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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G037000
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 9423682-9427947 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1622 bp · TkA08G037000|TK1151|cDNA

AGTCCAAATCCATTATATTTCGTCGTACTAGTGTGTGTTTCTGAGTGTAATTTTGATCTTGATCATGGGTTCTTCAGCGAATTACGACTTGGAGACCGGAGAGATTGTGAAATTGAGTCCGGTTGCTAAGTCCTTGTTACGAACGAGATCTCAGACGGATGTGTTAGCTAGTGTTCGGTTTCGGATTTTGAGGAATTTTCTCGCTAATGTTCGAATCGTCATTTTAGGAACCAAGCTTTTCGTGCTTTTTCCTGCTATTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1305 bp · TkA08G037000|TK1151|CDS

ATGGGTTCTTCAGCGAATTACGACTTGGAGACCGGAGAGATTGTGAAATTGAGTCCGGTTGCTAAGTCCTTGTTACGAACGAGATCTCAGACGGATGTGTTAGCTAGTGTTCGGTTTCGGATTTTGAGGAATTTTCTCGCTAATGTTCGAATCGTCATTTTAGGAACCAAGCTTTTCGTGCTTTTTCCTGCTATTCCTATGGCGTTTGTAGCTCATTATTACAATTTCCGGAGACCATGGATTTTTGCATTGAGTTTGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

434 aa · TkA08G037000|TK1151|PROTEIN

MGSSANYDLETGEIVKLSPVAKSLLRTRSQTDVLASVRFRILRNFLANVRIVILGTKLFVLFPAIPMAFVAHYYNFRRPWIFALSLIGLTPLAERLSFLTEQIAFFTGPTVGGLVNATCGNATELIIAMFALHKRKIHVLKFSLLGSVISNLLLVLGSSLLCGGIVNINKEQKFDHKQADANSLLLLLGLLCQILPLLFSFHNTDTPKLNRIGVLRLSRASSIVMLIAYVAYLIFQLKTHTQLFEAQEEEDDDIEELEKE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G037000
TK1151 IDTkA08G037000
OH-1004 IDLXL04_000626
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)69.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.848 / OH-1004 96.154
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G037000
位置Chr08:9423682-9427947 (-)
描述Similar to CAX4: Vacuolar cation/proton exchanger 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g51860 液泡阳离子/质子交换器 (CAX)。
Functional association of Arabidopsis CAX1 and CAX3 is required for normal growth and ion homeostasis.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.061218
At2g38170 液泡阳离子/质子交换器。
The Arabidopsis cax1 mutant exhibits impaired ion homeostasis, development, and hormonal responses and reveals interplay among vacuolar transporters.2003 · DOI: 10.1105/tpc.007385
Mutations in the Ca2+/H+ transporter CAX1 increase CBF/DREB1 expression and the cold-acclimation response in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1105/tpc.015248
Functional association of Arabidopsis CAX1 and CAX3 is required for normal growth and ion homeostasis.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.061218
At5g01490 液泡阳离子/质子交换器 (CAX)。
Enhanced Cd2+ -selective root-tonoplast-transport in tobaccos expressing Arabidopsis cation exchangers.2007 · DOI: 10.1007/s00425-006-0352-7

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0557500 液泡阳离子/质子交换器。
Expression profile of the genes for rice cation/H+ exchanger family and functional analysis in yeast.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci173
Os05g0594200 液泡阳离子/质子交换器。
Expression profile of the genes for rice cation/H+ exchanger family and functional analysis in yeast.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci173
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000626 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006793 phosphorus metabolic process 生物过程
GO:0006812 monoatomic cation transport 生物过程
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0006882 intracellular zinc ion homeostasis 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009631 cold acclimation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010351 lithium ion transport 生物过程
GO:0030026 intracellular manganese ion homeostasis 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G38170
ath:AT3G51860
ath:AT5G01490
dosa:Os01g0557500
dosa:Os05g0594200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.392
排名 1 · TkA08G037000 · TK1151
溶酶体／液泡0.331
排名 2 · TkA08G037000 · TK1151
细胞质0.156
排名 3 · TkA08G037000 · TK1151
内质网0.108
排名 4 · TkA08G037000 · TK1151
高尔基体0.094
排名 5 · TkA08G037000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01699Na_Ca_ex45-70 aa
PF01699Na_Ca_ex80-237 aa
PF15844TMCCDC2124-198 aa
PF01699Na_Ca_ex269-407 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G037000PF01699Na_Ca_ex45703.7e-41141.3
TkA08G037000PF01699Na_Ca_ex802373.7e-41141.3
TkA08G037000PF15844TMCCDC21241980.2312.3
TkA08G037000PF01699Na_Ca_ex2694073.7e-41141.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93Z81拟南芥sp|Q93Z81|CAX3_ARATH Vacuolar cation/proton exchanger 363.300%Swiss-Prot高置信
Q39253拟南芥sp|Q39253|CAX1_ARATH Vacuolar cation/proton exchanger 162.800%Swiss-Prot高置信
Q945S5拟南芥sp|Q945S5|CAX4_ARATH Vacuolar cation/proton exchanger 456.600%Swiss-Prot高置信
Q769E5水稻sp|Q769E5|CAX1A_ORYSJ Vacuolar cation/proton exchanger 1a60.600%Swiss-Prot高置信
Q5TKG3水稻sp|Q5TKG3|CAX1B_ORYSJ Vacuolar cation/proton exchanger 1b58.900%Swiss-Prot高置信

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