-100 0/1F1-103 0/1F1-104 0/1F1-106 0/1F1-109 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-115 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-122 0/1F1-124 0/1F1-127 0/1F1-129 0/1F1-13 0/1F1-132 0/1F1-139 0/1F1-140 0/1F1-142 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-18 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 1/1F1-36 0/1F1-37 1/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 1/1F1-48 0/1F1-51 1/1F1-56 0/1F1-58 0/1F1-6 0/1F1-61 1/1F1-62 0/1F1-65 0/1F1-66 1/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-73 1/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-84 0/1F1-86 0/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831630 | A > G | SNP PASS | QUAL 30.14 DP 1062 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-144 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831644 | C > G | SNP PASS | QUAL 43.14 DP 1048 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831647 | C > T | SNP PASS | QUAL 43.12 DP 1035 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831689 | G > A | SNP PASS | QUAL 135.92 DP 1056 · AF 0.01171875 128/129 called · 3 het |
3 carrier samples View listF1-142 0/1F1-38 0/1F1-84 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831693 | A > G | SNP PASS | QUAL 40.85 DP 1074 · AF 0.0078125 128/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-146 0/1F1-83 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831717 | C > T | SNP PASS | QUAL 4124.00 DP 1060 · AF 0.20155039 129/129 called · 42 het |
47 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-103 0/1F1-104 0/1F1-109 0/1F1-110 1/1F1-111 0/1F1-118 0/1F1-12 0/1F1-124 0/1F1-127 0/1F1-129 1/1F1-13 0/1F1-132 0/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-146 0/1F1-149 0/1F1-18 0/1F1-19 0/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-26 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 0/1F1-38 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-51 0/1F1-56 0/1F1-58 0/1F1-6 0/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-71 1/1F1-73 1/1F1-75 0/1F1-78 0/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-93 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831718 | T > A | SNP PASS | QUAL 8161.62 DP 1049 · AF 0.20155039 129/129 called · 42 het |
47 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-103 0/1F1-104 0/1F1-109 0/1F1-110 1/1F1-111 0/1F1-118 1/2F1-12 0/1F1-124 0/1F1-127 1/2F1-129 1/1F1-13 0/1F1-132 0/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-146 0/1F1-149 1/2F1-18 1/2F1-19 0/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-26 1/2F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 0/1F1-38 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-51 0/1F1-56 0/1F1-58 1/2F1-6 0/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-71 1/1F1-73 1/1F1-75 0/1F1-78 1/2F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-93 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831718 | T > G | SNP PASS | QUAL 8161.62 DP 1049 · AF 0.15891473 129/129 called · 25 het |
33 carrier samples View listF1-108 2/2F1-112 0/2F1-113 0/2F1-114 0/2F1-116 0/2F1-117 2/2F1-118 1/2F1-120 0/2F1-127 1/2F1-128 2/2F1-134 0/2F1-136 0/2F1-138 0/2F1-143 2/2F1-145 2/2F1-148 0/2F1-149 1/2F1-16 0/2F1-18 1/2F1-26 1/2F1-53 0/2F1-58 1/2F1-72 0/2F1-78 1/2F1-81 0/2F1-82 0/2F1-83 2/2F1-84 0/2F1-85 2/2F1-91 0/2F1-92 0/2F1-94 2/2F1-96 0/2
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831734 | T > G | SNP PASS | QUAL 9313.92 DP 1073 · AF 0.38372093 129/129 called · 59 het |
79 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-103 0/1F1-104 0/1F1-106 0/1F1-108 1/1F1-109 1/1F1-110 1/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 1/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-122 0/1F1-124 1/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-129 1/1F1-13 0/1F1-132 0/1F1-134 0/1F1-136 0/1F1-138 0/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 1/1F1-16 0/1F1-18 1/1F1-19 0/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-26 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 0/1F1-38 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-56 0/1F1-58 1/1F1-6 0/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-73 1/1F1-75 0/1F1-77 0/1F1-78 1/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 1/1F1-96 0/1F1-97 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831769 | G > A | SNP PASS | QUAL 212.23 DP 1048 · AF 0.011627907 129/129 called · 3 het |
3 carrier samples View listF1-127 0/1F1-94 0/1F1-96 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831802 | A > G | SNP PASS | QUAL 6567.17 DP 1066 · AF 0.31395349 129/129 called · 55 het |
68 carrier samples View list164L 1/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-103 0/1F1-104 0/1F1-109 1/1F1-11 0/1F1-110 1/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-115 0/1F1-118 0/1F1-12 1/1F1-124 0/1F1-127 0/1F1-129 1/1F1-13 0/1F1-132 1/1F1-142 0/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-18 0/1F1-19 0/1F1-2 0/1F1-20 1/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-58 1/1F1-6 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-64 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-73 1/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-84 0/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-9 1/1F1-93 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831830 | T > A | SNP PASS | QUAL 66.00 DP 1066 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831841 | A > T | SNP PASS | QUAL 2489.21 DP 1071 · AF 0.12992126 127/129 called · 31 het |
32 carrier samples View list164L 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-115 0/1F1-12 0/1F1-132 1/1F1-139 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-84 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831842 | T > A | SNP PASS | QUAL 3255.30 DP 1066 · AF 0.1496063 127/129 called · 28 het |
33 carrier samples View listF1-100 0/1F1-108 1/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-120 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-136 0/1F1-138 0/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-26 0/1F1-45 0/1F1-53 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-78 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831865 | TA > TAA | INDEL PASS | QUAL 3600.76 DP 1112 · AF 0.23643411 129/129 called · 39 het |
50 carrier samples View listF1-100 0/1F1-108 1/1F1-11 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-115 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-12 0/1F1-120 1/1F1-132 1/1F1-136 0/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-20 0/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 1/1F1-75 1/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831870 | T > A | SNP PASS | QUAL 3330.34 DP 1093 · AF 0.23412698 126/129 called · 39 het |
