同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00269

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 222

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00269

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00269 Chr06 12242939-16849169 Chr05 110880707-115345701 mixed High 22 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00269`	Chr06:12242939-16849169	Chr05:110880707-115345701	mixed	222	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 222 · 当前范围 201–222 · 页码 2/2

上一页下载全部锚点 TSV

TkA06G061460 → LXL04_025406

98.8%

TkA06G061540 → LXL04_025405

95.6%

TkA06G061570 → LXL04_025404

99.3%

TkA06G061590 → LXL04_025403

100.0%

TkA06G061600 → LXL04_025403

92.9%

TkA06G061620 → LXL04_025402

100.0%

TkA06G061630 → LXL04_025410

53.8%

TkA06G061640 → LXL04_025401

100.0%

TkA06G061670 → LXL04_025400

90.8%

TkA06G061720 → LXL04_025398

100.0%

TkA06G061780 → LXL04_025397

99.8%

TkA06G061800 → LXL04_025396

98.9%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G061460`	`LXL04_025406`	`JCVI_TKOH_00269`	98.8	80.124 / 100.0	Complex
`TkA06G061540`	`LXL04_025405`	`JCVI_TKOH_00269`	95.6	100.0 / 90.132	待复核
`TkA06G061570`	`LXL04_025404`	`JCVI_TKOH_00269`	99.3	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G061590`	`LXL04_025403`	`JCVI_TKOH_00269`	100.0	98.77 / 63.089	待复核
`TkA06G061600`	`LXL04_025403`	`JCVI_TKOH_00269`	92.9	64.706 / 25.654	Complex
`TkA06G061620`	`LXL04_025402`	`JCVI_TKOH_00269`	100.0	82.787 / 41.057	Complex
`TkA06G061630`	`LXL04_025410`	`JCVI_TKOH_00269`	53.8	84.49 / 41.412	Complex
`TkA06G061640`	`LXL04_025401`	`JCVI_TKOH_00269`	100.0	99.467 / 91.198	Strict
`TkA06G061670`	`LXL04_025400`	`JCVI_TKOH_00269`	90.8	100.0 / 62.201	待复核
`TkA06G061720`	`LXL04_025398`	`JCVI_TKOH_00269`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G061780`	`LXL04_025397`	`JCVI_TKOH_00269`	99.8	98.168 / 67.28	待复核
`TkA06G061800`	`LXL04_025396`	`JCVI_TKOH_00269`	98.9	80.531 / 63.636	待复核
`TkA06G061810`	`LXL04_025395`	`JCVI_TKOH_00269`	100.0	77.512 / 100.0	Probable
`TkA06G061840`	`LXL04_025394`	`JCVI_TKOH_00269`	82.7	94.872 / 39.778	Complex
`TkA06G061910`	`LXL04_025393`	`JCVI_TKOH_00269`	99.0	98.748 / 96.73	Strict
`TkA06G062110`	`LXL04_025389`	`JCVI_TKOH_00269`	99.0	76.515 / 36.727	Complex
`TkA06G062120`	`LXL04_025388`	`JCVI_TKOH_00269`	99.2	98.507 / 79.518	Complex
`TkA06G062220`	`LXL04_025387`	`JCVI_TKOH_00269`	97.8	67.883 / 34.191	Complex
`TkA06G062320`	`LXL04_025385`	`JCVI_TKOH_00269`	99.7	97.118 / 53.155	待复核
`TkA06G062370`	`LXL04_025383`	`JCVI_TKOH_00269`	99.8	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G062380`	`LXL04_025382`	`JCVI_TKOH_00269`	100.0	100.0 / 71.088	Complex
`TkA06G062390`	`LXL04_025380`	`JCVI_TKOH_00269`	95.3	33.077 / 28.667	Complex