TkA02G114660 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G114660

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 29950855-29953351 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1658 bp · TkA02G114660|TK1151|cDNA

CATGCTGGGCCCACACACACTTCCGCTCTCATAAATTCAACAGCTCTTTCCCTCTCGTTTCACCAATCGCTCTTCACCGCAGATTAGCCGGTCCTCCGGCGAAATCATTCATAAATGCGTTTCATCCGGCTACATAATAACAGCTCCGGCTCATTCAATTGTTGCTTTTTCTGCCATTTTGAGCACATTTATGATGGACGATATGAATGTCTTAGTACACATGGCGCTCTAATCGTTGCTACCTAGACAACTTGTTCCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

870 bp · TkA02G114660|TK1151|CDS

ATGTCGGGGACGAGGATGCCCACGTGGAAGGAGAGGGAGAACAACAAGAGGAGAGAGAGGAGGAGGAGAGCGATCTCGGCGAAGATATTCGCCGGCCTGAGATTGTACGGGAACTACAAGCTGCCAAAGCACTGTGATAACAACGAGGTCCTCAAAGCCCTCGCCGACGAGGCTGGCTGGACCGTCGAATCGGACGGCACCACATATCGTAAGGGATCCAAGCCCGTGGAATGGGCCCACATTGGCGGTGGTTCAATGTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

289 aa · TkA02G114660|TK1151|PROTEIN

MSGTRMPTWKERENNKRRERRRRAISAKIFAGLRLYGNYKLPKHCDNNEVLKALADEAGWTVESDGTTYRKGSKPVEWAHIGGGSMSASPGSSYQPSPYASCNPSPPSSSIASPTTNPHHDSLIPWLKNLSSSSSSSSMSSKLPHSYIHNGSMSAPVTPPVSSPTAQSPPRIKTNSNWGAPSLSWFSGVRVPQSGPASPTFTLMAANPFGFRETGLGQGGSRMWTPGQSGTCSPAIPSGFDNNADIPMAEVISEEEFAFG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G114660`
TK1151 ID	TkA02G114660
OH-1004 ID	LXL04_027422
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	55.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.654 / OH-1004 81.606 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G114660

位置 Chr02:29950855-29953351 (-)

描述 Similar to BEH4: BES1/BZR1 homolog protein 4

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g78700`	BES1/BZR1 同源蛋白 4。	暂无已核实直接文献
`At4g18890`	BES1/BZR1同源蛋白3。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0203000`	可能在油菜素甾醇信号中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`Os06g0552300`	可能在油菜素甾醇信号中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`Os02g0233200`	可能在油菜素甾醇信号中发挥作用。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027422 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0003677 DNA binding 分子功能

GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G78700

ath:AT4G18890

dosa:Os01g0203000

dosa:Os02g0233200

dosa:Os06g0552300

osa:9267338

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.950

排名 1 · TkA02G114660 · TK1151

细胞质0.189

排名 2 · TkA02G114660 · TK1151

细胞膜0.021

排名 3 · TkA02G114660 · TK1151

线粒体0.014

排名 4 · TkA02G114660 · TK1151

内质网0.011

排名 5 · TkA02G114660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05687BES1_N3-118 aa

PF05687BES1_N128-172 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G114660	`PF05687`	BES1_N	3	118	3.8e-53	180.6
TkA02G114660	`PF05687`	BES1_N	128	172	3.8e-53	180.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ZV88`	拟南芥	sp\|Q9ZV88\|BEH4_ARATH BES1/BZR1 homolog protein 4	61.000%	Swiss-Prot	高置信
`O49404`	拟南芥	sp\|O49404\|BEH3_ARATH BES1/BZR1 homolog protein 3	63.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q0JPT4`	水稻	sp\|Q0JPT4\|BZR2_ORYSJ Protein BZR1 homolog 2	53.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q5Z9E5`	水稻	sp\|Q5Z9E5\|BZR3_ORYSJ Protein BZR1 homolog 3	49.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q6EUF1`	水稻	sp\|Q6EUF1\|BZR4_ORYSJ Protein BZR1 homolog 4	40.300%	Swiss-Prot	中等置信

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