49 carrier samples View list164L 0/1F1-108 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-12 0/1F1-120 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-48 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 1/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-80 1/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-9 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831879 | T > G | SNP PASS | QUAL 3437.63 DP 1105 · AF 0.15891473 129/129 called · 29 het |
35 carrier samples View listF1-100 0/1F1-108 1/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-120 1/1F1-128 0/1F1-136 0/1F1-138 0/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-26 0/1F1-53 0/1F1-58 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-78 0/1F1-80 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-85 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831909 | G > C | SNP PASS | QUAL 6932.41 DP 1082 · AF 0.31007752 129/129 called · 46 het |
63 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-106 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-115 0/1F1-119 1/1F1-12 0/1F1-125 0/1F1-130 1/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-55 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 1/1F1-80 0/1F1-84 1/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-9 0/1F1-90 1/1F1-95 0/1F1-97 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831916 | T > A | SNP PASS | QUAL 92.03 DP 1106 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831917 | A > G | SNP PASS | QUAL 3550.26 DP 1106 · AF 0.1484375 128/129 called · 36 het |
37 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-104 0/1F1-109 0/1F1-110 0/1F1-12 0/1F1-129 0/1F1-146 0/1F1-147 1/1F1-18 0/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-26 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-45 0/1F1-51 0/1F1-56 0/1F1-58 0/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-64 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-71 0/1F1-73 0/1F1-75 0/1F1-89 0/1F1-9 0/1F1-94 0/1F1-96 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831918 | G > T | SNP PASS | QUAL 92.03 DP 1107 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831931 | G > A | SNP PASS | QUAL 10746.10 DP 1117 · AF 0.47637795 127/129 called · 55 het |
88 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-102 0/1F1-106 0/1F1-108 1/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-119 1/1F1-12 0/1F1-120 1/1F1-125 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 1/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-139 0/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-148 1/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 0/1F1-20 1/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 1/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-77 1/1F1-78 0/1F1-8 1/1F1-80 1/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-90 1/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-97 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831940 | A > C | SNP PASS | QUAL 65.04 DP 1140 · AF 0.0039370079 127/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831966 | T > G | SNP PASS | QUAL 59.03 DP 1133 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4831977 | G > A | SNP PASS | QUAL 59.04 DP 1138 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832105 | T > A | SNP PASS | QUAL 6139.68 DP 1040 · AF 0.28174603 126/129 called · 51 het |
61 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-108 1/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-132 0/1F1-134 0/1F1-136 0/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 0/1F1-20 1/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-53 1/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 1/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-80 0/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-85 1/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832191 | A > C | SNP PASS | QUAL 899.60 DP 896 · AF 0.056 125/129 called · 12 het |
13 carrier samples View listF1-114 0/1F1-117 0/1F1-127 0/1F1-143 1/1F1-18 0/1F1-26 0/1F1-53 0/1F1-58 0/1F1-78 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-85 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832198 | G > C | SNP PASS | QUAL 3636.38 DP 888 · AF 0.23790323 124/129 called · 43 het |
51 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-107 0/1F1-108 1/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-127 0/1F1-132 0/1F1-134 0/1F1-136 0/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-15 0/1F1-18 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-49 1/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-58 0/1F1-63 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832200 | A > G | SNP PASS | QUAL 1724.26 DP 887 · AF 0.071428571 126/129 called · 18 het |
18 carrier samples View listF1-1 0/1F1-106 0/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832230 | T > C | SNP PASS | QUAL 989.56 DP 839 · AF 0.080645161 124/129 called · 16 het |
18 carrier samples View listF1-102 0/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-120 0/1F1-127 0/1F1-134 0/1F1-136 0/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-26 0/1F1-53 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-85 0/1F1-92 0/1F1-94 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832233 | C > T | SNP PASS | QUAL 101.46 DP 825 · AF 0.0080645161 124/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-45 0/1F1-80 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832248 | A > C | SNP PASS | QUAL 3069.45 DP 803 · AF 0.14919355 124/129 called · 31 het |
34 carrier samples View listF1-1 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-106 0/1F1-119 0/1F1-125 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-80 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-90 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832256 | A > T | SNP PASS | QUAL 910.18 DP 831 · AF 0.082644628 121/129 called · 20 het |
20 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-115 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-20 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-48 0/1F1-5 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-72 0/1F1-8 0/1F1-84 0/1F1-9 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832258 | A > T | SNP PASS | QUAL 7644.64 DP 809 · AF 0.40833333 120/129 called · 56 het |
