同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00277

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 25

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00277

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00277 Chr06 62366585-69710119 Chr05 47978973-54083514 mixed High 25 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00277`	Chr06:62366585-69710119	Chr05:47978973-54083514	mixed	25	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 25 · 当前范围 1–25 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G245960 → LXL04_023547

91.8%

TkA06G249260 → LXL04_023528

100.0%

TkA06G249270 → LXL04_023529

100.0%

TkA06G251910 → LXL04_023532

100.0%

TkA06G253470 → LXL04_023536

99.9%

TkA06G253530 → LXL04_023538

100.0%

TkA06G254630 → LXL04_023542

98.9%

TkA06G255330 → LXL04_023546

100.0%

TkA06G255370 → LXL04_023547

100.0%

TkA06G256000 → LXL04_023550

100.0%

TkA06G257760 → LXL04_023551

100.0%

TkA06G257850 → LXL04_023552

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G245960`	`LXL04_023547`	`JCVI_TKOH_00277`	91.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G249260`	`LXL04_023528`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	95.122 / 92.857	Complex
`TkA06G249270`	`LXL04_023529`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	100.0 / 97.297	Complex
`TkA06G251910`	`LXL04_023532`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G253470`	`LXL04_023536`	`JCVI_TKOH_00277`	99.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G253530`	`LXL04_023538`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	66.176 / 58.442	Complex
`TkA06G254630`	`LXL04_023542`	`JCVI_TKOH_00277`	98.9	94.474 / 80.38	待复核
`TkA06G255330`	`LXL04_023546`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	57.561 / 26.222	待复核
`TkA06G255370`	`LXL04_023547`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G256000`	`LXL04_023550`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	58.654 / 31.771	Complex
`TkA06G257760`	`LXL04_023551`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	100.0 / 61.135	Complex
`TkA06G257850`	`LXL04_023552`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	100.0 / 40.767	待复核
`TkA06G257860`	`LXL04_023552`	`JCVI_TKOH_00277`	99.1	94.309 / 27.818	待复核
`TkA06G258410`	`LXL04_023555`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	99.194 / 100.0	Strict
`TkA06G260860`	`LXL04_023592`	`JCVI_TKOH_00277`	99.7	91.818 / 67.035	待复核
`TkA06G262050`	`LXL04_023591`	`JCVI_TKOH_00277`	93.1	98.722 / 62.056	待复核
`TkA06G262610`	`LXL04_023590`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G263330`	`LXL04_023587`	`JCVI_TKOH_00277`	47.5	100.0 / 89.344	Complex
`TkA06G264870`	`LXL04_023585`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G266650`	`LXL04_023583`	`JCVI_TKOH_00277`	94.4	96.644 / 59.016	待复核
`TkA06G270140`	`LXL04_023578`	`JCVI_TKOH_00277`	100.0	77.941 / 45.887	待复核
`TkA06G272350`	`LXL04_023572`	`JCVI_TKOH_00277`	99.8	94.264 / 68.188	待复核
`TkA06G272980`	`LXL04_023568`	`JCVI_TKOH_00277`	83.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G274240`	`LXL04_023567`	`JCVI_TKOH_00277`	97.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G274760`	`LXL04_023564`	`JCVI_TKOH_00277`	98.4	100.0 / 92.493	Strict