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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G539460
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 135256901-135258622 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1503 bp · TkA01G539460|TK1151|cDNA

ATGGATTCATCATCAAGTTCGATTATCCAAAGTGAAGAACTCTATTTAGCCAACTCCAAATTTGAATCATGTGATGAATTACTAAAGAATGTGCGGAGTTTTTATTATGACAAGGGATATGGATTATCTATTAAAGATTCAACTAAAGACAAATATGTCACATTGCAATGCGATCGAGGTGGTTCCTATCGAGATAGAATGGGTATTGGCGATAAAAGGAAGAAGAACACTGGGTCTCGTTTGATTAACTGCCCCTTCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1503 bp · TkA01G539460|TK1151|CDS

ATGGATTCATCATCAAGTTCGATTATCCAAAGTGAAGAACTCTATTTAGCCAACTCCAAATTTGAATCATGTGATGAATTACTAAAGAATGTGCGGAGTTTTTATTATGACAAGGGATATGGATTATCTATTAAAGATTCAACTAAAGACAAATATGTCACATTGCAATGCGATCGAGGTGGTTCCTATCGAGATAGAATGGGTATTGGCGATAAAAGGAAGAAGAACACTGGGTCTCGTTTGATTAACTGCCCCTTCCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

500 aa · TkA01G539460|TK1151|PROTEIN

MDSSSSSIIQSEELYLANSKFESCDELLKNVRSFYYDKGYGLSIKDSTKDKYVTLQCDRGGSYRDRMGIGDKRKKNTGSRLINCPFQIVGKKGNDGTWVLKVKNLTHNHEPATDMSGHPSFRRLLPDDVQSVKNMTLSGIPPRQILSSLRQRNQNLPAVSRTIYNLKAKIQKENLNNRSTVSALFEEFEKKGFIYDILYDSVGHISHLFVVHPLSTEDEYSYVWALNVFKKTLENREPSVIMSDRELALMNAINVVFPNT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G539460
TK1151 IDTkA01G539460
OH-1004 IDLXL04_033368
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.800 / OH-1004 81.957
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G539460
位置Chr01:135256901-135258622 (-)
描述Similar to CHGG_01239: PKS-NRPS hybrid synthetase CHGG_01239 (Chaetomium globosum (strain ATCC 6205 / CBS 148.51 / DSM 1962 / NBRC 6347 / NRRL 1970)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033368 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006633 fatty acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009403 toxin biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0004312 fatty acid synthase activity 分子功能
GO:0004315 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase activity 分子功能
GO:0008168 methyltransferase activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能
GO:0016853 isomerase activity 分子功能
GO:0016874 ligase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10240
ath:AT2G32250
ath:AT4G38180
ath:AT5G28530
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.919
排名 1 · TkA01G539460 · TK1151
细胞质0.157
排名 2 · TkA01G539460 · TK1151
线粒体0.025
排名 3 · TkA01G539460 · TK1151
细胞膜0.017
排名 4 · TkA01G539460 · TK1151
细胞外0.010
排名 5 · TkA01G539460 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08731AFT25-110 aa
PF03101FAR152-110 aa
PF01335DED164-194 aa
PF21056ZSWIM1-3_RNaseH-like202-262 aa
PF10551MULE207-272 aa
PF00872Transposase_mut239-280 aa
PF01335DED412-434 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G539460PF08731AFT251100.01216.6
TkA01G539460PF03101FAR1521100.001120.4
TkA01G539460PF01335DED1641940.1213.4
TkA01G539460PF21056ZSWIM1-3_RNaseH-like2022620.04614.4
TkA01G539460PF10551MULE2072723.1e-1350.6
TkA01G539460PF00872Transposase_mut2392800.09712.3
TkA01G539460PF01335DED4124340.1213.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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