77 carrier samples View list164L 0/1F1-1 1/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-104 0/1F1-106 0/1F1-109 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 1/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-127 0/1F1-129 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-139 0/1F1-142 0/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-18 0/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 1/1F1-36 1/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 1/1F1-48 0/1F1-5 0/1F1-51 1/1F1-58 0/1F1-6 0/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-65 0/1F1-66 1/1F1-7 1/1F1-71 0/1F1-73 1/1F1-75 0/1F1-78 0/1F1-80 0/1F1-84 0/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1F1-98 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832259 | T > A | SNP PASS | QUAL 7584.57 DP 816 · AF 0.40082645 121/129 called · 55 het |
76 carrier samples View list164L 0/1F1-1 1/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-104 0/1F1-106 0/1F1-109 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 1/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-127 0/1F1-129 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-139 0/1F1-142 0/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-18 0/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 1/1F1-36 1/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 1/1F1-48 0/1F1-5 0/1F1-51 1/1F1-58 0/1F1-6 0/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-65 0/1F1-66 1/1F1-7 1/1F1-71 0/1F1-73 1/1F1-75 0/1F1-78 0/1F1-80 0/1F1-84 0/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1F1-98 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832266 | G > T | SNP PASS | QUAL 618.59 DP 843 · AF 0.028455285 123/129 called · 5 het |
6 carrier samples View listF1-109 1/1F1-111 0/1F1-132 0/1F1-149 0/1F1-89 0/1F1-93 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832366 | T > A | SNP PASS | QUAL 109.12 DP 954 · AF 0.0040322581 124/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-80 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832417 | C > T | SNP PASS | QUAL 3294.75 DP 903 · AF 0.16666667 126/129 called · 28 het |
35 carrier samples View listF1-1 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-106 0/1F1-117 0/1F1-119 1/1F1-125 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-21 1/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-80 1/1F1-86 0/1F1-87 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832420 | TTATAT > TTATATAT | INDEL PASS | QUAL 5184.65 DP 897 · AF 0.20866142 127/129 called · 41 het |
47 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-102 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-136 0/1F1-138 0/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-18 0/1F1-19 0/1F1-26 0/1F1-33 1/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-85 1/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832436 | A > G | SNP PASS | QUAL 151.14 DP 915 · AF 0.015873016 126/129 called · 4 het |
4 carrier samples View listF1-117 0/1F1-119 0/1F1-149 0/1F1-80 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832498 | T > G | SNP PASS | QUAL 4065.26 DP 928 · AF 0.236 125/129 called · 49 het |
54 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-111 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-12 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-134 0/1F1-136 0/1F1-138 0/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-49 0/1F1-53 0/1F1-58 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-81 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832508 | G > A | SNP PASS | QUAL 4033.03 DP 939 · AF 0.15354331 127/129 called · 29 het |
34 carrier samples View listF1-1 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-106 0/1F1-117 0/1F1-119 1/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-87 0/1F1-88 0/1F1-90 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832520 | T > G | SNP PASS | QUAL 195.25 DP 950 · AF 0.015748031 127/129 called · 4 het |
4 carrier samples View listF1-117 0/1F1-119 0/1F1-149 0/1F1-80 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832523 | C > T | SNP PASS | QUAL 1809.14 DP 945 · AF 0.098425197 127/129 called · 25 het |
25 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-11 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-115 0/1F1-12 0/1F1-132 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-84 0/1F1-9 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832528 | T > A | SNP PASS | QUAL 3771.34 DP 959 · AF 0.14566929 127/129 called · 29 het |
33 carrier samples View listF1-1 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-106 0/1F1-119 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-77 1/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-87 0/1F1-88 0/1F1-90 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832605 | G > T | SNP PASS | QUAL 1532.12 DP 954 · AF 0.11666667 120/129 called · 24 het |
26 carrier samples View listF1-100 0/1F1-106 0/1F1-119 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-138 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-51 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-8 0/1F1-86 0/1F1-88 0/1F1-90 0/1F1-97 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832607 | A > T | SNP PASS | QUAL 5112.58 DP 953 · AF 0.3907563 119/129 called · 55 het |
74 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-106 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-138 1/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-147 0/1F1-148 1/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-37 1/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-46 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-62 0/1F1-63 1/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-8 1/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832608 | T > TA | INDEL PASS | QUAL 6941.30 DP 958 · AF 0.43650794 126/129 called · 50 het |
80 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-102 1/1F1-106 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 1/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-12 1/1F1-120 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-147 0/1F1-148 1/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 1/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-37 1/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-62 0/1F1-63 1/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-76 0/1F1-77 1/1F1-78 0/1F1-8 1/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-87 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-95 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832629 | A > T | SNP PASS | QUAL 6161.65 DP 1009 · AF 0.288 125/129 called · 50 het |
61 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-12 1/1F1-120 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-136 0/1F1-143 0/1F1-145 1/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 1/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-49 1/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-63 1/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 1/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832659 | T > C | SNP PASS | QUAL 9846.21 DP 1032 · AF 0.46062992 127/129 called · 51 het |
