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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G107480
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 27939230-27942386 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2039 bp · TkA04G107480|TK1151|cDNA

CTCTCCAGCGAGCAAGAAGCTGAAGGAAAATGGCAGAGACACCACAACACATGGCCGGAAAAGACACGGGCTGTGGTTTCATAGGGGCCATTTTTAGTAACAAGCCCCGGAAAACAAGACCAGTACCACGACTCGAAGCCTCCAAAGAGCACCGGCAAACCCAATTTCCCAGCAACCATACTTCAAAAAGACCACCGCGAACCCACAGCCACACCATCACCACCACGGCTGCCACGGCCACAGAAATAGTATACACCGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1791 bp · TkA04G107480|TK1151|CDS

ATGGCAGAGACACCACAACACATGGCCGGAAAAGACACGGGCTGTGGTTTCATAGGGGCCATTTTTAGTAACAAGCCCCGGAAAACAAGACCAGTACCACGACTCGAAGCCTCCAAAGAGCACCGGCAAACCCAATTTCCCAGCAACCATACTTCAAAAAGACCACCGCGAACCCACAGCCACACCATCACCACCACGGCTGCCACGGCCACAGAAATAGTATACACCGGCTTCTCAAAACCAGTTGCAAGAAATCCTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

596 aa · TkA04G107480|TK1151|PROTEIN

MAETPQHMAGKDTGCGFIGAIFSNKPRKTRPVPRLEASKEHRQTQFPSNHTSKRPPRTHSHTITTTAATATEIVYTGFSKPVARNPPPPPPKTKLPIAVKRPPTTVKRPATVRSNTPVYSTYDSVSKSALYSVSQVTNITYTKQLRKEPSFTSSELSLRISVRGKTKPTGSTVSSYRASSNHVTVPGHLGNLMKRKPEKPQSHEKLGNVYGNSAKKWDSESFKNMGNEKYKQGMFDEAISLYTEAIGMDSTIASYYSNRS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G107480
TK1151 IDTkA04G107480
OH-1004 IDLXL04_035802
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G107480
位置Chr04:27939230-27942386 (-)
描述Similar to TTL1: TPR repeat-containing thioredoxin TTL1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g42580 参与渗透压和盐胁迫耐受性。 暂无已核实直接文献
At3g58620 参与渗透压和盐胁迫耐受性。
The Arabidopsis tetratricopeptide thioredoxin-like gene family is required for osmotic stress tolerance and male sporogenesis.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.188920

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035802 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G53300
ath:AT2G42580
ath:AT3G14950
ath:AT3G58620
mmu:56354
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.541
排名 1 · TkA04G107480 · TK1151
细胞核0.289
排名 2 · TkA04G107480 · TK1151
细胞膜0.198
排名 3 · TkA04G107480 · TK1151
质体0.068
排名 4 · TkA04G107480 · TK1151
高尔基体0.050
排名 5 · TkA04G107480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13431TPR_17195-215 aa
PF13414TPR_11196-211 aa
PF29407CFAP70_TPR_C213-305 aa
PF13424TPR_12218-248 aa
PF25575TPR_BSK1_C219-291 aa
PF00515TPR_1220-249 aa
PF07719TPR_2221-246 aa
PF13424TPR_12223-248 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G107480PF13431TPR_171952151.7e-1144.1
TkA04G107480PF13414TPR_111962112.1e-1660.0
TkA04G107480PF29407CFAP70_TPR_C2133053.2e-0627.6
TkA04G107480PF13424TPR_122182485.7e-0730.3
TkA04G107480PF25575TPR_BSK1_C2192919.3e-1039.1
TkA04G107480PF00515TPR_12202495.9e-2380.4
TkA04G107480PF07719TPR_22212468.3e-1966.8
TkA04G107480PF13424TPR_122232485.7e-0730.3
TkA04G107480PF13181TPR_82242506.7e-0935.9
TkA04G107480PF13432TPR_162252865.4e-1143.4
TkA04G107480PF13414TPR_112262632.1e-1660.0
TkA04G107480PF13428TPR_142282460.0001922.5
TkA04G107480PF12895ANAPC32302508.2e-0523.6
TkA04G107480PF13174TPR_62302460.0004621.4
TkA04G107480PF14559TPR_192312504.1e-1453.4
TkA04G107480PF13176TPR_72312481.2e-0525.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SIN1拟南芥sp|Q9SIN1|TTL3_ARATH Inactive TPR repeat-containing thioredoxin TTL345.500%Swiss-Prot低置信
Q84JR9拟南芥sp|Q84JR9|TTL4_ARATH TPR repeat-containing thioredoxin TTL442.000%Swiss-Prot中等置信

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