LXL04_037811 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_037811

当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 21835530-21838155 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

864 bp · LXL04_037811|LXL04_037811|OH1004|cDNA

ATGGCGGCATCTTCTGTGACACTTGTCGTCTTTTTTTGTCTCCTCTTTCAAGTTAACTCTGAAAAAAGATCAAACCTAAACGGCTTCAATCTGCAAAAGACTTCAATCAAATCCTTGAAGCATCTTCACTCTTCTATTTGCCGTCGACCTCTTCCGGTGCTTGGTTCTTCCGTGACGCCAATAGATTTGCTTCCAATTTCTCAGATCTACTTTCAGATAAACTATTTTCCTTCTGTGGTTAATCTTGTCAATCGTGTGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

864 bp · LXL04_037811|LXL04_037811|OH1004|CDS

ATGGCGGCATCTTCTGTGACACTTGTCGTCTTTTTTTGTCTCCTCTTTCAAGTTAACTCTGAAAAAAGATCAAACCTAAACGGCTTCAATCTGCAAAAGACTTCAATCAAATCCTTGAAGCATCTTCACTCTTCTATTTGCCGTCGACCTCTTCCGGTGCTTGGTTCTTCCGTGACGCCAATAGATTTGCTTCCAATTTCTCAGATCTACTTTCAGATAAACTATTTTCCTTCTGTGGTTAATCTTGTCAATCGTGTGAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

287 aa · LXL04_037811|LXL04_037811|OH1004|PROTEIN

MAASSVTLVVFFCLLFQVNSEKRSNLNGFNLQKTSIKSLKHLHSSICRRPLPVLGSSVTPIDLLPISQIYFQINYFPSVVNLVNRVKKKLGNGHKKEPFNGHLLLHAAFLGVEYPTPFHAALHGGGVPRQFPALPGASSASSTAFYARLEEGLELISGLRSLRVLNLSHNGFVGKLPESLSFLKNLNEVSLSNKLSGPVYQSFVENIPANAVVDLSFNALTGQIPQMMSLSNQKEEYFARNLDLCGKPLKKMCRIPSSHS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_037811`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_037811

位置 Chr09:21835530-21838155 (-)

描述 Similar to At4g34220: Receptor protein kinase-like protein At4g34220

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g34220`	受体蛋白激酶样蛋白At4g34220。	暂无已核实直接文献
`At5g40170`	类受体蛋白 54。	暂无已核实直接文献
`At4g37250`	可能的 LRR 类似受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g37250。	暂无已核实直接文献
`At3g05660`	类受体蛋白33。	暂无已核实直接文献
`At4g13900`	受体样蛋白 49。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037811 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程

GO:0042631 cellular response to water deprivation 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G05660

ath:AT4G34220

ath:AT4G37250

ath:AT5G40170

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.307

排名 1 · LXL04_037811 · OH-1004

内质网0.249

排名 2 · LXL04_037811 · OH-1004

细胞核0.216

排名 3 · LXL04_037811 · OH-1004

细胞质0.199

排名 4 · LXL04_037811 · OH-1004

细胞外0.095

排名 5 · LXL04_037811 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q94C77`	拟南芥	Receptor protein kinase-like protein At4g34220	48.361%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`F4KHA2`	拟南芥	Receptor-like protein 54	35.616%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`C0LGS3`	拟南芥	Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g37250	33.775%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`F4J8G2`	拟南芥	Receptor-like protein 33	36.842%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9SVM3`	拟南芥	Receptor-like protein 49	44.444%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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