84 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-102 1/1F1-106 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 1/1F1-117 1/1F1-118 1/1F1-119 1/1F1-12 0/1F1-120 1/1F1-125 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-147 0/1F1-148 1/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 1/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 1/1F1-45 1/1F1-46 0/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-58 1/1F1-62 0/1F1-63 1/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 1/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-8 1/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-86 0/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832676 | A > T | SNP PASS | QUAL 185.08 DP 1055 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-119 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832766 | G > A | SNP PASS | QUAL 6741.91 DP 1204 · AF 0.27131783 129/129 called · 50 het |
60 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-108 0/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 1/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-134 0/1F1-136 0/1F1-138 0/1F1-143 1/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 1/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-63 0/1F1-7 1/1F1-72 1/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-85 0/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832785 | A > T | SNP PASS | QUAL 3400.34 DP 1202 · AF 0.1627907 129/129 called · 34 het |
38 carrier samples View listF1-1 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-106 0/1F1-117 0/1F1-119 1/1F1-125 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-74 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-86 0/1F1-87 0/1F1-88 0/1F1-90 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832815 | ATTT > ATT | INDEL PASS | QUAL 5636.00 DP 1179 · AF 0.39453125 128/129 called · 51 het |
76 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-102 1/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 1/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-125 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-147 0/1F1-148 1/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 1/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 1/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-85 0/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-94 0/1F1-95 1/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832849 | GTTTTTTT > GTTTTTT | INDEL PASS | QUAL 3507.21 DP 1237 · AF 0.3515625 128/129 called · 46 het |
68 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 1/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-120 0/1F1-125 0/1F1-130 0/1F1-131 0/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 0/1F1-138 1/1F1-143 1/1F1-145 1/1F1-147 0/1F1-148 1/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-63 0/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 1/1F1-74 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-95 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832875 | A > G | SNP PASS | QUAL 1544.60 DP 1258 · AF 0.10465116 129/129 called · 25 het |
26 carrier samples View listF1-108 0/1F1-112 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-136 0/1F1-138 0/1F1-143 0/1F1-145 0/1F1-148 0/1F1-26 0/1F1-58 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-78 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-85 1/1F1-91 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832881 | T > C | SNP PASS | QUAL 45.35 DP 1264 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-110 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832893 | C > G | SNP PASS | QUAL 9526.54 DP 1089 · AF 0.4140625 128/129 called · 52 het |
79 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-102 1/1F1-106 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-125 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-143 1/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-148 1/1F1-15 0/1F1-18 1/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-34 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 1/1F1-51 0/1F1-58 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 1/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 1/1F1-74 1/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-8 1/1F1-80 0/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-97 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832911 | T > A | SNP PASS | QUAL 9254.37 DP 1053 · AF 0.41015625 128/129 called · 55 het |
80 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-102 1/1F1-106 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-125 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-143 1/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-148 1/1F1-15 0/1F1-18 0/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-34 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 1/1F1-51 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 1/1F1-74 1/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-8 1/1F1-80 0/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-97 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 OH1004 · Chr01:4829778-4832930 | Chr01:4832912 | G > A | SNP PASS | QUAL 9624.64 DP 1059 · AF 0.42578125 128/129 called · 53 het |
81 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-102 1/1F1-106 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-111 0/1F1-112 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-119 1/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-125 0/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-130 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-143 1/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-148 1/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-18 0/1F1-20 0/1F1-21 1/1F1-26 0/1F1-34 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-45 1/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 1/1F1-51 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 1/1F1-74 1/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-8 1/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-97 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738654 | G > T | SNP PASS | QUAL 7722.13 DP 1069 · AF 0.34108527 129/129 called · 56 het |
