基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA06G072040
当前版本: TK1151
染色体: Chr06
坐标: 19295334-19297680
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1290 bp · TkA06G072040|TK1151|cDNA
TGAATGTTTTATTCTCAATAGACAATGAAGCTGACCTAACTTATCTTTTTATCTCCTCAATACTTTCTCCTATATATACATTAACAACTTTCGACGAGATTGTACCAACCAAAACCTACGGAGATGGAGAAAGCTTATGAAGGCCATGTGTTGGTGTTGCCTTACCCAAGCCAAGGCCATATTAACCCTCTCCTTCAATTTGCCAAAAGACTCGTCTCCAAAGGACTTAAAGCCACCATCGCCACCACCCACTACACCCT...
CDS
下载 CDS FASTA1167 bp · TkA06G072040|TK1151|CDS
ATGGAGAAAGCTTATGAAGGCCATGTGTTGGTGTTGCCTTACCCAAGCCAAGGCCATATTAACCCTCTCCTTCAATTTGCCAAAAGACTCGTCTCCAAAGGACTTAAAGCCACCATCGCCACCACCCACTACACCCTTTCTTCCATCTCCGCCCCATTCATCACCGTGGAGCCCATCTCCGACGGCTTTGACCATGGTGGTTTCGCTCAAGCCCAATCAGCGGATGTCTTTCTAGAATCCTTTAAGTCCAATGGCTCACG...
388 aa · TkA06G072040|TK1151|PROTEIN
MEKAYEGHVLVLPYPSQGHINPLLQFAKRLVSKGLKATIATTHYTLSSISAPFITVEPISDGFDHGGFAQAQSADVFLESFKSNGSRTLTQLIKKHQTTKNPITCVVYDSFFPWALEVAKENGILGAPFFTNSAAVSSIFSRIHGGMLRVPVRLDDCPVVLPGVPPLNLEDLPSFLNAPESYPAYLKMKLNQFSNLEKADWIFCNSFRSLEPEVVKGIGEQWSAKLIGPMVPSAYLDGRIEGDKGYGASLWKPVNHECTK...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA06G072040 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA06G072040 |
| OH-1004 ID | LXL04_025246 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 84.200 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 100.000覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA06G072040 |
|---|---|
| 位置 | Chr06:19295334-19297680 (-) |
| 描述 | Similar to UGT74B1: UDP-glycosyltransferase 74B1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源:OH1004 · |
| GO 注释(OH1004 来源) | GO:0009696 salicylic acid metabolic process 生物过程 GO:0010016 shoot system morphogenesis 生物过程 GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程 GO:0018874 benzoate metabolic process 生物过程 GO:0019761 glucosinolate biosynthetic process 生物过程 GO:0042631 cellular response to water deprivation 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0046482 para-aminobenzoic acid metabolic process 生物过程 GO:0052544 defense response by callose deposition in cell wall 生物过程 GO:0070301 cellular response to hydrogen peroxide 生物过程 GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程 GO:0071475 cellular hyperosmotic salinity response 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ag:AEM42999 ath:AT1G05680 ath:AT1G24100 ath:AT2G43820 ath:AT2G43840 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。
细胞质0.791
细胞核0.224
内质网0.073
细胞膜0.049
过氧化物酶体0.049
LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00201UDPGT9-139 aaPF26168Glyco_transf_N9-42 aaPF26168Glyco_transf_N79-146 aaPF11227DUF3025230-312 aaPF00201UDPGT248-290 aaPF06910MEA1282-313 aaPF00201UDPGT292-345 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA06G072040 | PF00201 | UDPGT | 9 | 139 | 2.3e-06 | 27.4 |
| TkA06G072040 | PF26168 | Glyco_transf_N | 9 | 42 | 8.3e-06 | 26.6 |
| TkA06G072040 | PF26168 | Glyco_transf_N | 79 | 146 | 8.3e-06 | 26.6 |
| TkA06G072040 | PF11227 | DUF3025 | 230 | 312 | 0.089 | 13.3 |
| TkA06G072040 | PF00201 | UDPGT | 248 | 290 | 2.3e-06 | 27.4 |
| TkA06G072040 | PF06910 | MEA1 | 282 | 313 | 0.34 | 12.2 |
| TkA06G072040 | PF00201 | UDPGT | 292 | 345 | 2.3e-06 | 27.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
O48676 | 拟南芥 | sp|O48676|U74B1_ARATH UDP-glycosyltransferase 74B1 | 43.300% | Swiss-Prot | 中等置信 |
O22822 | 拟南芥 | sp|O22822|U74F2_ARATH UDP-glycosyltransferase 74F2 | 41.600% | Swiss-Prot | 中等置信 |
O22820 | 拟南芥 | sp|O22820|U74F1_ARATH Flavonol 7-O-beta-glucosyltransferase UGT74F1 | 40.300% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9SYK9 | 拟南芥 | sp|Q9SYK9|U74E2_ARATH UDP-glycosyltransferase 74E2 | 38.000% | Swiss-Prot | 中等置信 |