同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00311

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 22

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00311

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00311 Chr07 93966363-95320935 Chr06 107031360-108581067 mixed High 22 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00311`	Chr07:93966363-95320935	Chr06:107031360-108581067	mixed	22	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 22 · 当前范围 1–22 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA07G374500 → LXL04_030118

99.4%

TkA07G374510 → LXL04_030117

100.0%

TkA07G374850 → LXL04_030116

100.0%

TkA07G374900 → LXL04_030115

100.0%

TkA07G374940 → LXL04_030113

98.7%

TkA07G375370 → LXL04_030105

100.0%

TkA07G375380 → LXL04_030103

100.0%

TkA07G375560 → LXL04_030102

100.0%

TkA07G375620 → LXL04_030101

98.2%

TkA07G375630 → LXL04_030100

97.5%

TkA07G376980 → LXL04_030093

85.3%

TkA07G377430 → LXL04_030092

83.9%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA07G374500`	`LXL04_030118`	`JCVI_TKOH_00311`	99.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G374510`	`LXL04_030117`	`JCVI_TKOH_00311`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G374850`	`LXL04_030116`	`JCVI_TKOH_00311`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G374900`	`LXL04_030115`	`JCVI_TKOH_00311`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G374940`	`LXL04_030113`	`JCVI_TKOH_00311`	98.7	60.078 / 96.273	待复核
`TkA07G375370`	`LXL04_030105`	`JCVI_TKOH_00311`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G375380`	`LXL04_030103`	`JCVI_TKOH_00311`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G375560`	`LXL04_030102`	`JCVI_TKOH_00311`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G375620`	`LXL04_030101`	`JCVI_TKOH_00311`	98.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G375630`	`LXL04_030100`	`JCVI_TKOH_00311`	97.5	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G376980`	`LXL04_030093`	`JCVI_TKOH_00311`	85.3	87.2 / 26.65	待复核
`TkA07G377430`	`LXL04_030092`	`JCVI_TKOH_00311`	83.9	99.091 / 43.049	Complex
`TkA07G377460`	`LXL04_030091`	`JCVI_TKOH_00311`	95.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA07G378210`	`LXL04_030087`	`JCVI_TKOH_00311`	99.0	99.365 / 57.643	待复核
`TkA07G379060`	`LXL04_030081`	`JCVI_TKOH_00311`	96.9	74.648 / 28.086	Complex
`TkA07G379270`	`LXL04_030080`	`JCVI_TKOH_00311`	96.2	88.435 / 26.804	待复核
`TkA07G379310`	`LXL04_030079`	`JCVI_TKOH_00311`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G379320`	`LXL04_030077`	`JCVI_TKOH_00311`	99.5	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G379330`	`LXL04_030076`	`JCVI_TKOH_00311`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA07G380050`	`LXL04_030087`	`JCVI_TKOH_00311`	99.0	99.365 / 57.643	待复核
`TkA07G380090`	`LXL04_030089`	`JCVI_TKOH_00311`	95.0	92.641 / 100.0	Complex
`TkA07G380380`	`LXL04_030091`	`JCVI_TKOH_00311`	94.7	100.0 / 100.0	Complex