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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_038622
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 45867702-45869487 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1467 bp · LXL04_038622|LXL04_038622|OH1004|cDNA

ATGATGTCTATCGACAAACAGTTTCAACATCTCAAAATAAATCTAGAAGCTATAATATTAGCAACCAACAACTTTTCTGAAGATTATTGCATAGGTGCTGGAGGTTTTGGAAAGGTTTACAAAGGAGATCTACTACTTTCAGCGCGGATTACCACAGTTGCTTTAAAACGATTAGATCATCGTACGTTCGGGCAAGGAGATTCTGAGTTTTGGAAGGAGGTCATTATGCTCTCCCTCTACAGTCATGCAAATATCATATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1467 bp · LXL04_038622|LXL04_038622|OH1004|CDS

ATGATGTCTATCGACAAACAGTTTCAACATCTCAAAATAAATCTAGAAGCTATAATATTAGCAACCAACAACTTTTCTGAAGATTATTGCATAGGTGCTGGAGGTTTTGGAAAGGTTTACAAAGGAGATCTACTACTTTCAGCGCGGATTACCACAGTTGCTTTAAAACGATTAGATCATCGTACGTTCGGGCAAGGAGATTCTGAGTTTTGGAAGGAGGTCATTATGCTCTCCCTCTACAGTCATGCAAATATCATATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

488 aa · LXL04_038622|LXL04_038622|OH1004|PROTEIN

MMSIDKQFQHLKINLEAIILATNNFSEDYCIGAGGFGKVYKGDLLLSARITTVALKRLDHRTFGQGDSEFWKEVIMLSLYSHANIISLLGFCDEKGEKILVYEYLSRKGLHLYLDSNQLTWVQRLKICIGAAHGLAYLHDPDGKQQRVLHRDIKSSNILLAENWDAKIAVLVFPNLVLLTNNIHLLCRIILQARSDTSGLLTKESDVYSFGVTLFEVLCGRLCFAIDNKRQSFTELVRESCKENNLDGIICDTIKDEIDP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_038622
TK1151 IDTkA01G022750
OH-1004 IDLXL04_038622
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)79.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.385
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_038622
位置Chr09:45867702-45869487 (+)
描述Similar to HERK1: Receptor-like protein kinase HERK 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g59700 可能的受体样蛋白激酶 At5g59700。 暂无已核实直接文献
At1g30570 可能的受体样蛋白激酶 At1g30570。 暂无已核实直接文献
At5g54380 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
A receptor-like kinase mediates the response of Arabidopsis cells to the inhibition of cellulose synthesis.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.018
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038622 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016324 apical plasma membrane 细胞组分
GO:0043680 filiform apparatus 细胞组分
GO:0090404 pollen tube tip 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G30570
ath:AT3G46290
ath:AT5G28680
ath:AT5G54380
ath:AT5G59700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.439
排名 1 · LXL04_038622 · OH-1004
细胞核0.295
排名 2 · LXL04_038622 · OH-1004
细胞膜0.241
排名 3 · LXL04_038622 · OH-1004
内质网0.088
排名 4 · LXL04_038622 · OH-1004
高尔基体0.063
排名 5 · LXL04_038622 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase29-169 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr30-290 aa
PF00069.32Pkinase202-289 aa
PF00462.31Glutaredoxin369-419 aa
PF23733.3GRXCR1-2_C443-488 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_038622PF00069.32Pkinase291695.8e-30105.3
LXL04_038622PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr302902.3e-32113.0
LXL04_038622PF00069.32Pkinase2022895.8e-30105.3
LXL04_038622PF00462.31Glutaredoxin3694198.7e-0626.6
LXL04_038622PF23733.3GRXCR1-2_C4434885.2e-1659.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LX66拟南芥Receptor-like protein kinase HERK 140.594%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FN92拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g5970040.741%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SA72拟南芥Probable receptor-like protein kinase At1g3057038.206%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LK35拟南芥Receptor-like protein kinase THESEUS 139.796%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q3E8W4拟南芥Receptor-like protein kinase ANXUR238.721%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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