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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G359110
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 90493806-90495279 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1212 bp · TkA04G359110|TK1151|cDNA

ATGTCAAGTTTTCAAACTGATCAGTTTTTTAGTAGTCGTGAAAATGTAGAGGATTGGGTGCGAAATGTAGGACGGAATCTCGGGTATGTGGTTGTTACTAGAAGAACAAAGCAAAAAAATGGCTATTTGTCGAGAGTTATTTTTATGTGTGATCGGGGTGGTGTGTTTAAAGGTCAGGAGACGTCCTCCAGAAATACTAGAACAAGAAAAATAGATTGTCCATTCGAATTGCATGCTTGTTACTATAAGTCAAATGATGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1212 bp · TkA04G359110|TK1151|CDS

ATGTCAAGTTTTCAAACTGATCAGTTTTTTAGTAGTCGTGAAAATGTAGAGGATTGGGTGCGAAATGTAGGACGGAATCTCGGGTATGTGGTTGTTACTAGAAGAACAAAGCAAAAAAATGGCTATTTGTCGAGAGTTATTTTTATGTGTGATCGGGGTGGTGTGTTTAAAGGTCAGGAGACGTCCTCCAGAAATACTAGAACAAGAAAAATAGATTGTCCATTCGAATTGCATGCTTGTTACTATAAGTCAAATGATGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

403 aa · TkA04G359110|TK1151|PROTEIN

MSSFQTDQFFSSRENVEDWVRNVGRNLGYVVVTRRTKQKNGYLSRVIFMCDRGGVFKGQETSSRNTRTRKIDCPFELHACYYKSNDVWMLKVKNDQHNHEPAMFLEGRPFARRLTPKEVEMVAEMRRNNVPPWKILEVLKSHNENNVSTIKTIYNESNKIRIDERAGRSQMQVVFGFLHSKKYIFEYRKNDTTNALEDIFFVHPTSLVICRAFPQIMMMDATYKTNKYKMHFLEIVGVTSTNTTFCIGFGFMNEEKESNY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G359110
TK1151 IDTkA04G359110
OH-1004 IDLXL04_030089
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.067 / OH-1004 86.261
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G359110
位置Chr04:90493806-90495279 (-)
描述Similar to CHGG_01239: PKS-NRPS hybrid synthetase CHGG_01239 (Chaetomium globosum (strain ATCC 6205 / CBS 148.51 / DSM 1962 / NBRC 6347 / NRRL 1970)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030089 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006633 fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009403 toxin biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0004312 fatty acid synthase activity 分子功能
GO:0004315 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase activity 分子功能
GO:0008168 methyltransferase activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能
GO:0016853 isomerase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G52520
ath:AT2G27110
ath:AT2G32250
ath:AT4G38180
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.927
排名 1 · TkA04G359110 · TK1151
细胞质0.143
排名 2 · TkA04G359110 · TK1151
线粒体0.018
排名 3 · TkA04G359110 · TK1151
细胞膜0.014
排名 4 · TkA04G359110 · TK1151
细胞外0.010
排名 5 · TkA04G359110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08731AFT10-100 aa
PF03101FAR124-100 aa
PF15292Treslin_M84-140 aa
PF07261DnaB_2110-153 aa
PF03101FAR1124-144 aa
PF21056ZSWIM1-3_RNaseH-like136-153 aa
PF28854Ig_BT4661_3rd138-195 aa
PF08731AFT189-212 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G359110PF08731AFT101007.8e-0833.2
TkA04G359110PF03101FAR1241009.2e-0523.8
TkA04G359110PF15292Treslin_M841400.04414.6
TkA04G359110PF07261DnaB_21101530.03914.5
TkA04G359110PF03101FAR11241449.2e-0523.8
TkA04G359110PF21056ZSWIM1-3_RNaseH-like1361534.7e-1246.7
TkA04G359110PF28854Ig_BT4661_3rd1381950.0813.9
TkA04G359110PF08731AFT1892127.8e-0833.2
TkA04G359110PF21056ZSWIM1-3_RNaseH-like1903004.7e-1246.7
TkA04G359110PF10551MULE2173113.4e-2692.2
TkA04G359110PF03101FAR12372579.2e-0523.8
TkA04G359110PF00872Transposase_mut2503780.003417.0
TkA04G359110PF13610DDE_Tnp_IS2402643000.01616.0
TkA04G359110PF03101FAR13683779.2e-0523.8
TkA04G359110PF13610DDE_Tnp_IS2403743940.01616.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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