TkA01G002180 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G002180

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 584457-589142 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3180 bp · TkA01G002180|TK1151|cDNA

GAATCCTGGCTCCGTCCCTGTTCTTATACGCAATGAGTAAAAATATGGTGTTTTAAATAAAAGTCACTTTTCGAATTTTAAGTTCTCAATATTATATAATATAATTAGTTTAGGCAAAACAAAAAATAAAACTATTTTTTGTAGACCATTGAGAAGACTACAACATATACTTGGTTGGAACTACAATTATTTGAGACACCAAAAATAATTTATGACACATTACGCTATATACCAACGGTAGATGGTCTCCACAACCCCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

792 bp · TkA01G002180|TK1151|CDS

ATGGGGTCCATGCCTGAAGGCCGCAAATGTGTGACGTGTATTGGGGAGGCGATTGATGAGTCGAAACGTCTTGATTTGGGGAAGAATTCACGGTTGTTATCGCGGTTGCTTAGTCCTTTAGAAGTCAAACAGATCATGAAAGCAGAAAAGGAATGTTCTGCTAATCAGCTTCGACCCGAGCAGTTGATTGTGAATGGGAACCCTCTTAAACCTGAAGAAATGGCAGAGCTTTTGGGGTGTCCTTTGCCCCCAAGAAAGTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

263 aa · TkA01G002180|TK1151|PROTEIN

MGSMPEGRKCVTCIGEAIDESKRLDLGKNSRLLSRLLSPLEVKQIMKAEKECSANQLRPEQLIVNGNPLKPEEMAELLGCPLPPRKLKPGMYWYDKESGLWGKEGEKPDRIVSSNLNFTGKLSQTASNGNTQVYMNGREITKLELKVLRVASVQCPRDTHFWVYDDGRYEEEGQNNIKGNIWEKASTRLLCTLLSLPVPQGQPPRERDEPSNYASVPNYLSPKRFKSFCYLDLKVLEPALSLSRRNSYTETDSRKKSCKI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G002180`
TK1151 ID	TkA01G002180
OH-1004 ID	LXL04_005998
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	95.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 88.973 / OH-1004 26.145 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G002180

位置 Chr01:584457-589142 (+)

描述 Similar to XLG3: Extra-large guanine nucleotide-binding protein 3

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g31930`	鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）作为各种跨膜信号系统中的调节因子或转导子参与其中（通过相似性）。	Arabidopsis extra-large G proteins (XLGs) regulate root morphogenesis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03335.x Regulation of root-wave response by extra large and conventional G proteins in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03506.x
`At2g23460`	鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）作为各种跨膜信号系统中的调节因子或转导子参与其中（通过相似性）。	Arabidopsis extra-large G proteins (XLGs) regulate root morphogenesis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03335.x
`At4g34390`	鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）作为各种跨膜信号系统中的调节因子或转导子参与其中（通过相似性）。	Arabidopsis extra-large G proteins (XLGs) regulate root morphogenesis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03335.x Arabidopsis extra large G-protein 2 (XLG2) interacts with the Gbeta subunit of heterotrimeric G protein and functions in disease resistance.2009 · DOI: 10.1093/mp/ssp001 Ca2+-dependent GTPase, extra-large G protein 2 (XLG2), promotes activation of DNA-binding protein related to vernalization 1 (RTV1), leading to activation of floral integrator genes and early flowering in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1074/jbc.m111.317412

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005998 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007188 adenylate cyclase-modulating G protein-coupled receptor signaling pathway 生物过程

GO:0009617 response to bacterium 生物过程

GO:0009723 response to ethylene 生物过程

GO:0010476 gibberellin mediated signaling pathway 生物过程

GO:0034052 positive regulation of plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:2000280 regulation of root development 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005834 heterotrimeric G-protein complex 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G31930

ath:AT2G23460

ath:AT4G34390

gmx:547804

gmx:547977

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.368

排名 1 · TkA01G002180 · TK1151

细胞质0.367

排名 2 · TkA01G002180 · TK1151

细胞膜0.282

排名 3 · TkA01G002180 · TK1151

内质网0.084

排名 4 · TkA01G002180 · TK1151

高尔基体0.067

排名 5 · TkA01G002180 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C516`	拟南芥	sp\|Q9C516\|XLG3_ARATH Extra-large guanine nucleotide-binding protein 3	78.600%	Swiss-Prot	高置信
`O80462`	拟南芥	sp\|O80462\|XLG1_ARATH Extra-large guanine nucleotide-binding protein 1	67.300%	Swiss-Prot	高置信
`C6KIE6`	拟南芥	sp\|C6KIE6\|XLG2_ARATH Extra-large guanine nucleotide-binding protein 2	55.800%	Swiss-Prot	高置信

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