同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00337

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 17

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00337

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00337 Chr08 3180879-4100301 Chr04 9868854-10664878 mixed High 17 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00337`	Chr08:3180879-4100301	Chr04:9868854-10664878	mixed	17	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 17 · 当前范围 1–17 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA08G013560 → LXL04_018287

100.0%

TkA08G014930 → LXL04_018259

88.9%

TkA08G015810 → LXL04_018263

99.8%

TkA08G015860 → LXL04_018264

99.8%

TkA08G015870 → LXL04_018265

96.1%

TkA08G016060 → LXL04_018267

99.1%

TkA08G016070 → LXL04_018268

100.0%

TkA08G016240 → LXL04_018269

100.0%

TkA08G016290 → LXL04_018270

66.1%

TkA08G016310 → LXL04_018271

99.3%

TkA08G016320 → LXL04_018272

91.6%

TkA08G016330 → LXL04_018273

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA08G013560`	`LXL04_018287`	`JCVI_TKOH_00337`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G014930`	`LXL04_018259`	`JCVI_TKOH_00337`	88.9	100.0 / 96.945	待复核
`TkA08G015810`	`LXL04_018263`	`JCVI_TKOH_00337`	99.8	100.0 / 100.0	Strict
`TkA08G015860`	`LXL04_018264`	`JCVI_TKOH_00337`	99.8	93.891 / 59.033	待复核
`TkA08G015870`	`LXL04_018265`	`JCVI_TKOH_00337`	96.1	100.0 / 89.049	Strict
`TkA08G016060`	`LXL04_018267`	`JCVI_TKOH_00337`	99.1	84.173 / 45.174	待复核
`TkA08G016070`	`LXL04_018268`	`JCVI_TKOH_00337`	100.0	100.0 / 57.082	待复核
`TkA08G016240`	`LXL04_018269`	`JCVI_TKOH_00337`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G016290`	`LXL04_018270`	`JCVI_TKOH_00337`	66.1	96.133 / 50.457	Complex
`TkA08G016310`	`LXL04_018271`	`JCVI_TKOH_00337`	99.3	100.0 / 96.27	Strict
`TkA08G016320`	`LXL04_018272`	`JCVI_TKOH_00337`	91.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G016330`	`LXL04_018273`	`JCVI_TKOH_00337`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G016350`	`LXL04_018274`	`JCVI_TKOH_00337`	95.8	100.0 / 100.0	Strict
`TkA08G016580`	`LXL04_018279`	`JCVI_TKOH_00337`	100.0	99.524 / 100.0	Complex
`TkA08G016610`	`LXL04_018280`	`JCVI_TKOH_00337`	98.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA08G016630`	`LXL04_018281`	`JCVI_TKOH_00337`	97.4	98.693 / 71.596	Complex
`TkA08G016640`	`LXL04_018282`	`JCVI_TKOH_00337`	95.1	99.156 / 59.42	待复核