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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G623230
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 157314229-157316736 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2409 bp · TkA01G623230|TK1151|cDNA

GATAATAGTACTATTCATATTTAATAGACCTCTTTGTTTTAGTGCGTGGAACGCTCTTTGTTAAGGCGCAAGTAAAACCGAGTAACGTAATTCAAACGGAAACTTTCAATGCCTAACAAATCTCTCTAGAGTCTTCGTCTCCGACGAAAAACCCTAACAATGGCCGAAGAGCAGGCCTTGGCCGATCCGTTAGCCTCCCTCTCCATTCCACCTCTCAGCTCCTCCATCTTCTCCGACGACCTCACATTACCCGACGATTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2109 bp · TkA01G623230|TK1151|CDS

ATGGCCGAAGAGCAGGCCTTGGCCGATCCGTTAGCCTCCCTCTCCATTCCACCTCTCAGCTCCTCCATCTTCTCCGACGACCTCACATTACCCGACGATTTCCTCTCCTTCGACGAAGACTTCGACATCACCTTTGACAACGACCACCTCCCTTCAGATACCGAAGACTTTTTCAACTCCACCTTCAATCCTTCCAATCCGATTGATCTGTCATCCTCTGATCCTGAATTCAATGAATTTGTGTCTGACCCCGAAACCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

702 aa · TkA01G623230|TK1151|PROTEIN

MAEEQALADPLASLSIPPLSSSIFSDDLTLPDDFLSFDEDFDITFDNDHLPSDTEDFFNSTFNPSNPIDLSSSDPEFNEFVSDPETFVAESGNLSEHQGDVSGFLNIPSPDDSSKGFLEETLMVLDSQSPESRTENPVSSQGSGNCGSAGSDAAMNCPSPDSGNSVVDHKVKRELGSNFMLKRKKETSDGNSESRTVKYQRSNETSTTTENSNEIDGKDDKKKARLIRNRESAQLSRQRKKHYVEELEDKVRAMHSTIQD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G623230
TK1151 IDTkA01G623230
OH-1004 IDLXL04_000276
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G623230
位置Chr01:157314229-157316736 (-)
描述Similar to BZIP17: bZIP transcription factor 17
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g40950 参与盐和渗透应激反应的转录激活剂。
Salt stress responses in Arabidopsis utilize a signal transduction pathway related to endoplasmic reticulum stress signaling.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03195.x
Signaling from the endoplasmic reticulum activates brassinosteroid signaling and promotes acclimation to stress in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1126/scisignal.2001140
At3g10800 参与内质网应激反应的转录激活因子。
An endoplasmic reticulum stress response in Arabidopsis is mediated by proteolytic processing and nuclear relocation of a membrane-associated transcription factor, bZIP28.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.050021
Identification of an Arabidopsis transmembrane bZIP transcription factor involved in the endoplasmic reticulum stress response.2008 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2008.07.021
A membrane-tethered transcription factor defines a branch of the heat stress response in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0808463105
Signaling from the endoplasmic reticulum activates brassinosteroid signaling and promotes acclimation to stress in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1126/scisignal.2001140
At3g56660 参与应激反应的转录激活因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0411300 参与内质网（ER）应激反应的转录因子。
Signal transduction by IRE1-mediated splicing of bZIP50 and other stress sensors in the endoplasmic reticulum stress response of rice.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04844.x
A rice transmembrane bZIP transcription factor, OsbZIP39, regulates the endoplasmic reticulum stress response.2012 · DOI: 10.1093/pcp/pcr157
Os07g0644100 参与内质网（ER）应激反应的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000276 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0006986 response to unfolded protein 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0030968 endoplasmic reticulum unfolded protein response 生物过程
GO:0034976 response to endoplasmic reticulum stress 生物过程
GO:0042538 hyperosmotic salinity response 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G40950
ath:AT3G10800
ath:AT3G56660
dosa:Os05g0411300
dosa:Os07g0644100
osa:4338781
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.825
排名 1 · TkA01G623230 · TK1151
内质网0.399
排名 2 · TkA01G623230 · TK1151
细胞膜0.121
排名 3 · TkA01G623230 · TK1151
细胞质0.076
排名 4 · TkA01G623230 · TK1151
高尔基体0.045
排名 5 · TkA01G623230 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12496BNIP26-58 aa
PF09716ETRAMP200-226 aa
PF12496BNIP2203-238 aa
PF00170bZIP_1218-278 aa
PF07716bZIP_2218-265 aa
PF09716ETRAMP337-379 aa
PF06624RAMP4341-381 aa
PF07716bZIP_2349-360 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G623230PF12496BNIP26583.58.7
TkA01G623230PF09716ETRAMP2002260.06713.9
TkA01G623230PF12496BNIP22032383.58.7
TkA01G623230PF00170bZIP_12182781.4e-1248.3
TkA01G623230PF07716bZIP_22182654.2e-0524.2
TkA01G623230PF09716ETRAMP3373790.06713.9
TkA01G623230PF06624RAMP43413810.06314.0
TkA01G623230PF07716bZIP_23493604.2e-0524.2
TkA01G623230PF06624RAMP46226440.06314.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22208拟南芥sp|O22208|BZP17_ARATH bZIP transcription factor 1744.400%Swiss-Prot中等置信
Q9SG86拟南芥sp|Q9SG86|BZP28_ARATH bZIP transcription factor 2842.300%Swiss-Prot中等置信
Q9LXX4拟南芥sp|Q9LXX4|BZP49_ARATH bZIP transcription factor 4942.600%Swiss-Prot中等置信
Q6AU90水稻sp|Q6AU90|BZP39_ORYSJ bZIP transcription factor 3942.000%Swiss-Prot中等置信
Q8LIB3水稻sp|Q8LIB3|BZP60_ORYSJ bZIP transcription factor 6040.000%Swiss-Prot中等置信

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