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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G351550
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 89402586-89407779 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3838 bp · TkA02G351550|TK1151|cDNA

CTTTCTTCAACAAAATCCATGCATCTCTTTCCTTTTGAAGAAGTCTTATCCCCAATTTATCTCAACCTTCTGTCATCTTCTAGGTGTATTTACTCACCTACCTCATTTACCCCATCGACAAAAACCCTTCGGCCAAAATCAAATGAAACTCCTTTAACCTTTTTATCATGTGATTATCATTATTATAGGCATGAACAAGTCCTGTAGCAAATAACCCCTTCAACTTGTCCAATGTCCACAGATAGATTCTCTGTCTTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2763 bp · TkA02G351550|TK1151|CDS

ATGATGAGTGTTCTTGTTTGGAATATTGTCGTTGCACTGCTGCTAAATTTGGGGGTTTTCCTAACAAATGGTTTGACCACACATAACGCATCTACAAGACCAGCTATTGTGAATATCGGAGCTATTTTCAGTTTTGATTCGACTATTGGAAGAGTTGCTAAGGTTGCAATTGAGGAAGCTGTCAAAGATGTTAATGCAAATTCCTCTGTTCTTCGTGGGACAGAACTTAAAATTGAAATGCGAAGCTCAAATTGCAGTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

920 aa · TkA02G351550|TK1151|PROTEIN

MMSVLVWNIVVALLLNLGVFLTNGLTTHNASTRPAIVNIGAIFSFDSTIGRVAKVAIEEAVKDVNANSSVLRGTELKIEMRSSNCSGFLGMVGALQFMETDTVAIVGPQSSVVAHIISHVANELQVPLLSFAATDPTLSNLQFPYFIRSTQSDLHQMTAVSEIIDFYTWREVIAIFIDDDYGRNGILALDDALAARRCRISYKVGIPPGSESESGYDRSGIMDILVRIALMESRVIVLHVYPDIGFLVFSVARYLGMMED...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G351550
TK1151 IDTkA02G351550
OH-1004 IDLXL04_013908
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)58.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.413 / OH-1004 38.254
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G351550
位置Chr02:89402586-89407779 (-)
描述Similar to GLR3.6: Glutamate receptor 3.6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g42540 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道，至少在根和下胚轴中（可能）。
Calcium entry mediated by GLR3.3, an Arabidopsis glutamate receptor with a broad agonist profile.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.088989
Glutamate receptor subtypes evidenced by differences in desensitization and dependence on the GLR3.3 and GLR3.4 genes.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.108134
Glutamate receptor-like channel3.3 is involved in mediating glutathione-triggered cytosolic calcium transients, transcriptional changes, and innate immunity responses in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.217208
Involvement of the glutamate receptor AtGLR3.3 in plant defense signaling and resistance to Hyaloperonospora arabidopsidis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12311
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478
Real-time, in vivo intracellular recordings of caterpillar-induced depolarization waves in sieve elements using aphid electrodes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12807
At3g51480 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道。
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478
At4g35290 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道（可能）。
Overexpression of the AtGluR2 gene encoding an Arabidopsis homolog of mammalian glutamate receptors impairs calcium utilization and sensitivity to ionic stress in transgenic plants.2001 · DOI: 10.1093/pcp/pce008
Interacting glutamate receptor-like proteins in Phloem regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.110668
At1g05200 谷氨酸门控受体，可能至少在下胚轴中作为非选择性阳离子通道（可能）。
AtGLR3.4, a glutamate receptor channel-like gene is sensitive to touch and cold.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-1551-3
Glutamate receptor subtypes evidenced by differences in desensitization and dependence on the GLR3.3 and GLR3.4 genes.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.108134
Dual localization of plant glutamate receptor AtGLR3.4 to plastids and plasmamembrane.2011 · DOI: 10.1016/j.bbabio.2010.11.008
Interacting glutamate receptor-like proteins in Phloem regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.110668
Glutamate Receptor Homolog3.4 is Involved in Regulation of Seed Germination Under Salt Stress in Arabidopsis.2018 · DOI: 10.1093/pcp/pcy034

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0585200 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。
A rice glutamate receptor-like gene is critical for the division and survival of individual cells in the root apical meristem.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.037713
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013908 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0007267 cell-cell signaling 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009630 gravitropism 生物过程
GO:0009864 induced systemic resistance, jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0071230 cellular response to amino acid stimulus 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G42540
ath:AT3G51480
osa:124544569
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.801
排名 1 · TkA02G351550 · TK1151
内质网0.076
排名 2 · TkA02G351550 · TK1151
细胞质0.071
排名 3 · TkA02G351550 · TK1151
溶酶体／液泡0.059
排名 4 · TkA02G351550 · TK1151
高尔基体0.031
排名 5 · TkA02G351550 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13458Peripla_BP_647-338 aa
PF01094ANF_receptor54-412 aa
PF10177DUF237180-108 aa
PF10177DUF2371382-443 aa
PF10613Lig_chan-Glu_bd488-575 aa
PF00497SBP_bac_3530-813 aa
PF00060Lig_chan594-846 aa
PF14296O-ag_pol_Wzy625-667 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G351550PF13458Peripla_BP_6473381.3e-0525.8
TkA02G351550PF01094ANF_receptor544121.7e-91307.6
TkA02G351550PF10177DUF2371801080.1313.3
TkA02G351550PF10177DUF23713824430.1313.3
TkA02G351550PF10613Lig_chan-Glu_bd4885755.8e-0833.6
TkA02G351550PF00497SBP_bac_35308132.1e-0731.5
TkA02G351550PF00060Lig_chan5948466.6e-39133.8
TkA02G351550PF14296O-ag_pol_Wzy6256670.639.4
TkA02G351550PF27867Membra_charge6526723.28.5
TkA02G351550PF10177DUF23718298470.1313.3
TkA02G351550PF27867Membra_charge8348623.28.5
TkA02G351550PF14296O-ag_pol_Wzy8388640.639.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C8E7拟南芥sp|Q9C8E7|GLR33_ARATH Glutamate receptor 3.363.200%Swiss-Prot高置信
Q84W41拟南芥sp|Q84W41|GLR36_ARATH Glutamate receptor 3.655.600%Swiss-Prot高置信
Q93YT1拟南芥sp|Q93YT1|GLR32_ARATH Glutamate receptor 3.256.300%Swiss-Prot高置信
Q8GXJ4拟南芥sp|Q8GXJ4|GLR34_ARATH Glutamate receptor 3.456.500%Swiss-Prot高置信
Q7XP59水稻sp|Q7XP59|GLR31_ORYSJ Glutamate receptor 3.157.200%Swiss-Prot高置信

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