同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00381
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 8
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00381

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00381 ChrUn 24040099-24119888 Chr01 168537603-168894609 mixed High 8 anchors
ChrUn 24040099-24119888 Chr01 168537603-168894609 JCVI_TKOH_00381 · 8 gene pairs TkAUNG084530 | LXL04_005578 | 91.5% | RBH_sequence_supported | Probable TkAUNG084540 | LXL04_005573 | 71.0% | non_reciprocal_best_hit | Complex TkAUNG084560 | LXL04_005571 | 82.8% | multi_candidate_from_TK1151 | Complex TkAUNG084580 | LXL04_005577 | 99.1% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG084590 | LXL04_005576 | 98.0% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG084600 | LXL04_005575 | 86.9% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG084680 | LXL04_005574 | 96.8% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkAUNG084820 | LXL04_005571 | 82.7% | non_reciprocal_best_hit | Complex
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00381 ChrUn:24040099-24119888 Chr01:168537603-168894609 mixed 8 高置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 8 · 当前范围 1–8 · 页码 1/1

TkAUNG084530 → LXL04_005578
91.5%
TkAUNG084540 → LXL04_005573
71.0%
TkAUNG084560 → LXL04_005571
82.8%
TkAUNG084580 → LXL04_005577
99.1%
TkAUNG084590 → LXL04_005576
98.0%
TkAUNG084600 → LXL04_005575
86.9%
TkAUNG084680 → LXL04_005574
96.8%
TkAUNG084820 → LXL04_005571
82.7%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkAUNG084530LXL04_005578JCVI_TKOH_0038191.590.338 / 100.0Probable
TkAUNG084540LXL04_005573JCVI_TKOH_0038171.046.154 / 20.556Complex
TkAUNG084560LXL04_005571JCVI_TKOH_0038182.898.811 / 32.564Complex
TkAUNG084580LXL04_005577JCVI_TKOH_0038199.194.865 / 97.5Complex
TkAUNG084590LXL04_005576JCVI_TKOH_0038198.083.054 / 82.363Complex
TkAUNG084600LXL04_005575JCVI_TKOH_0038186.998.909 / 100.0Complex
TkAUNG084680LXL04_005574JCVI_TKOH_0038196.8100.0 / 100.0Complex
TkAUNG084820LXL04_005571JCVI_TKOH_0038182.795.09 / 20.717Complex