TkA05G447050 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G447050

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 111801353-111802961 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1477 bp · TkA05G447050|TK1151|cDNA

AAATTTGGCTACAAAACATTTATCTCCCACTACACAACGCATAAATGGTGTCACTTTTGACATTTCTTGCATTCTCTCTCTCAACTCTCTTGTTCCTGGTCTTTCTTAAAAGCAAACTTTACTGCACATGCCATGTCTGCCATTGCTATCTCAAATCTAAGTGGTCAACAGAGTATAACAATCTATGCGATTGGTACACTCATCTTCTCCAAAAGTCCTCATCTCAAACAATCCGTATTCATGTACTACGTAAAATCATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1083 bp · TkA05G447050|TK1151|CDS

ATGGTGTCACTTTTGACATTTCTTGCATTCTCTCTCTCAACTCTCTTGTTCCTGGTCTTTCTTAAAAGCAAACTTTACTGCACATGCCATGTCTGCCATTGCTATCTCAAATCTAAGTGGTCAACAGAGTATAACAATCTATGCGATTGGTACACTCATCTTCTCCAAAAGTCCTCATCTCAAACAATCCGTATTCATGTACTACGTAAAATCATCACAGCAAACCCTAACAACGTTGAACATATTCTCAAAACCAAGTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

360 aa · TkA05G447050|TK1151|PROTEIN

MVSLLTFLAFSLSTLLFLVFLKSKLYCTCHVCHCYLKSKWSTEYNNLCDWYTHLLQKSSSQTIRIHVLRKIITANPNNVEHILKTKFHNYPKGKQFSMILSDLLGNGIFNVDGDSWLFQRKMASLQFGQVSNAFGNVSYQVQTRLLPLLSSTAGDQGDGATTLSAKRALYTSPMIWKANRILNMGSERKLKEAVKNVNFFVKKVIEHKKKSGCTKTHDLLSRFMEVSNDHTFLRDVIINFVLAGRDTVASALTSFFWLIL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G447050`
TK1151 ID	TkA05G447050
OH-1004 ID	LXL04_022143
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	88.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.222 / OH-1004 81.070 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G447050

位置 Chr05:111801353-111802961 (-)

描述 Similar to CYP94C1: Cytochrome P450 94C1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g27690`	参与植物激素茉莉酰-L-异亮氨酸的氧化，茉莉酸介导的信号通路中的一种生物活性植物激素。	Characterization of a methyl jasmonate and wounding-responsive cytochrome P450 of Arabidopsis thaliana catalyzing dicarboxylic fatty acid formation in vitro.2007 · DOI: 10.1111/j.1742-4658.2007.06032.x Cytochromes P450 CYP94C1 and CYP94B3 catalyze two successive oxidation steps of plant hormone Jasmonoyl-isoleucine for catabolic turnover.2012 · DOI: 10.1074/jbc.m111.316364 Sequential oxidation of Jasmonoyl-Phenylalanine and Jasmonoyl-Isoleucine by multiple cytochrome P450 of the CYP94 family through newly identified aldehyde intermediates.2015 · DOI: 10.1016/j.phytochem.2015.06.027
`At5g63450`	羟化酶参与植物激素茉莉酰-L-异亮氨酸的氧化，茉莉酸介导的信号通路中的一种生物活性植物激素。	Endoplasmic reticulum-associated inactivation of the hormone jasmonoyl-L-isoleucine by multiple members of the cytochrome P450 94 family in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1074/jbc.m114.603084
`At3g48520`	可能催化茉莉酰-L-异亮氨酸的羟化，参与茉莉酸信号调控。	Cytochrome P450 CYP94B3 mediates catabolism and inactivation of the plant hormone jasmonoyl-L-isoleucine.2011 · DOI: 10.1073/pnas.1103542108 Arabidopsis CYP94B3 encodes jasmonyl-L-isoleucine 12-hydroxylase, a key enzyme in the oxidative catabolism of jasmonate.2011 · DOI: 10.1093/pcp/pcr110 Cytochromes P450 CYP94C1 and CYP94B3 catalyze two successive oxidation steps of plant hormone Jasmonoyl-isoleucine for catabolic turnover.2012 · DOI: 10.1074/jbc.m111.316364

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022143 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002213 defense response to insect 生物过程

GO:0006694 steroid biosynthetic process 生物过程

GO:0008203 cholesterol metabolic process 生物过程

GO:0009555 pollen development 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009694 jasmonic acid metabolic process 生物过程

GO:0010154 fruit development 生物过程

GO:0016135 saponin biosynthetic process 生物过程

GO:0048480 stigma development 生物过程

GO:0048653 anther development 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ag:AAD10204

ath:AT2G27690

ath:AT3G48520

ath:AT5G63450

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.920

排名 1 · TkA05G447050 · TK1151

细胞质0.056

排名 2 · TkA05G447050 · TK1151

细胞核0.040

排名 3 · TkA05G447050 · TK1151

溶酶体／液泡0.035

排名 4 · TkA05G447050 · TK1151

高尔基体0.035

排名 5 · TkA05G447050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08631SPO2239-74 aa

PF00067p45070-156 aa

PF00067p450181-348 aa

PF08631SPO22190-279 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G447050	`PF08631`	SPO22	39	74	0.16	12.1
TkA05G447050	`PF00067`	p450	70	156	1.2e-31	110.8
TkA05G447050	`PF00067`	p450	181	348	1.2e-31	110.8
TkA05G447050	`PF08631`	SPO22	190	279	0.16	12.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ZUX1`	拟南芥	sp\|Q9ZUX1\|C94C1_ARATH Cytochrome P450 94C1	48.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FMV7`	拟南芥	sp\|Q9FMV7\|C94B1_ARATH Cytochrome P450 94B1	42.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SMP5`	拟南芥	sp\|Q9SMP5\|C94B3_ARATH Cytochrome P450 94B3	41.700%	Swiss-Prot	中等置信

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