TkA03G399090 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G399090

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 99181205-99194351 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

6042 bp · TkA03G399090|TK1151|cDNA

ACAACATCCAAGAACACCAACTTTTATCTAATTTCTTTTTTATTTTTTTTTTTCAAGTTTTGTTTTTTTTTAAAATAACATTACAATAATTAAAAATTACAACAATAAAAATAGTCGTGTTTCTTTAACGATTAAAAAAATATTTATGCTAAAGTTGGATGTCGCAGATTTTGTAGACTTTCGTTGGATACTTGGATTTGGATGTTGCTATTATAGGTTGCTGTTATAGGCCTCTTAATAGTATTTCGACATTATAGTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1506 bp · TkA03G399090|TK1151|CDS

ATGGCTACCGAAAATGGCGACAATTTCAGGTACTTGGTTGTGCAGCCTGAAAATGGCGGACTTACGGACCTTTTAAGATACGGAATTTGGGGCAACAAAGCCAGCGGCGCAAAGTTCTTCGAGAGTTCCGACGAAGGTACCCTCCACGAGGAACTGCCGGTGGGTGGCGACAGAGAAACGCCGGCCCATAGATGGGTGATCATAGTATCCATTGTAATGAGGAAGTTGATAAAGTTTTTTGGCAAGCCAATGGAATGGAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

501 aa · TkA03G399090|TK1151|PROTEIN

MATENGDNFRYLVVQPENGGLTDLLRYGIWGNKASGAKFFESSDEGTLHEELPVGGDRETPAHRWVIIVSIVMRKLIKFFGKPMEWTGYVVDFILNLLSFNGGLLSLLFNFLQGKMVIPVRGSATFISTIGHIDGRIDLQHPGDAFANIELDARNKSLMDLCMMASKLAYENAVVIKNVVNLNWKMHFIDFYNCWNDYQKERSTQVFIFSDKPTDANLIVISFRGTEPFDADDWITDFDYSWYEIPKLGKVHMGFLEAMG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G399090`
TK1151 ID	TkA03G399090
OH-1004 ID	LXL04_009116
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	91.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G399090

位置 Chr03:99181205-99194351 (+)

描述 Similar to OBL1: Triacylglycerol lipase OBL1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g14360`	酸性脂肪酶，可水解各种三酰甘油，对酰基链没有明显偏好。	Characterization of the enzymatic activity and physiological function of the lipid droplet-associated triacylglycerol lipase AtOBL1.2018 · DOI: 10.1111/nph.14902

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009116 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005811 lipid droplet 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0090406 pollen tube 细胞组分

GO:0004806 triacylglycerol lipase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

GO:0047372 monoacylglycerol lipase activity 分子功能

GO:0120516 diacylglycerol lipase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G14360

nta:107788962

rcu:8284735

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.318

排名 1 · TkA03G399090 · TK1151

细胞质0.214

排名 2 · TkA03G399090 · TK1151

高尔基体0.153

排名 3 · TkA03G399090 · TK1151

线粒体0.134

排名 4 · TkA03G399090 · TK1151

溶酶体／液泡0.133

排名 5 · TkA03G399090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26363Phospholipase-like203-239 aa

PF11187Mbeg1-like214-228 aa

PF01764Lipase_3220-394 aa

PF11187Mbeg1-like294-356 aa

PF12695Abhydrolase_5294-329 aa

PF12146Hydrolase_4302-349 aa

PF26363Phospholipase-like303-328 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G399090	`PF26363`	Phospholipase-like	203	239	9.5e-06	25.7
TkA03G399090	`PF11187`	Mbeg1-like	214	228	0.021	14.9
TkA03G399090	`PF01764`	Lipase_3	220	394	1.5e-35	122.8
TkA03G399090	`PF11187`	Mbeg1-like	294	356	0.021	14.9
TkA03G399090	`PF12695`	Abhydrolase_5	294	329	0.054	14.0
TkA03G399090	`PF12146`	Hydrolase_4	302	349	0.031	14.3
TkA03G399090	`PF26363`	Phospholipase-like	303	328	9.5e-06	25.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4JFU8`	拟南芥	sp\|F4JFU8\|OBL1_ARATH Triacylglycerol lipase OBL1	58.700%	Swiss-Prot	高置信

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