72 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-100 0/1F1-103 0/1F1-104 0/1F1-106 0/1F1-109 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-115 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-122 0/1F1-124 0/1F1-127 0/1F1-129 0/1F1-13 0/1F1-132 0/1F1-139 0/1F1-140 0/1F1-142 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-18 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 1/1F1-36 0/1F1-37 1/1F1-38 1/1F1-40 1/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 1/1F1-48 0/1F1-51 1/1F1-56 0/1F1-58 0/1F1-6 0/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-65 0/1F1-66 1/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-73 1/1F1-74 1/1F1-75 1/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-84 0/1F1-86 0/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-96 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738658 | A > T | SNP PASS | QUAL 8154.96 DP 1078 · AF 0.34496124 129/129 called · 45 het |
67 carrier samples View listF1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 1/1F1-102 1/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-11 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-116 0/1F1-119 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-123 1/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-13 0/1F1-130 1/1F1-131 1/1F1-133 1/1F1-134 0/1F1-135 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 1/1F1-64 1/1F1-65 0/1F1-68 1/1F1-71 0/1F1-76 0/1F1-79 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-90 0/1F1-92 0/1F1-95 1/1F1-97 0/1F1-98 0/1F1-99 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738690 | G > A | SNP PASS | QUAL 7715.82 DP 1124 · AF 0.30232558 129/129 called · 44 het |
61 carrier samples View listF1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 1/1F1-102 0/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-11 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-119 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-123 1/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-13 0/1F1-130 1/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-44 0/1F1-49 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 0/1F1-64 1/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-71 0/1F1-76 0/1F1-79 0/1F1-81 0/1F1-82 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-90 0/1F1-92 0/1F1-95 1/1F1-99 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738710 | A > G | SNP PASS | QUAL 76.20 DP 1142 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-140 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738876 | C > T | SNP PASS | QUAL 38.66 DP 1066 · AF 0.0039370079 127/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listX5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738957 | C > T | SNP PASS | QUAL 9884.26 DP 1059 · AF 0.42578125 128/129 called · 55 het |
82 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-108 0/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-124 1/1F1-125 1/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-21 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 1/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-44 1/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 1/1F1-79 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-92 1/1F1-95 1/1F1-96 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738966 | C > T | SNP PASS | QUAL 10254.50 DP 1073 · AF 0.41796875 128/129 called · 55 het |
81 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-107 1/1F1-108 0/1F1-11 1/1F1-110 0/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-119 1/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-124 1/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-141 1/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-21 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 1/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-36 0/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-44 1/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 1/1F1-79 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-86 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-92 1/1F1-95 1/1F1-96 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738976 | C > A | SNP PASS | QUAL 74.03 DP 1098 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-68 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157738976 | C > T | SNP PASS | QUAL 74.03 DP 1098 · AF 0.00390625 128/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-74 0/2
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739009 | C > T | SNP PASS | QUAL 17609.90 DP 1056 · AF 0.76356589 129/129 called · 37 het |
117 carrier samples View list164L 1/1F1-1 0/1F1-10 1/1F1-100 1/1F1-101 1/1F1-102 1/1F1-104 0/1F1-107 1/1F1-108 1/1F1-109 1/1F1-11 1/1F1-110 1/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 1/1F1-114 1/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 1/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 1/1F1-131 1/1F1-132 1/1F1-133 1/1F1-134 1/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-143 1/1F1-144 1/1F1-145 0/1F1-146 1/1F1-147 1/1F1-148 0/1F1-149 1/1F1-15 0/1F1-16 1/1F1-18 1/1F1-19 1/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-21 0/1F1-26 1/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 1/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-43 0/1F1-44 1/1F1-45 1/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 1/1F1-5 1/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-55 1/1F1-56 1/1F1-58 1/1F1-6 1/1F1-61 1/1F1-62 0/1F1-63 1/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 0/1F1-68 1/1F1-71 1/1F1-72 1/1F1-73 1/1F1-74 1/1F1-75 1/1F1-76 1/1F1-78 1/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 1/1F1-87 1/1F1-88 1/1F1-89 1/1F1-9 1/1F1-90 1/1F1-91 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 1/1F1-96 1/1F1-97 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739012 | T > A | SNP PASS | QUAL 17394.30 DP 1057 · AF 0.42635659 129/129 called · 58 het |
84 carrier samples View list164L 1/2F1-1 0/1F1-10 1/2F1-102 1/1F1-104 0/1F1-108 1/2F1-109 1/1F1-110 1/2F1-111 1/2F1-113 1/1F1-114 1/2F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-12 1/2F1-124 0/1F1-125 0/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 1/1F1-133 1/2F1-134 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 1/2F1-145 0/1F1-146 1/2F1-147 1/2F1-148 0/1F1-149 1/1F1-16 1/2F1-18 1/1F1-2 1/2F1-20 1/1F1-26 1/1F1-29 1/2F1-30 1/2F1-32 1/2F1-34 0/1F1-38 0/1F1-41 1/2F1-42 1/2F1-45 1/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 1/2F1-5 1/1F1-51 0/1F1-53 1/2F1-56 1/2F1-58 1/1F1-6 1/2F1-61 1/1F1-62 0/1F1-64 1/1F1-65 1/2F1-66 0/1F1-71 1/2F1-72 1/2F1-73 1/1F1-74 1/2F1-75 1/2F1-78 1/1F1-80 1/1F1-81 1/1F1-82 1/2F1-83 1/1F1-84 1/2F1-85 1/1F1-88 1/2F1-89 1/1F1-9 1/2F1-90 1/2F1-91 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1F1-98 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739012 | T > C | SNP PASS | QUAL 17394.30 DP 1057 · AF 0.32945736 129/129 called · 43 het |
