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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G087980
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 22401439-22410898 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1674 bp · TkA01G087980|TK1151|cDNA

TAAAACACGCAAAACCTGTCAGAAGTTAAGCCAGAAATGGACATCAAAGTTTTTAAATTCGTATATAGCACCACATTAACACCATAATAGTCTAAAAAGGATCATAAAATTCATAATTCTGACACTAAAATGGCTTCCAATGTTCATTTTCTTATGATACCTCTAATGTGCCCAGGCCACCTCATTCCAATGGTGGACATGGCCAAACTCATAGCCCAACACTCTGCCACAGTCACCATCGTCATCACCCCCCGTAACGC...

1476 bp · TkA01G087980|TK1151|CDS

ATGGCTTCCAATGTTCATTTTCTTATGATACCTCTAATGTGCCCAGGCCACCTCATTCCAATGGTGGACATGGCCAAACTCATAGCCCAACACTCTGCCACAGTCACCATCGTCATCACCCCCCGTAACGCCGCCAGGTTCGGGGAGGTCCTCCACCGTGTTTTTGCCTCCGGCCACCCAATCCACATCCTCCAACTCCAATTTCCCGCCACAGAACACGGATTACCAGAAGGATGTGAAAACGTAGACGATCTACCCAC...

491 aa · TkA01G087980|TK1151|PROTEIN

MASNVHFLMIPLMCPGHLIPMVDMAKLIAQHSATVTIVITPRNAARFGEVLHRVFASGHPIHILQLQFPATEHGLPEGCENVDDLPTFKLTKNFFNASAKLQEPLEDIFNDLKPRPSCIISDKNLTWTADVAKKFEIPWVIFDGMSCFTQLATHNLCVSKVHERVGDFDPFLLPGLPDEITMTKSQLPGLFNPGKSPEAKKITSTRGEIRATEIGAYGILINSFEELERRYLDEFRKVKNVWCIGPFSLSNKNDLDKAQR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G087980
TK1151 IDTkA01G087980
OH-1004 IDLXL04_005073
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)94.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.593 / OH-1004 99.593
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G087980
位置Chr01:22401439-22410898 (+)
描述Similar to UGT73C3: UDP-glycosyltransferase 73C3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g36780 UDP-糖基转移酶73C3。 暂无已核实直接文献
At2g36790 充当 UDP-葡萄糖:黄酮醇-3-O-糖苷-7-O-葡萄糖基转移酶。 6-和7-羟基黄酮,但不是3-或5-羟基黄酮,被接受作为底物。
At2g36800 特异性催化油菜素甾醇的 23-O-葡萄糖基化,可能导致其失活。
At3g53150 UDP-糖基转移酶 73D1。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_005073 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009636 response to toxic substance 生物过程
GO:0010224 response to UV-B 生物过程
GO:0016131 brassinosteroid metabolic process 生物过程
GO:0016134 saponin metabolic process 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0098754 detoxification 生物过程
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0008194 UDP-glycosyltransferase activity 分子功能
GO:0035251 UDP-glucosyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:AFN26667
ath:AT2G36750
ath:AT2G36770
ath:AT2G36780
ath:AT2G36800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.804
排名 1 · TkA01G087980 · TK1151
细胞核0.215
排名 2 · TkA01G087980 · TK1151
内质网0.058
排名 3 · TkA01G087980 · TK1151
过氧化物酶体0.051
排名 4 · TkA01G087980 · TK1151
质体0.049
排名 5 · TkA01G087980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26168Glyco_transf_N4-123 aa
PF10307HAD_SAK_121-58 aa
PF18176KptA_kDCL152-180 aa
PF26168Glyco_transf_N213-247 aa
PF00201UDPGT282-409 aa
PF18176KptA_kDCL316-365 aa
PF07249Cerato-platanin343-420 aa
PF06722EryCIII-like_C349-412 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G087980PF26168Glyco_transf_N41230.0001722.3
TkA01G087980PF10307HAD_SAK_121580.04414.3
TkA01G087980PF18176KptA_kDCL1521800.2612.1
TkA01G087980PF26168Glyco_transf_N2132470.0001722.3
TkA01G087980PF00201UDPGT2824092.5e-1866.9
TkA01G087980PF18176KptA_kDCL3163650.2612.1
TkA01G087980PF07249Cerato-platanin3434200.1313.1
TkA01G087980PF06722EryCIII-like_C3494120.03814.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZQ96拟南芥sp|Q9ZQ96|U73C3_ARATH UDP-glycosyltransferase 73C347.200%Swiss-Prot中等置信
Q9ZQ95拟南芥sp|Q9ZQ95|U73C6_ARATH UDP-glycosyltransferase 73C645.500%Swiss-Prot中等置信
Q9ZQ94拟南芥sp|Q9ZQ94|U73C5_ARATH UDP-glycosyltransferase 73C545.900%Swiss-Prot中等置信
Q9SCP6拟南芥sp|Q9SCP6|U73D1_ARATH UDP-glycosyltransferase 73D145.600%Swiss-Prot中等置信

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