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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_037294
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 5293142-5293822 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

681 bp · LXL04_037294|LXL04_037294|OH1004|cDNA

ATGCGAAGAGGTAGAGCAGGCACGGCGTCTAAGACGATGGCTGAGGCAGCTCTTCTGGGGACTGATGGATCTGGATCGAAGCCAGATATTAGGTACAGAGGTGTGAGAAAGAGACCATGGGGTAGATTTGCTGCCGAGATTAGAGATCCATGGAAGAAAACCAGGGTTTGGCTCGGTACTTTTGACTCTGCAGAGGATGCAGCTCGTGCTTACGACACCGCCGCCCGGAATCTCCGTGGACCTAAAGCCAAGACCAATTT...

CDS

下载 CDS FASTA

681 bp · LXL04_037294|LXL04_037294|OH1004|CDS

ATGCGAAGAGGTAGAGCAGGCACGGCGTCTAAGACGATGGCTGAGGCAGCTCTTCTGGGGACTGATGGATCTGGATCGAAGCCAGATATTAGGTACAGAGGTGTGAGAAAGAGACCATGGGGTAGATTTGCTGCCGAGATTAGAGATCCATGGAAGAAAACCAGGGTTTGGCTCGGTACTTTTGACTCTGCAGAGGATGCAGCTCGTGCTTACGACACCGCCGCCCGGAATCTCCGTGGACCTAAAGCCAAGACCAATTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

226 aa · LXL04_037294|LXL04_037294|OH1004|PROTEIN

MRRGRAGTASKTMAEAALLGTDGSGSKPDIRYRGVRKRPWGRFAAEIRDPWKKTRVWLGTFDSAEDAARAYDTAARNLRGPKAKTNFPQYYHQQNPNDHHSLLYHRPNQHAEFSIAVTQRPTCSSLSSTLESFSGPRPPVKSDFVLPRRHHPRSPPVFPDDCRSDCDSSSSVVVDGAEEGCDAVEIASSSFTKPFLSIDLNMPPPFDEVELAFPTDDDLHCTALRL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_037294
TK1151 IDTkA04G268820
OH-1004 IDLXL04_037294
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 94.690
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_037294
位置Chr09:5293142-5293822 (+)
描述Similar to ERF3: Ethylene-responsive transcription factor 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g50640 作为转录阻遏蛋白。
Arabidopsis ethylene-responsive element binding factors act as transcriptional activators or repressors of GCC box-mediated gene expression.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.3.393
Repression domains of class II ERF transcriptional repressors share an essential motif for active repression.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010127
At3g20310 参与脱落酸、应激因子和应激信号转导途径成分对基因表达的调节。
Role of an Arabidopsis AP2/EREBP-type transcriptional repressor in abscisic acid and drought stress responses.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.033043
At3g15210 作为转录阻遏蛋白。
Arabidopsis ethylene-responsive element binding factors act as transcriptional activators or repressors of GCC box-mediated gene expression.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.3.393
Repression domains of class II ERF transcriptional repressors share an essential motif for active repression.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010127

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037294 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009864 induced systemic resistance, jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010105 negative regulation of ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G50640
ath:AT3G15210
ath:AT3G20310
nta:107778042
nta:107802932
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.969
排名 1 · LXL04_037294 · OH-1004
细胞质0.077
排名 2 · LXL04_037294 · OH-1004
细胞膜0.027
排名 3 · LXL04_037294 · OH-1004
内质网0.025
排名 4 · LXL04_037294 · OH-1004
质体0.017
排名 5 · LXL04_037294 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00847.27AP231-80 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_037294PF00847.27AP231803.8e-1453.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80339拟南芥Ethylene-responsive transcription factor 347.699%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LDE4拟南芥Ethylene-responsive transcription factor 745.349%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O80340拟南芥Ethylene-responsive transcription factor 481.250%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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