64 carrier samples View list164L 1/2F1-10 1/2F1-100 2/2F1-101 2/2F1-107 2/2F1-108 1/2F1-11 2/2F1-110 1/2F1-111 1/2F1-112 0/2F1-114 1/2F1-115 2/2F1-119 0/2F1-12 1/2F1-131 2/2F1-132 2/2F1-133 1/2F1-135 2/2F1-137 2/2F1-141 2/2F1-143 1/2F1-144 2/2F1-146 1/2F1-147 1/2F1-15 0/2F1-16 1/2F1-19 2/2F1-2 1/2F1-21 0/2F1-29 1/2F1-30 1/2F1-31 2/2F1-32 1/2F1-33 2/2F1-36 0/2F1-37 0/2F1-40 0/2F1-41 1/2F1-42 1/2F1-43 0/2F1-44 2/2F1-49 1/2F1-53 1/2F1-55 2/2F1-56 1/2F1-6 1/2F1-63 2/2F1-65 1/2F1-68 2/2F1-71 1/2F1-72 1/2F1-74 1/2F1-75 1/2F1-76 2/2F1-8 0/2F1-82 1/2F1-84 1/2F1-87 2/2F1-88 1/2F1-9 1/2F1-90 1/2F1-95 2/2F1-99 0/2X5H 0/2
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739054 | C > T | SNP PASS | QUAL 8502.03 DP 1066 · AF 0.36046512 129/129 called · 43 het |
68 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-100 1/1F1-101 0/1F1-104 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-129 0/1F1-13 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 1/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-141 1/1F1-144 1/1F1-146 1/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-18 1/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-20 1/1F1-26 0/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-44 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 1/1F1-58 0/1F1-6 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 0/1F1-68 1/1F1-71 1/1F1-73 0/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-82 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-93 0/1F1-95 1/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739086 | CAAAAAAAAAAA > CAAAAAAAAAAAAAA | INDEL PASS | QUAL 7775.94 DP 975 · AF 0.10655738 122/129 called · 26 het |
26 carrier samples View listF1-10 1/2F1-102 0/2F1-103 0/2F1-108 0/2F1-111 1/2F1-112 1/2F1-113 1/2F1-114 0/2F1-116 0/2F1-12 1/2F1-126 0/2F1-127 0/2F1-128 0/2F1-130 1/2F1-134 0/2F1-139 1/2F1-140 0/2F1-48 0/2F1-5 1/2F1-58 0/2F1-80 0/2F1-81 1/2F1-82 1/2F1-85 1/2F1-88 1/2F1-89 1/2
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739086 | CAAAAAAAAAAA > CAAAAAAAAAAAAAAA | INDEL PASS | QUAL 7775.94 DP 975 · AF 0.23360656 122/129 called · 39 het |
48 carrier samples View list164L 0/1F1-10 1/2F1-109 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 1/2F1-112 1/2F1-113 1/2F1-115 1/1F1-12 1/2F1-13 0/1F1-130 1/2F1-132 1/1F1-139 1/2F1-145 0/1F1-147 0/1F1-149 0/1F1-15 1/1F1-19 0/1F1-33 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 0/1F1-44 1/1F1-49 1/1F1-5 1/2F1-53 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-73 0/1F1-74 0/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-81 1/2F1-82 1/2F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 1/2F1-88 1/2F1-89 1/2F1-9 1/1F1-91 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739097 | ATT > AAATTT | INDEL PASS | QUAL 4067.00 DP 1001 · AF 0.23412698 126/129 called · 39 het |
49 carrier samples View list164L 1/2F1-10 0/1F1-102 1/1F1-103 0/1F1-108 1/2F1-109 1/2F1-11 0/1F1-110 1/2F1-111 0/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-116 0/1F1-12 1/2F1-124 0/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-13 1/2F1-130 1/1F1-132 1/1F1-134 0/1F1-139 1/1F1-143 0/1F1-145 0/1F1-147 1/2F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 1/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 1/1F1-49 1/1F1-5 0/1F1-58 1/2F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-73 1/2F1-76 0/1F1-78 1/2F1-80 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 0/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-89 1/2F1-9 1/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739097 | ATT > ATTT | INDEL PASS | QUAL 4067.00 DP 1001 · AF 0.19444444 126/129 called · 35 het |
42 carrier samples View list164L 1/2F1-1 0/2F1-100 0/2F1-104 2/2F1-107 0/2F1-108 1/2F1-109 1/2F1-110 1/2F1-115 0/2F1-119 0/2F1-12 1/2F1-129 0/2F1-13 1/2F1-146 0/2F1-147 1/2F1-18 2/2F1-2 0/2F1-20 2/2F1-26 2/2F1-30 0/2F1-32 0/2F1-34 0/2F1-41 0/2F1-42 0/2F1-51 0/2F1-58 1/2F1-6 0/2F1-61 0/2F1-62 0/2F1-64 0/2F1-65 0/2F1-66 0/2F1-68 0/2F1-73 1/2F1-74 0/2F1-75 2/2F1-78 1/2F1-87 0/2F1-89 1/2F1-90 2/2F1-93 0/2F1-95 2/2
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739097 | A > T | SNP PASS | QUAL 4689.72 DP 1001 · AF 0.21825397 126/129 called · 37 het |
46 carrier samples View listF1-100 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-114 0/1F1-129 0/1F1-131 1/1F1-133 0/1F1-135 0/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-140 0/1F1-141 0/1F1-142 1/1F1-144 1/1F1-146 0/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-16 1/1F1-19 1/1F1-2 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-44 0/1F1-53 0/1F1-55 1/1F1-56 1/1F1-6 0/1F1-63 0/1F1-65 0/1F1-68 0/1F1-71 1/1F1-76 0/1F1-79 0/1F1-82 0/1F1-87 0/1F1-88 0/1F1-91 0/1F1-95 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739098 | T > A | SNP PASS | QUAL 38.75 DP 988 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-45 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739105 | A > G | SNP PASS | QUAL 191.87 DP 972 · AF 0.007751938 129/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-149 0/1F1-80 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739140 | T > C | SNP PASS | QUAL 1590.16 DP 974 · AF 0.0859375 128/129 called · 20 het |
21 carrier samples View listF1-102 0/1F1-103 1/1F1-109 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-119 0/1F1-124 0/1F1-125 0/1F1-127 0/1F1-133 0/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-149 0/1F1-73 0/1F1-81 0/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739141 | A > T | SNP PASS | QUAL 667.88 DP 970 · AF 0.0390625 128/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-109 0/1F1-111 0/1F1-113 0/1F1-149 0/1F1-73 0/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-96 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739157 | T > A | SNP PASS | QUAL 8484.54 DP 975 · AF 0.40944882 127/129 called · 58 het |
81 carrier samples View list164L 0/1F1-10 1/1F1-102 0/1F1-103 1/1F1-108 0/1F1-109 0/1F1-110 0/1F1-111 1/1F1-112 0/1F1-113 1/1F1-114 0/1F1-115 1/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-123 1/1F1-124 0/1F1-125 0/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-13 0/1F1-130 1/1F1-132 1/1F1-133 0/1F1-134 1/1F1-138 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-149 1/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-18 0/1F1-19 0/1F1-21 0/1F1-26 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 1/1F1-5 1/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 1/1F1-73 0/1F1-74 1/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-78 0/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 1/1F1-85 1/1F1-88 0/1F1-89 0/1F1-9 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1F1-98 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739295 | G > C | SNP PASS | QUAL 2614.02 DP 976 · AF 0.12790698 129/129 called · 23 het |
