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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G604940
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 152446833-152447294 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

462 bp · TkA01G604940|TK1151|cDNA

ATGACGATCAAGAGAAATTGGGAAGACGACAGAGAGGTAGAGAAATTAGCCATGGCTAACTGCTTGATGCTGCTTTCACGAGTCGGTAAATCGGGTTCTTCACCGGGTCGGGTTTTCCACTGCAAGACATGTAACAAAGAGTTCAAGTCATTCCAGGCCCTCGGCGGCCACCGTGCTAGCCACAAGCGGACGAAATCGTCGGACCATAATGAACTACCGTCGCCGACGAAGCCGAAGATACATGAGTGCTCGATTTGTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

462 bp · TkA01G604940|TK1151|CDS

ATGACGATCAAGAGAAATTGGGAAGACGACAGAGAGGTAGAGAAATTAGCCATGGCTAACTGCTTGATGCTGCTTTCACGAGTCGGTAAATCGGGTTCTTCACCGGGTCGGGTTTTCCACTGCAAGACATGTAACAAAGAGTTCAAGTCATTCCAGGCCCTCGGCGGCCACCGTGCTAGCCACAAGCGGACGAAATCGTCGGACCATAATGAACTACCGTCGCCGACGAAGCCGAAGATACATGAGTGCTCGATTTGTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

153 aa · TkA01G604940|TK1151|PROTEIN

MTIKRNWEDDREVEKLAMANCLMLLSRVGKSGSSPGRVFHCKTCNKEFKSFQALGGHRASHKRTKSSDHNELPSPTKPKIHECSICGLEFAIGQALGGHMRRHRDGANDKSRRLEVVAPELVKEKRGLWDLNLTPYENDMKLWSSTLKTTPLY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G604940
TK1151 IDTkA01G604940
OH-1004 IDLXL04_000525
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G604940
位置Chr01:152446833-152447294 (-)
描述Similar to ZAT12: Zinc finger protein ZAT12
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g46090 可能的转录因子，参与氧化应激反应。
The zinc finger protein Zat12 is required for cytosolic ascorbate peroxidase 1 expression during oxidative stress in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m313350200
At3g46080 可能参与应激反应的转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g59820 参与光适应、低温和氧化应激反应的转录抑制因子。
A zinc finger protein RHL41 mediates the light acclimatization response in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00864.x
The zinc finger protein Zat12 is required for cytosolic ascorbate peroxidase 1 expression during oxidative stress in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m313350200
Roles of the CBF2 and ZAT12 transcription factors in configuring the low temperature transcriptome of Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02288.x
The zinc-finger protein Zat12 plays a central role in reactive oxygen and abiotic stress signaling in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.068254
At2g37430 可能参与应激反应的转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g28200 可能参与应激反应的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000525 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009631 cold acclimation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G37430
ath:AT3G46080
ath:AT3G46090
ath:AT3G53600
ath:AT5G59820
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.980
排名 1 · TkA01G604940 · TK1151
细胞质0.072
排名 2 · TkA01G604940 · TK1151
细胞膜0.019
排名 3 · TkA01G604940 · TK1151
内质网0.010
排名 4 · TkA01G604940 · TK1151
质体0.008
排名 5 · TkA01G604940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18551TackOD112-50 aa
PF26783DUF825519-92 aa
PF18868zf-C2H2_3rep32-60 aa
PF13465zf-H2C2_237-50 aa
PF13912zf-C2H2_638-63 aa
PF24071Phage_zn_bind_338-60 aa
PF02132RecR_ZnF38-45 aa
PF13894zf-C2H2_439-61 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G604940PF18551TackOD112500.112.8
TkA01G604940PF26783DUF825519920.01416.5
TkA01G604940PF18868zf-C2H2_3rep32600.1813.2
TkA01G604940PF13465zf-H2C2_237500.2712.4
TkA01G604940PF13912zf-C2H2_638637.3e-2380.7
TkA01G604940PF24071Phage_zn_bind_338601.39.7
TkA01G604940PF02132RecR_ZnF38458.87.0
TkA01G604940PF13894zf-C2H2_439611.9e-0731.9
TkA01G604940PF00096zf-C2H239610.000123.3
TkA01G604940PF12756zf-C2H2_239660.01316.4
TkA01G604940PF09723Zn_ribbon_839550.02415.4
TkA01G604940PF12171zf-C2H2_jaz39620.04314.7
TkA01G604940PF12874zf-met39620.07514.1
TkA01G604940PF13878zf-C2H2_339450.1712.4
TkA01G604940PF27618Zn_ribbon_GTF2H239920.2111.9
TkA01G604940PF17123zf-RING_1141540.05513.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q42453拟南芥sp|Q42453|ZAT7_ARATH Zinc finger protein ZAT763.500%Swiss-Prot低置信
Q9LX85拟南芥sp|Q9LX85|ZAT8_ARATH Zinc finger protein ZAT856.900%Swiss-Prot低置信
Q42410拟南芥sp|Q42410|ZAT12_ARATH Zinc finger protein ZAT1270.800%Swiss-Prot低置信
Q9SLD4拟南芥sp|Q9SLD4|ZAT11_ARATH Zinc finger protein ZAT1143.800%Swiss-Prot低置信
Q681X4拟南芥sp|Q681X4|ZAT5_ARATH Zinc finger protein ZAT554.000%Swiss-Prot低置信

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