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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G077220
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 20055416-20059336 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2225 bp · TkA02G077220|TK1151|cDNA

AAAATGCACAAAAAATATAGTTACAATTATTGGATTTAGTTTTTAATTTTAATCTGGATACTATAATTAGGTTTTATTTGCTTGGTTGTGTTCAAAGCTAGCATATGGTGTGTCAGGTCCTCTGTATCTGGTTGAGTAGTTTATGAGGAATTAAGGCTTTCAGCTTGCCAGAAATGAATCGGAAATTGCCTTTGATCCTTTATTGGTTTATTTTGGGAATTTTTAATCTCGTAAAATTTTATGGGAATGATGAAGGTGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1833 bp · TkA02G077220|TK1151|CDS

ATGAATCGGAAATTGCCTTTGATCCTTTATTGGTTTATTTTGGGAATTTTTAATCTCGTAAAATTTTATGGGAATGATGAAGGTGATGCATTGAATGACCTGAAGACACAATTAAAAGATCCTAACAATATTTTGAAAAGTTGGGATTCGACCCTTGCCAATCCATGTACTTGGTTTGGTGTAACTTGCAACAATGAGAATAGTTTTATTCGACTTGATCTTGGAAACGCAAGCTTGTCTGGTCAAATGGGTACACAGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

610 aa · TkA02G077220|TK1151|PROTEIN

MNRKLPLILYWFILGIFNLVKFYGNDEGDALNDLKTQLKDPNNILKSWDSTLANPCTWFGVTCNNENSFIRLDLGNASLSGQMGTQLVRLRNLQYLELFGNNINGRIPNEIGNLTKLVNLELYMNRLEGNIPDTLGNLQHLCNLSLSNNNLTGAIPILLNTIASLQVIDLSNNFLIGDVPFNGSFSMFIASSFANNPNLRFVPRVPQAPPRLPRGSPHSQYFSVGNNDVGAISEGFVVGLALVFAGRAIALTLRFCKKRQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G077220
TK1151 IDTkA02G077220
OH-1004 IDLXL04_017066
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)87.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G077220
位置Chr02:20055416-20059336 (+)
描述Similar to BAK1: BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g33430 双特异性激酶作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
The BRI1-associated kinase 1, BAK1, has a brassinolide-independent role in plant cell-death control.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.046
BAK1 and BKK1 regulate brassinosteroid-dependent growth and brassinosteroid-independent cell-death pathways.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.036
Arabidopsis SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE proteins serve brassinosteroid-dependent and -independent signaling pathways.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123216
Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106
Phosphorylation of receptor-like cytoplasmic kinases by bacterial flagellin.2010 · DOI: 10.4161/psb.11500
The Arabidopsis leucine-rich repeat receptor-like kinases BAK1/SERK3 and BKK1/SERK4 are required for innate immunity to hemibiotrophic and biotrophic pathogens.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.084301
Structure of the pseudokinase domain of BIR2, a regulator of BAK1-mediated immune signaling in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1016/j.jsb.2014.02.005
Phytosulfokine Regulates Growth in Arabidopsis through a Response Module at the Plasma Membrane That Includes CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED CHANNEL17, H+-ATPase, and BAK1.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00306
An RLP23-SOBIR1-BAK1 complex mediates NLP-triggered immunity.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.140
The SCOOP12 peptide regulates defense response and root elongation in Arabidopsis thaliana.2019 · DOI: 10.1093/jxb/ery454
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w
At1g71830 双特异性激酶作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
Role of threonines in the Arabidopsis thaliana somatic embryogenesis receptor kinase 1 activation loop in phosphorylation.2001 · DOI: 10.1074/jbc.m102381200
In vivo hexamerization and characterization of the Arabidopsis AAA ATPase CDC48A complex using forster resonance energy transfer-fluorescence lifetime imaging microscopy and fluorescence correlation spectroscopy.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.103986

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8BB68 参与防御反应的 LRR 受体激酶。 暂无已核实直接文献
Os08g0174700 LRR 受体激酶参与防御反应。
Engineering OsBAK1 gene as a molecular tool to improve rice architecture for high yield.2009 · DOI: 10.1111/j.1467-7652.2009.00444.x
A subset of OsSERK genes, including OsBAK1, affects normal growth and leaf development of rice.2011 · DOI: 10.1007/s10059-011-0178-4
Os04g0457800 LRR 受体激酶参与体细胞胚胎发生的正向调节和对稻瘟病菌病原体 Magnaporthe oryzae 的防御反应。
Rice SERK1 gene positively regulates somatic embryogenesis of cultured cell and host defense response against fungal infection.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-1534-4
An XA21-associated kinase (OsSERK2) regulates immunity mediated by the XA21 and XA3 immune receptors.2014 · DOI: 10.1093/mp/ssu003
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017066 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0040008 regulation of growth 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045089 positive regulation of innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34210
ath:AT4G33430
dosa:Os04g0457800
dosa:Os08g0174700
osa:4336035
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.856
排名 1 · TkA02G077220 · TK1151
内质网0.081
排名 2 · TkA02G077220 · TK1151
细胞质0.075
排名 3 · TkA02G077220 · TK1151
细胞核0.054
排名 4 · TkA02G077220 · TK1151
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · TkA02G077220 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_225-64 aa
PF00560LRR_171-82 aa
PF13855LRR_871-103 aa
PF23598LRR_1472-170 aa
PF13516LRR_691-104 aa
PF12799LRR_492-127 aa
PF00560LRR_192-114 aa
PF23211LRR_LRWD192-170 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G077220PF08263LRRNT_225641.4e-1248.3
TkA02G077220PF00560LRR_171823.2e-0832.8
TkA02G077220PF13855LRR_8711037.3e-0729.6
TkA02G077220PF23598LRR_14721705.8e-0832.6
TkA02G077220PF13516LRR_6911041.99.4
TkA02G077220PF12799LRR_4921277e-0936.4
TkA02G077220PF00560LRR_1921143.2e-0832.8
TkA02G077220PF23211LRR_LRWD1921700.003517.8
TkA02G077220PF29252LRR_NLRC41111520.2911.0
TkA02G077220PF00560LRR_11161383.2e-0832.8
TkA02G077220PF13855LRR_81161737.3e-0729.6
TkA02G077220PF13516LRR_61391531.99.4
TkA02G077220PF12799LRR_41401807e-0936.4
TkA02G077220PF00560LRR_11401593.2e-0832.8
TkA02G077220PF23211LRR_LRWD11561860.003517.8
TkA02G077220PF00560LRR_11641803.2e-0832.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94F62拟南芥sp|Q94F62|BAK1_ARATH BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 165.000%Swiss-Prot高置信
Q94AG2拟南芥sp|Q94AG2|SERK1_ARATH Somatic embryogenesis receptor kinase 166.400%Swiss-Prot高置信
B8BB68水稻sp|B8BB68|BAK1_ORYSI LRR receptor kinase BAK164.100%Swiss-Prot高置信
Q6Z4U4水稻sp|Q6Z4U4|BAK1_ORYSJ LRR receptor kinase BAK164.500%Swiss-Prot高置信
Q7XV05水稻sp|Q7XV05|SERK2_ORYSJ LRR receptor kinase SERK265.700%Swiss-Prot高置信

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