TkA05G164390 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G164390

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 42262200-42274166 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1068 bp · TkA05G164390|TK1151|cDNA

CTGTTTTCTGCCAGATGCTCATACCAAGTGCTATATAGCAACTTGTATAATGGATCATGAGACACAGGAATATGGCAGATACAACATTTCAAACTCATCTGCCAGTAGCGATGTCTTTGAGCCTACATCAGTAAATGATGCCAAGATGCGAACATCGGTGATAGAGTGGTTGAATAGCAGTCTTCCCACTTTGAATCTTTCGGTGAACGCTTCAGATGAGGAGTTGAGAGCTTTTTTGGCCGATGGTACTATTCTGTGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1797 bp · TkA05G164390|TK1151|CDS

ATGGTGGAGCAAAAAGAACACATTTACAAAACATTTACAGAATTCCAACTTGGTGCATTGAAGGAACTAAGATTTGCTTCTCAATCAGTCCGCCAGGAAATTTTGAAAACTCAAACAAGTTACTCTGAGGATTTTGATCAATTAGGGACAAAGCTGAAAGTAATGCAAGATGCAGCGGAAAGCTATCAAGCAGCAATTAATGAAAACAAGAAGCTAAACAATGAAATTCAAGAACTAAAAGGAAATATTAGGGTTTATTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

598 aa · TkA05G164390|TK1151|PROTEIN

MVEQKEHIYKTFTEFQLGALKELRFASQSVRQEILKTQTSYSEDFDQLGTKLKVMQDAAESYQAAINENKKLNNEIQELKGNIRVYCRIRPFLPGQKEKQSVVDYIGENGELIVANPSKPGKESRRSFKFNKVYGPRATQAEVYGDIQQLVQSVLDGYNVCIFAYGQTGSGKTYTMSGPDKGSPEEWGVIYRALNDLFKISQSRSTYKYDVRVQMVEIYNEQVRDLLANDTSQKKLGILASTQSSLAVPDANVRQVSETA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G164390`
TK1151 ID	TkA05G164390
OH-1004 ID	LXL04_020308
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	92.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.498 / OH-1004 55.138 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G164390

位置 Chr05:42262200-42274166 (+)

描述 Similar to KIN14C: Kinesin-like protein KIN-14C

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g73860`	类动力蛋白 KIN-14P。	暂无已核实直接文献
`At1g18410`	类动力蛋白 KIN-14O。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0744000`	类动力蛋白 KIN-14C。	暂无已核实直接文献
`Os05g0521300`	类驱动蛋白 KIN-14K。	暂无已核实直接文献
`UniProt: Q0E2L3`	类驱动蛋白 KIN-14D。	暂无已核实直接文献
`Os06g0554700`	类动力蛋白 KIN-14M。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020308 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007017 microtubule-based process 生物过程

GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005874 microtubule 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0015630 microtubule cytoskeleton 细胞组分

GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0008017 microtubule binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G63640

ath:AT1G73860

dosa:Os01g0744000

dosa:Os02g0229500

dosa:Os02g0229600

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.754

排名 1 · TkA05G164390 · TK1151

细胞核0.209

排名 2 · TkA05G164390 · TK1151

细胞膜0.132

排名 3 · TkA05G164390 · TK1151

高尔基体0.074

排名 4 · TkA05G164390 · TK1151

内质网0.042

排名 5 · TkA05G164390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13863DUF42004-83 aa

PF29308YEL043W_helical16-80 aa

PF15796KELK20-80 aa

PF13805Pil132-80 aa

PF15397DUF461833-80 aa

PF06156YabA38-168 aa

PF02403Seryl_tRNA_N43-79 aa

PF27558MTUS1_CCDC69_CC243-81 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G164390	`PF13863`	DUF4200	4	83	1.9	9.5
TkA05G164390	`PF29308`	YEL043W_helical	16	80	1.8	9.4
TkA05G164390	`PF15796`	KELK	20	80	7.3	7.9
TkA05G164390	`PF13805`	Pil1	32	80	0.056	13.7
TkA05G164390	`PF15397`	DUF4618	33	80	0.62	10.2
TkA05G164390	`PF06156`	YabA	38	168	0.05	14.9
TkA05G164390	`PF02403`	Seryl_tRNA_N	43	79	8.3	7.4
TkA05G164390	`PF27558`	MTUS1_CCDC69_CC2	43	81	9.0	7.3
TkA05G164390	`PF01920`	Prefoldin_2	44	93	0.053	14.2
TkA05G164390	`PF04977`	DivIC	56	84	0.26	11.8
TkA05G164390	`PF07352`	Phage_Mu_Gam	56	98	1.3	9.6
TkA05G164390	`PF07989`	Cnn_1N	56	84	2.0	9.3
TkA05G164390	`PF06005`	ZapB	61	80	0.42	11.8
TkA05G164390	`PF12329`	TMF_DNA_bd	67	83	3.5	8.4
TkA05G164390	`PF16796`	Microtub_bd	68	227	2.8e-46	158.0
TkA05G164390	`PF16808`	PKcGMP_CC	74	80	1.3	9.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q0WN69`	拟南芥	sp\|Q0WN69\|KN14P_ARATH Kinesin-like protein KIN-14P	66.900%	Swiss-Prot	高置信
`F4IAR2`	拟南芥	sp\|F4IAR2\|KN14O_ARATH Kinesin-like protein KIN-14O	66.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q5JKW1`	水稻	sp\|Q5JKW1\|KN14C_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14C	63.400%	Swiss-Prot	高置信
`B9FL70`	水稻	sp\|B9FL70\|KN14K_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14K	62.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q0E2L3`	水稻	sp\|Q0E2L3\|KN14D_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14D	64.400%	Swiss-Prot	高置信
`B9FTR1`	水稻	sp\|B9FTR1\|KN14M_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14M	47.400%	Swiss-Prot	中等置信

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