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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G210250
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 53476451-53481149 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2007 bp · TkA01G210250|TK1151|cDNA

ATGAGGCCGCCAAGGAGAAGAAACCAAAAGCGGCGCCCGTATATTTCAATTTCAGAGTTTCGGGACTTGGCAAATGCAGTCCCTCAAGTTCCTATCATTATTAGAACAAGTAGATTGGCGTGCAAACGTTTTGAAGAACTGAGAAGGATAGGAGCTGCAATAACACTCCAAACACACGTGCGTAGTGATCGTGCGCGTGTGGCCTACAGTAAGCTCCGTGTGGCTGTGCTTGAGGTGCAAACAGTCATACGTGGACAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2007 bp · TkA01G210250|TK1151|CDS

ATGAGGCCGCCAAGGAGAAGAAACCAAAAGCGGCGCCCGTATATTTCAATTTCAGAGTTTCGGGACTTGGCAAATGCAGTCCCTCAAGTTCCTATCATTATTAGAACAAGTAGATTGGCGTGCAAACGTTTTGAAGAACTGAGAAGGATAGGAGCTGCAATAACACTCCAAACACACGTGCGTAGTGATCGTGCGCGTGTGGCCTACAGTAAGCTCCGTGTGGCTGTGCTTGAGGTGCAAACAGTCATACGTGGACAAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

668 aa · TkA01G210250|TK1151|PROTEIN

MRPPRRRNQKRRPYISISEFRDLANAVPQVPIIIRTSRLACKRFEELRRIGAAITLQTHVRSDRARVAYSKLRVAVLEVQTVIRGQKARKEFIFKKRTPQLKSRAVKFYKELNRGAIVTQCRWMGKLAKRELRKLKMAARETGALKEAKDKLEKQLEELMWRIQLEKRLRTDLEEAKASEAQKFQNALEALQKKLDEANATFLKEKEEAARKALEEAPPVIKEKEVLVEDTKKVESMQAEINELKVNLKSSEERRKKFED...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G210250
TK1151 IDTkA01G210250
OH-1004 IDLXL04_004035
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)68.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 84.581 / OH-1004 95.604
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G210250
位置Chr01:53476451-53481149 (+)
描述Similar to XI-E: Myosin-11
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g54560 肌球蛋白重链，参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输，以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At1g08730 肌球蛋白重链，参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输，以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At5g20490 肌球蛋白重链，参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输，以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At1g17580 肌球蛋白重链，是细胞周期调节的各种细胞器和蛋白质分离所需的重链。
Enzymatic activity and motility of recombinant Arabidopsis myosin XI, MYA1.2007 · DOI: 10.1093/pcp/pcm054
A comparative study of the involvement of 17 Arabidopsis myosin family members on the motility of Golgi and other organelles.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.136853
Myosin XIK is a major player in cytoplasm dynamics and is regulated by two amino acids in its tail.2012 · DOI: 10.1093/jxb/err265
At5g43900 肌球蛋白重链，是细胞周期调节的各种细胞器和蛋白质分离所需的重链。
Peroxisomal localization of a myosin XI isoform in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci085
Two class XI myosins function in organelle trafficking and root hair development in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.113654
A comparative study of the involvement of 17 Arabidopsis myosin family members on the motility of Golgi and other organelles.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.136853
Myosin XIK is a major player in cytoplasm dynamics and is regulated by two amino acids in its tail.2012 · DOI: 10.1093/jxb/err265

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004035 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007015 actin filament organization 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0010090 trichome morphogenesis 生物过程
GO:0010091 trichome branching 生物过程
GO:0010154 fruit development 生物过程
GO:0030048 actin filament-based movement 生物过程
GO:0048467 gynoecium development 生物过程
GO:0048767 root hair elongation 生物过程
GO:0048768 root hair cell tip growth 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08730
ath:AT1G17580
ath:AT1G54560
ath:AT5G20490
ath:AT5G43900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.388
排名 1 · TkA01G210250 · TK1151
细胞核0.229
排名 2 · TkA01G210250 · TK1151
细胞膜0.209
排名 3 · TkA01G210250 · TK1151
高尔基体0.110
排名 4 · TkA01G210250 · TK1151
质体0.102
排名 5 · TkA01G210250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06718DUF120326-85 aa
PF00612IQ52-69 aa
PF00612IQ75-92 aa
PF00957Synaptobrevin96-111 aa
PF00612IQ114-133 aa
PF01843DIL124-176 aa
PF19191HEF_HK129-162 aa
PF10046BLOC1_2132-159 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G210250PF06718DUF120326850.113.6
TkA01G210250PF00612IQ52697.9e-0729.0
TkA01G210250PF00612IQ75927.9e-0729.0
TkA01G210250PF00957Synaptobrevin961110.1412.8
TkA01G210250PF00612IQ1141337.9e-0729.0
TkA01G210250PF01843DIL1241762.4e-2383.0
TkA01G210250PF19191HEF_HK1291621.99.8
TkA01G210250PF10046BLOC1_21321593.58.8
TkA01G210250PF04513Baculo_PEP_C1421962.48.9
TkA01G210250PF07361Cytochrom_B5621492167.38.0
TkA01G210250PF11445DUF28941652980.1113.8
TkA01G210250PF10046BLOC1_21771973.58.8
TkA01G210250PF06013WXG1001792021.310.1
TkA01G210250PF19191HEF_HK1791951.99.8
TkA01G210250PF05531NPV_P101821930.3212.2
TkA01G210250PF06718DUF12031932380.113.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4HWY6拟南芥sp|F4HWY6|MYO11_ARATH Myosin-1153.800%Swiss-Prot高置信
F4HXP9拟南芥sp|F4HXP9|MYO9_ARATH Myosin-952.400%Swiss-Prot高置信
F4K5J1拟南芥sp|F4K5J1|MYO17_ARATH Myosin-1746.200%Swiss-Prot中等置信
Q39160拟南芥sp|Q39160|MYO5_ARATH Myosin-543.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LKB9拟南芥sp|Q9LKB9|MYO6_ARATH Myosin-638.800%Swiss-Prot中等置信

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