28 carrier samples View listF1-100 0/1F1-101 0/1F1-103 0/1F1-107 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-117 0/1F1-131 1/1F1-135 0/1F1-137 1/1F1-138 1/1F1-148 0/1F1-16 0/1F1-45 0/1F1-53 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-81 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-87 0/1F1-88 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739313 | TAAAAAAA > TAAAAAAAA | INDEL PASS | QUAL 5080.84 DP 984 · AF 0.30081301 123/129 called · 42 het |
58 carrier samples View listF1-100 0/1F1-101 1/1F1-102 0/1F1-103 1/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-108 1/1F1-113 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-119 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-124 1/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-127 0/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-130 0/1F1-134 1/1F1-136 0/1F1-139 1/1F1-140 0/1F1-142 0/1F1-143 1/1F1-148 0/1F1-15 0/1F1-18 0/1F1-26 0/1F1-38 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-58 0/1F1-72 0/1F1-74 1/1F1-75 0/1F1-77 0/1F1-78 0/1F1-79 1/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 1/1F1-86 0/1F1-90 0/1F1-91 1/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-96 0/1F1-97 0/1F1-98 1/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739580 | A > G | SNP PASS | QUAL 7950.08 DP 1121 · AF 0.33333333 129/129 called · 66 het |
76 carrier samples View listF1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-107 0/1F1-11 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 0/1F1-125 0/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 0/1F1-133 1/1F1-136 0/1F1-140 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-15 0/1F1-19 0/1F1-2 0/1F1-21 0/1F1-29 0/1F1-30 0/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-33 1/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 0/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 1/1F1-63 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-74 0/1F1-75 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-79 0/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-86 0/1F1-90 1/1F1-91 0/1F1-93 0/1F1-95 0/1F1-97 0/1F1-99 0/1X5H 1/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739590 | C > T | SNP PASS | QUAL 2948.64 DP 1134 · AF 0.10546875 128/129 called · 25 het |
26 carrier samples View listF1-1 0/1F1-107 0/1F1-133 0/1F1-140 0/1F1-141 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-21 0/1F1-34 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739653 | G > A | SNP PASS | QUAL 54.79 DP 1157 · AF 0.0078125 128/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-102 0/1F1-81 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739680 | G > A | SNP PASS | QUAL 80.71 DP 1212 · AF 0.007751938 129/129 called · 2 het |
2 carrier samples View listF1-103 0/1F1-143 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739687 | T > C | SNP PASS | QUAL 443.83 DP 1197 · AF 0.042635659 129/129 called · 11 het |
11 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739706 | A > T | SNP PASS | QUAL 13979.70 DP 1210 · AF 0.54263566 129/129 called · 54 het |
97 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-104 1/1F1-105 0/1F1-106 1/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-109 1/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 1/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 1/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-139 0/1F1-140 1/1F1-143 0/1F1-146 1/1F1-147 0/1F1-149 0/1F1-18 1/1F1-19 0/1F1-2 1/1F1-20 0/1F1-26 1/1F1-29 1/1F1-30 1/1F1-31 1/1F1-32 1/1F1-33 0/1F1-34 1/1F1-41 1/1F1-42 1/1F1-44 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-56 1/1F1-58 1/1F1-6 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-64 1/1F1-65 1/1F1-66 1/1F1-68 1/1F1-71 1/1F1-72 0/1F1-73 1/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-77 0/1F1-78 1/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-85 1/1F1-86 1/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-90 1/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 1/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739725 | G > A | SNP PASS | QUAL 30.51 DP 1224 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-134 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739741 | T > C | SNP PASS | QUAL 7773.48 DP 1209 · AF 0.32170543 129/129 called · 57 het |
70 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-103 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-118 0/1F1-12 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-129 0/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-134 1/1F1-136 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-15 1/1F1-16 1/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-21 0/1F1-33 0/1F1-36 1/1F1-37 1/1F1-38 0/1F1-40 1/1F1-43 1/1F1-44 0/1F1-46 0/1F1-48 1/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-55 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-63 0/1F1-66 0/1F1-7 1/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-76 1/1F1-77 0/1F1-79 0/1F1-8 1/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-84 0/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739768 | C > A | SNP PASS | QUAL 5293.89 DP 1186 · AF 0.22868217 129/129 called · 49 het |
54 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-103 0/1F1-108 0/1F1-11 0/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-124 0/1F1-129 0/1F1-131 1/1F1-132 0/1F1-134 0/1F1-135 1/1F1-136 0/1F1-137 1/1F1-138 0/1F1-139 0/1F1-142 0/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-15 1/1F1-16 0/1F1-19 0/1F1-20 0/1F1-33 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-44 0/1F1-48 0/1F1-5 0/1F1-55 0/1F1-63 0/1F1-7 0/1F1-72 0/1F1-74 0/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-80 0/1F1-81 0/1F1-84 0/1F1-87 1/1F1-88 0/1F1-9 0/1F1-91 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739778 | C > T | SNP PASS | QUAL 11826.10 DP 1162 · AF 0.49612403 129/129 called · 64 het |
