同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00139

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 7

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00139

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00139 Chr03 70860604-70990664 Chr02 92212955-92369383 + Medium 7 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00139`	Chr03:70860604-70990664	Chr02:92212955-92369383	+	7	中等置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 7 · 当前范围 1–7 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA03G287080 → LXL04_008202

95.6%

TkA03G287110 → LXL04_008203

100.0%

TkA03G287390 → LXL04_008205

99.4%

TkA03G287420 → LXL04_008206

92.8%

TkA03G287510 → LXL04_008209

95.5%

TkA03G287520 → LXL04_008210

99.6%

TkA03G287540 → LXL04_008211

99.8%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA03G287080`	`LXL04_008202`	`JCVI_TKOH_00139`	95.6	65.397 / 91.071	待复核
`TkA03G287110`	`LXL04_008203`	`JCVI_TKOH_00139`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA03G287390`	`LXL04_008205`	`JCVI_TKOH_00139`	99.4	96.067 / 34.756	待复核
`TkA03G287420`	`LXL04_008206`	`JCVI_TKOH_00139`	92.8	98.485 / 83.219	Probable
`TkA03G287510`	`LXL04_008209`	`JCVI_TKOH_00139`	95.5	96.279 / 57.123	待复核
`TkA03G287520`	`LXL04_008210`	`JCVI_TKOH_00139`	99.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA03G287540`	`LXL04_008211`	`JCVI_TKOH_00139`	99.8	100.0 / 100.0	Strict