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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G438580
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 109504205-109508353 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3912 bp · TkA05G438580|TK1151|cDNA

AAAAAGAGAAGACCGAAATTCGTACTAGTTCACTTTAACCCTCACTTTCTCTCTCTACAAGTCGATCCAGAGTTCAGCTTGACGGCATCGACAAGGTACGCTATCTCTGTTTCTAGGGTTCCCGTTTTCTTGTTCACGATGACCTGTTTCCGGCAAAATTTAAGTACATACGTAGTTTCTTGTCACTGATCTACTCGGATTACGCTCTGAAACATGAAAGAACACGACGACGATGTCTTGCCTACCGTTAAAGAATCAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

3279 bp · TkA05G438580|TK1151|CDS

ATGAAAGAACACGACGACGATGTCTTGCCTACCGTTAAAGAATCAACAGCGACCGTTGATTCTACTCCAGCTGATGAAACTGTAACCGTGAGAGGGAAAATTGAAGGGCTGTTCGGTGAGAGAGACGAAGGAGAGGATATGGTGGTGGATGTGGTCGGAGCTGATGTGGCTGTTGATGATCGTGGGGGTACAAAGGCTGATTCGGAAGGTAAGGTAGGTATCAATGGCTTGATTGAAGAGGGATCTAAAAGAGAAATAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1092 aa · TkA05G438580|TK1151|PROTEIN

MKEHDDDVLPTVKESTATVDSTPADETVTVRGKIEGLFGERDEGEDMVVDVVGADVAVDDRGGTKADSEGKVGINGLIEEGSKREIESTDMDMDVDKVVTVEEVRVVNSEKVEVVVSDEGVKTSVEVSKDVIEENVVTTTVTEVRDNNEIVEQHTESAQELIDKTTEKESDVSSSLNFPESGSRDAHVAAVKEGLFGKDEGEDAVDNHVSSTDAVISETNEDTVHVSTESIDQQPGVDQTKTVEVATTDVQDSENVTQPM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G438580
TK1151 IDTkA05G438580
OH-1004 IDLXL04_022005
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.886 / OH-1004 98.602
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G438580
位置Chr05:109504205-109508353 (+)
描述Protein of unknown function
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g02950 可能通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平来影响基因表达。 暂无已核实直接文献
At3g09670 与 PDP1、PDP3 和 PDP6 一起，通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平，与 MSI4/FVE 和 MSI5 相互作用，以抑制 FLC、MAF4 和 MAF5 的表达，从而促进开花。 暂无已核实直接文献
At5g40340 与 PDP1、PDP2 和 PDP6 一起，与 MSI4/FVE 和 MSI5 相互作用，通过调节 PRC2 复合体功能和调控 H3K27me3 水平抑制 FLC、MAF4 和 MAF5 的表达，从而促进开花。
Arabidopsis PWWP domain proteins mediate H3K27 trimethylation on FLC and regulate flowering time.2018 · DOI: 10.1111/jipb.12630
At5g27650 与PDP2、PDP3和PDP6一起，与MSI4/FVE和MSI5相互作用，通过调节PRC2复合物的功能和调控H3K27me3水平抑制FLC、MAF4和MAF5的表达，从而促进开花。 暂无已核实直接文献
At3g05430 可能通过调节 PRC2 复合物的功能和调控 H3K27me3 水平来影响基因表达。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022005 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0040029 epigenetic regulation of gene expression 生物过程
GO:2000028 regulation of photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0035098 ESC/E(Z) complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05430
ath:AT3G09670
ath:AT5G02950
ath:AT5G27650
ath:AT5G40340
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.966
排名 1 · TkA05G438580 · TK1151
细胞质0.074
排名 2 · TkA05G438580 · TK1151
细胞膜0.037
排名 3 · TkA05G438580 · TK1151
内质网0.025
排名 4 · TkA05G438580 · TK1151
质体0.012
排名 5 · TkA05G438580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04359DUF49390-149 aa
PF25365DUF7881_N108-158 aa
PF00855PWWP552-635 aa
PF25365DUF7881_N623-679 aa
PF00855PWWP852-895 aa
PF04359DUF493930-981 aa
PF00855PWWP945-968 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G438580PF04359DUF493901499.17.7
TkA05G438580PF25365DUF7881_N1081580.01416.0
TkA05G438580PF00855PWWP5526351.7e-1764.4
TkA05G438580PF25365DUF7881_N6236790.01416.0
TkA05G438580PF00855PWWP8528951.7e-1764.4
TkA05G438580PF04359DUF4939309819.17.7
TkA05G438580PF00855PWWP9459681.7e-1764.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LYZ0拟南芥sp|Q9LYZ0|PDP5_ARATH PWWP domain-containing protein 532.000%Swiss-Prot低置信
Q9SF36拟南芥sp|Q9SF36|PDP2_ARATH PWWP domain-containing protein 253.000%Swiss-Prot低置信
Q9FNE4拟南芥sp|Q9FNE4|PDP3_ARATH PWWP domain-containing protein 347.000%Swiss-Prot低置信
F4K4D6拟南芥sp|F4K4D6|PDP1_ARATH PWWP domain-containing protein 133.900%Swiss-Prot低置信
Q9MA56拟南芥sp|Q9MA56|PDP4_ARATH PWWP domain-containing protein 446.500%Swiss-Prot低置信

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