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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G169860
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 43047430-43048320 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

846 bp · TkA03G169860|TK1151|cDNA

ATGAAGCCACCGGAAAAAACCATCAAGTGCCCAAGATGTGATTCACCCAACACAAAATTCTGCTATTATAACAACTACAGTCTCACCCAGCCAAGACACTTTTGCAAGACATGTAGAAGGTACTGGACAAAAGGTGGCGCTCTGAGAAACGTTCCAATCGGCGGCGGTTGCCGGAAAAACAAGAAGACAAGATCAAGCTCTTTAAGGTTCATCAATGGCGATTCCTCCTCCAAAGACTCATCTTTAAATATCGGAGGTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

846 bp · TkA03G169860|TK1151|CDS

ATGAAGCCACCGGAAAAAACCATCAAGTGCCCAAGATGTGATTCACCCAACACAAAATTCTGCTATTATAACAACTACAGTCTCACCCAGCCAAGACACTTTTGCAAGACATGTAGAAGGTACTGGACAAAAGGTGGCGCTCTGAGAAACGTTCCAATCGGCGGCGGTTGCCGGAAAAACAAGAAGACAAGATCAAGCTCTTTAAGGTTCATCAATGGCGATTCCTCCTCCAAAGACTCATCTTTAAATATCGGAGGTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

281 aa · TkA03G169860|TK1151|PROTEIN

MKPPEKTIKCPRCDSPNTKFCYYNNYSLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKNKKTRSSSLRFINGDSSSKDSSLNIGGLGGLNQFPSNSSNNPPAYLNLDSLACTFPLMKQDHQLHGGLNTSFQDIGVTNNLATSIESLSSINQDLHWKLQQQRLAALFGGGGVVGGGGETDQQQHQSQIVIQNQSQKLQPILFHNLEIPKPSQTSSMSGDLRKDGGIGSVGLETEWFFDNSNYAPMNVDATNPAENYQNGS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G169860
TK1151 IDTkA03G169860
OH-1004 IDLXL04_007389
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)94.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 89.970
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G169860
位置Chr03:43047430-43048320 (+)
描述Similar to DOF5.7: Dof zinc finger protein DOF5.7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g65590 能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g60200 转录因子，能够特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列（通过相似性推测）。
Mobile PEAR transcription factors integrate positional cues to prime cambial growth.2019 · DOI: 10.1038/s41586-018-0839-y
At4g38000 能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。
Overexpression of AtDOF4.7, an Arabidopsis DOF family transcription factor, induces floral organ abscission deficiency in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.153247
At2g28810 能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g51700 能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007389 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009640 photomorphogenesis 生物过程
GO:0009944 polarity specification of adaxial/abaxial axis 生物过程
GO:0010052 guard cell differentiation 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010497 plasmodesmata-mediated intercellular transport 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0090057 root radial pattern formation 生物过程
GO:1902066 regulation of cell wall pectin metabolic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G37590
ath:AT3G55370
ath:AT5G02460
ath:AT5G60200
ath:AT5G65590
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.966
排名 1 · TkA03G169860 · TK1151
细胞质0.121
排名 2 · TkA03G169860 · TK1151
细胞膜0.018
排名 3 · TkA03G169860 · TK1151
内质网0.011
排名 4 · TkA03G169860 · TK1151
质体0.008
排名 5 · TkA03G169860 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23451Zn_ribbon_PaaD4-39 aa
PF22191IBR_15-44 aa
PF02701Zn_ribbon_Dof6-62 aa
PF10122Zn_ribbon_Com7-14 aa
PF10122Zn_ribbon_Com35-53 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G169860PF23451Zn_ribbon_PaaD4390.01615.6
TkA03G169860PF22191IBR_15442.48.9
TkA03G169860PF02701Zn_ribbon_Dof6622.1e-33115.0
TkA03G169860PF10122Zn_ribbon_Com7140.03914.1
TkA03G169860PF10122Zn_ribbon_Com35530.03914.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LSL6拟南芥sp|Q9LSL6|DOF57_ARATH Dof zinc finger protein DOF5.737.700%Swiss-Prot中等置信
Q84TE9拟南芥sp|Q84TE9|DOF53_ARATH Dof zinc finger protein DOF5.374.300%Swiss-Prot低置信
Q84K52拟南芥sp|Q84K52|DOF47_ARATH Dof zinc finger protein DOF4.746.700%Swiss-Prot中等置信
Q9ZV33拟南芥sp|Q9ZV33|DOF22_ARATH Dof zinc finger protein DOF2.282.000%Swiss-Prot低置信
O82155拟南芥sp|O82155|DOF17_ARATH Dof zinc finger protein DOF1.775.400%Swiss-Prot低置信

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