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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA06G072040
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 19295334-19297680 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1290 bp · TkA06G072040|TK1151|cDNA

TGAATGTTTTATTCTCAATAGACAATGAAGCTGACCTAACTTATCTTTTTATCTCCTCAATACTTTCTCCTATATATACATTAACAACTTTCGACGAGATTGTACCAACCAAAACCTACGGAGATGGAGAAAGCTTATGAAGGCCATGTGTTGGTGTTGCCTTACCCAAGCCAAGGCCATATTAACCCTCTCCTTCAATTTGCCAAAAGACTCGTCTCCAAAGGACTTAAAGCCACCATCGCCACCACCCACTACACCCT...

1167 bp · TkA06G072040|TK1151|CDS

ATGGAGAAAGCTTATGAAGGCCATGTGTTGGTGTTGCCTTACCCAAGCCAAGGCCATATTAACCCTCTCCTTCAATTTGCCAAAAGACTCGTCTCCAAAGGACTTAAAGCCACCATCGCCACCACCCACTACACCCTTTCTTCCATCTCCGCCCCATTCATCACCGTGGAGCCCATCTCCGACGGCTTTGACCATGGTGGTTTCGCTCAAGCCCAATCAGCGGATGTCTTTCTAGAATCCTTTAAGTCCAATGGCTCACG...

388 aa · TkA06G072040|TK1151|PROTEIN

MEKAYEGHVLVLPYPSQGHINPLLQFAKRLVSKGLKATIATTHYTLSSISAPFITVEPISDGFDHGGFAQAQSADVFLESFKSNGSRTLTQLIKKHQTTKNPITCVVYDSFFPWALEVAKENGILGAPFFTNSAAVSSIFSRIHGGMLRVPVRLDDCPVVLPGVPPLNLEDLPSFLNAPESYPAYLKMKLNQFSNLEKADWIFCNSFRSLEPEVVKGIGEQWSAKLIGPMVPSAYLDGRIEGDKGYGASLWKPVNHECTK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G072040
TK1151 IDTkA06G072040
OH-1004 IDLXL04_025246
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)84.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G072040
位置Chr06:19295334-19297680 (-)
描述Similar to UGT74B1: UDP-glycosyltransferase 74B1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_025246 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0009696 salicylic acid metabolic process 生物过程
GO:0010016 shoot system morphogenesis 生物过程
GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程
GO:0018874 benzoate metabolic process 生物过程
GO:0019761 glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0042631 cellular response to water deprivation 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0046482 para-aminobenzoic acid metabolic process 生物过程
GO:0052544 defense response by callose deposition in cell wall 生物过程
GO:0070301 cellular response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程
GO:0071475 cellular hyperosmotic salinity response 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ag:AEM42999
ath:AT1G05680
ath:AT1G24100
ath:AT2G43820
ath:AT2G43840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.791
排名 1 · TkA06G072040 · TK1151
细胞核0.224
排名 2 · TkA06G072040 · TK1151
内质网0.073
排名 3 · TkA06G072040 · TK1151
细胞膜0.049
排名 4 · TkA06G072040 · TK1151
过氧化物酶体0.049
排名 5 · TkA06G072040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00201UDPGT9-139 aa
PF26168Glyco_transf_N9-42 aa
PF26168Glyco_transf_N79-146 aa
PF11227DUF3025230-312 aa
PF00201UDPGT248-290 aa
PF06910MEA1282-313 aa
PF00201UDPGT292-345 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G072040PF00201UDPGT91392.3e-0627.4
TkA06G072040PF26168Glyco_transf_N9428.3e-0626.6
TkA06G072040PF26168Glyco_transf_N791468.3e-0626.6
TkA06G072040PF11227DUF30252303120.08913.3
TkA06G072040PF00201UDPGT2482902.3e-0627.4
TkA06G072040PF06910MEA12823130.3412.2
TkA06G072040PF00201UDPGT2923452.3e-0627.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O48676拟南芥sp|O48676|U74B1_ARATH UDP-glycosyltransferase 74B143.300%Swiss-Prot中等置信
O22822拟南芥sp|O22822|U74F2_ARATH UDP-glycosyltransferase 74F241.600%Swiss-Prot中等置信
O22820拟南芥sp|O22820|U74F1_ARATH Flavonol 7-O-beta-glucosyltransferase UGT74F140.300%Swiss-Prot中等置信
Q9SYK9拟南芥sp|Q9SYK9|U74E2_ARATH UDP-glycosyltransferase 74E238.000%Swiss-Prot中等置信

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