TkA01G024910 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G024910

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 6413570-6414721 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

312 bp · TkA01G024910|TK1151|cDNA

ATGTTGGTCAGTTACGGGTCAATGGTGGTCTATCGAAGACGATGCGGCTTGATTTCGTTCGTCCTGGCTATGGGATACCTCATTGGATGCCATGTATACTACATGAGTGGGGACGCATGGAAGGAAGGAGGTATTGATGCCACTGGAGCTCTTATGGTGATAACATTAAAAGTGATTTCATGTGCTGTAAATTACAACGACGGATTGTTAAAAGATGAAGATCTTCCGACGGATTTGCGACGGCTAAATCTGTTCCAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

312 bp · TkA01G024910|TK1151|CDS

ATGTTGGTCAGTTACGGGTCAATGGTGGTCTATCGAAGACGATGCGGCTTGATTTCGTTCGTCCTGGCTATGGGATACCTCATTGGATGCCATGTATACTACATGAGTGGGGACGCATGGAAGGAAGGAGGTATTGATGCCACTGGAGCTCTTATGGTGATAACATTAAAAGTGATTTCATGTGCTGTAAATTACAACGACGGATTGTTAAAAGATGAAGATCTTCCGACGGATTTGCGACGGCTAAATCTGTTCCAACA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

103 aa · TkA01G024910|TK1151|PROTEIN

MLVSYGSMVVYRRRCGLISFVLAMGYLIGCHVYYMSGDAWKEGGIDATGALMVITLKVISCAVNYNDGLLKDEDLPTDLRRLNLFQQIGKCRRQSVGNDVVGI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G024910`
TK1151 ID	TkA01G024910
OH-1004 ID	LXL04_005873
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	72.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 88.350 / OH-1004 20.771 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G024910

位置 Chr01:6413570-6414721 (+)

描述 Similar to LPCAT1: Lysophospholipid acyltransferase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g12640`	具有广泛特异性的溶磷脂酰基转移酶。	A family of eukaryotic lysophospholipid acyltransferases with broad specificity.2008 · DOI: 10.1016/j.febslet.2007.12.020 Acyl editing and headgroup exchange are the major mechanisms that direct polyunsaturated fatty acid flux into triacylglycerols.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.204438 Metabolic interactions between the Lands cycle and the Kennedy pathway of glycerolipid synthesis in Arabidopsis developing seeds.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.104604 Plant acyl-CoA:lysophosphatidylcholine acyltransferases (LPCATs) have different specificities in their forward and reverse reactions.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m113.521815 Metabolically Distinct Pools of Phosphatidylcholine Are Involved in Trafficking of Fatty Acids out of and into the Chloroplast for Membrane Production.2019 · DOI: 10.1105/tpc.19.00121
`At1g63050`	溶血磷脂酰基转移酶具有广泛的特异性。	A family of eukaryotic lysophospholipid acyltransferases with broad specificity.2008 · DOI: 10.1016/j.febslet.2007.12.020 Acyl editing and headgroup exchange are the major mechanisms that direct polyunsaturated fatty acid flux into triacylglycerols.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.204438 Metabolic interactions between the Lands cycle and the Kennedy pathway of glycerolipid synthesis in Arabidopsis developing seeds.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.104604 Plant acyl-CoA:lysophosphatidylcholine acyltransferases (LPCATs) have different specificities in their forward and reverse reactions.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m113.521815 Metabolically Distinct Pools of Phosphatidylcholine Are Involved in Trafficking of Fatty Acids out of and into the Chloroplast for Membrane Production.2019 · DOI: 10.1105/tpc.19.00121

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005873 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006641 triglyceride metabolic process 生物过程

GO:0006646 phosphatidylethanolamine biosynthetic process 生物过程

GO:0006656 phosphatidylcholine biosynthetic process 生物过程

GO:0008654 phospholipid biosynthetic process 生物过程

GO:0019375 galactolipid biosynthetic process 生物过程

GO:0019432 triglyceride biosynthetic process 生物过程

GO:0030258 lipid modification 生物过程

GO:0036150 phosphatidylserine acyl-chain remodeling 生物过程

GO:0036151 phosphatidylcholine acyl-chain remodeling 生物过程

GO:0036152 phosphatidylethanolamine acyl-chain remodeling 生物过程

GO:0045017 glycerolipid biosynthetic process 生物过程

GO:0046474 glycerophospholipid biosynthetic process 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G12640

ath:AT1G63050

gga:421925

mmu:67216

spo:2539940

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.286

排名 1 · TkA01G024910 · TK1151

质体0.176

排名 2 · TkA01G024910 · TK1151

内质网0.139

排名 3 · TkA01G024910 · TK1151

细胞质0.137

排名 4 · TkA01G024910 · TK1151

细胞膜0.108

排名 5 · TkA01G024910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03062MBOAT33-83 aa

PF12188STAT2_C72-84 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G024910	`PF03062`	MBOAT	33	83	0.0023	18.0
TkA01G024910	`PF12188`	STAT2_C	72	84	0.37	11.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4IDU4`	拟南芥	sp\|F4IDU4\|MBOA1_ARATH Lysophospholipid acyltransferase 1	64.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q9CAN8`	拟南芥	sp\|Q9CAN8\|MBOA2_ARATH Lysophospholipid acyltransferase 2	62.800%	Swiss-Prot	高置信

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