96 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-103 0/1F1-104 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 0/1F1-108 0/1F1-109 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 1/1F1-114 0/1F1-115 0/1F1-116 0/1F1-117 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 0/1F1-121 1/1F1-122 0/1F1-125 1/1F1-126 1/1F1-127 1/1F1-128 1/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 0/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-139 0/1F1-140 1/1F1-142 0/1F1-143 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-18 1/1F1-2 0/1F1-20 0/1F1-26 1/1F1-29 0/1F1-30 1/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-34 1/1F1-38 0/1F1-41 1/1F1-42 0/1F1-45 1/1F1-46 0/1F1-49 1/1F1-5 0/1F1-51 0/1F1-53 0/1F1-56 0/1F1-58 1/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-64 1/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-73 1/1F1-74 0/1F1-75 1/1F1-77 0/1F1-78 1/1F1-79 1/1F1-80 0/1F1-82 0/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-86 1/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 1/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 1/1F1-94 0/1F1-95 0/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 1/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739783 | G > A | SNP PASS | QUAL 1172.29 DP 1175 · AF 0.050387597 129/129 called · 13 het |
13 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739784 | C > T | SNP PASS | QUAL 789.01 DP 1167 · AF 0.03875969 129/129 called · 10 het |
10 carrier samples View listF1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739786 | G > A | SNP PASS | QUAL 61.93 DP 1158 · AF 0.003875969 129/129 called · 1 het |
1 carrier samples View listF1-134 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739794 | G > C | SNP PASS | QUAL 1282.64 DP 1139 · AF 0.050387597 129/129 called · 13 het |
13 carrier samples View listF1-103 0/1F1-105 0/1F1-112 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739801 | C > G | SNP PASS | QUAL 4595.16 DP 1166 · AF 0.21484375 128/129 called · 41 het |
48 carrier samples View listF1-1 0/1F1-103 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-112 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-127 1/1F1-130 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-141 0/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-21 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739806 | T > A | SNP PASS | QUAL 5368.53 DP 1176 · AF 0.21875 128/129 called · 40 het |
48 carrier samples View listF1-1 0/1F1-103 0/1F1-105 0/1F1-106 0/1F1-107 1/1F1-112 0/1F1-117 0/1F1-118 0/1F1-119 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-124 0/1F1-127 1/1F1-130 0/1F1-133 0/1F1-134 0/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-143 0/1F1-144 1/1F1-148 0/1F1-149 0/1F1-16 0/1F1-21 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-43 0/1F1-45 0/1F1-46 0/1F1-48 0/1F1-51 0/1F1-53 1/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-66 0/1F1-7 0/1F1-76 0/1F1-77 0/1F1-8 0/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-91 0/1F1-99 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739821 | TAAAAAAAAA > TAAAAAAAAAA | INDEL PASS | QUAL 6548.48 DP 1161 · AF 0.13306452 124/129 called · 29 het |
31 carrier samples View listF1-101 0/2F1-102 0/2F1-108 0/2F1-11 1/2F1-114 1/2F1-123 0/2F1-134 0/2F1-139 0/2F1-19 1/2F1-2 0/2F1-29 0/2F1-31 2/2F1-32 0/2F1-33 1/2F1-42 0/2F1-44 1/2F1-55 1/2F1-56 2/2F1-6 0/2F1-63 1/2F1-64 0/2F1-65 0/2F1-68 0/2F1-71 0/2F1-81 0/2F1-85 0/2F1-88 0/2F1-91 0/2F1-98 0/2F1-99 0/2X5H 0/2
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739821 | TAAAAAAAAA > TAAAAAAAAAAAA | INDEL PASS | QUAL 6548.48 DP 1161 · AF 0.20564516 124/129 called · 41 het |
46 carrier samples View list164L 0/1F1-10 0/1F1-100 0/1F1-106 0/1F1-11 1/2F1-110 0/1F1-111 0/1F1-112 0/1F1-114 1/2F1-115 0/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-124 0/1F1-126 0/1F1-132 0/1F1-133 0/1F1-141 0/1F1-144 0/1F1-145 0/1F1-147 0/1F1-15 0/1F1-16 0/1F1-19 1/2F1-20 0/1F1-21 1/1F1-33 1/2F1-36 1/1F1-37 0/1F1-38 0/1F1-40 0/1F1-43 1/1F1-44 1/2F1-48 0/1F1-49 0/1F1-5 0/1F1-53 0/1F1-55 1/2F1-62 0/1F1-63 1/2F1-7 1/1F1-72 1/1F1-76 0/1F1-8 0/1F1-82 0/1F1-9 0/1F1-95 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739824 | A > C | SNP PASS | QUAL 459.91 DP 1179 · AF 0.036585366 123/129 called · 9 het |
9 carrier samples View listF1-105 0/1F1-118 0/1F1-122 0/1F1-123 0/1F1-130 0/1F1-134 0/1F1-143 0/1F1-16 0/1F1-99 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739827 | A > T | SNP PASS | QUAL 245.79 DP 1183 · AF 0.020325203 123/129 called · 5 het |
5 carrier samples View listF1-106 0/1F1-122 0/1F1-77 0/1F1-86 0/1F1-97 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739831 | G > A | SNP PASS | QUAL 10711.30 DP 1062 · AF 0.54365079 126/129 called · 51 het |
94 carrier samples View list164L 0/1F1-1 1/1F1-10 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-104 1/1F1-105 1/1F1-106 1/1F1-107 1/1F1-108 0/1F1-109 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 1/1F1-114 0/1F1-117 1/1F1-119 0/1F1-12 0/1F1-120 1/1F1-121 1/1F1-122 1/1F1-125 1/1F1-126 0/1F1-127 1/1F1-128 1/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 1/1F1-132 0/1F1-133 1/1F1-140 1/1F1-141 1/1F1-142 0/1F1-143 1/1F1-144 1/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-148 1/1F1-149 1/1F1-18 1/1F1-20 0/1F1-26 1/1F1-29 0/1F1-30 1/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-36 0/1F1-37 0/1F1-38 1/1F1-40 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-43 0/1F1-45 1/1F1-48 0/1F1-49 0/1F1-51 1/1F1-53 1/1F1-56 0/1F1-58 1/1F1-6 0/1F1-61 1/1F1-62 1/1F1-64 0/1F1-65 0/1F1-66 1/1F1-68 0/1F1-7 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-73 1/1F1-75 0/1F1-77 1/1F1-78 1/1F1-79 0/1F1-8 0/1F1-80 1/1F1-82 1/1F1-83 1/1F1-84 0/1F1-85 0/1F1-86 0/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-91 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 0/1X5H 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739833 | A > T | SNP PASS | QUAL 1288.47 DP 1104 · AF 0.055555556 126/129 called · 10 het |
12 carrier samples View listF1-101 0/1F1-105 1/1F1-120 0/1F1-121 0/1F1-122 0/1F1-125 1/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-79 0/1F1-92 0/1F1-96 0/1F1-98 0/1
|
| TkA01G624900 TK1151 · Chr01:157738653-157741276 | Chr01:157739834 | A > T | SNP PASS | QUAL 7813.58 DP 1108 · AF 0.34126984 126/129 called · 50 het |
68 carrier samples View list164L 0/1F1-1 0/1F1-10 0/1F1-101 0/1F1-102 0/1F1-104 0/1F1-105 1/1F1-106 0/1F1-108 0/1F1-109 1/1F1-110 0/1F1-111 0/1F1-113 1/1F1-117 0/1F1-12 0/1F1-120 1/1F1-121 1/1F1-122 1/1F1-125 1/1F1-126 0/1F1-128 0/1F1-129 0/1F1-13 1/1F1-130 1/1F1-132 0/1F1-140 1/1F1-143 0/1F1-146 0/1F1-147 0/1F1-149 1/1F1-18 1/1F1-20 0/1F1-26 1/1F1-29 0/1F1-30 1/1F1-31 0/1F1-32 0/1F1-41 0/1F1-42 0/1F1-49 0/1F1-51 0/1F1-56 0/1F1-58 0/1F1-6 0/1F1-61 0/1F1-62 0/1F1-65 0/1F1-66 0/1F1-68 0/1F1-71 0/1F1-72 0/1F1-73 0/1F1-75 0/1F1-77 0/1F1-78 1/1F1-79 0/1F1-80 0/1F1-86 0/1F1-88 0/1F1-89 1/1F1-9 0/1F1-90 0/1F1-92 0/1F1-93 0/1F1-94 0/1F1-96 1/1F1-97 1/1F1-98 0/1
|
AF is ALT-specific AC/AN within the selected reference, and NS is the number of samples with complete genotype calls; AF is blank when AC or AN is missing. The two references are calculated separately. These are CRA009020 F1 population candidate variants filtered at QUAL >= 30 and INFO/DP >= 10, not experimental validation or causal claims.