基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_032170
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 17807250-17809373
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1296 bp · LXL04_032170|LXL04_032170|OH1004|cDNA
ATGAAAGTTTCGAAATGGTTTTTCGTAATTAcaattatttttctttttaaccCTCAAATCTCATACGGGGTTTCTGAGCTCTCGCAACAATTTCTCGAATTTGCAAAGAAAAGTGAGGTTTATGATTGGATGGTGGGAGTTAGGAGAAAAATACATGAGAATCCAGAGCTGATGTACCAAGAATTTGAGACCAGTAAAGTTATTAGAGAAGAATTGGATAAATTGGGGATTTCATACAAACACCCAATTGCAGTTACCGG...
CDS
下载 CDS FASTA1296 bp · LXL04_032170|LXL04_032170|OH1004|CDS
ATGAAAGTTTCGAAATGGTTTTTCGTAATTACAATTATTTTTCTTTTTAACCCTCAAATCTCATACGGGGTTTCTGAGCTCTCGCAACAATTTCTCGAATTTGCAAAGAAAAGTGAGGTTTATGATTGGATGGTGGGAGTTAGGAGAAAAATACATGAGAATCCAGAGCTGATGTACCAAGAATTTGAGACCAGTAAAGTTATTAGAGAAGAATTGGATAAATTGGGGATTTCATACAAACACCCAATTGCAGTTACCGG...
431 aa · LXL04_032170|LXL04_032170|OH1004|PROTEIN
MKVSKWFFVITIIFLFNPQISYGVSELSQQFLEFAKKSEVYDWMVGVRRKIHENPELMYQEFETSKVIREELDKLGISYKHPIAVTGVVGFIGSGEPPFVALRADMDALSMQEMVEWKHKSKVPGKMHACGHDGHVTMLLGAAKILKTHSHLLKGTVVLIFQPAEEGGGGAKQVVDSGSLENVKAIFGLHVSPQQPIGQVFSKSGPILAGSGVFEAVITGKGGHAAIPHHSIDPILAASNVVVSLQHLVSREADPLDSQV...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_032170 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_032170 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:17807250-17809373 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ILL4: IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 4 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0009850 auxin metabolic process 生物过程 GO:0010112 regulation of systemic acquired resistance 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005788 endoplasmic reticulum lumen 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0010178 IAA-amino acid conjugate hydrolase activity 分子功能 GO:0010179 IAA-Ala conjugate hydrolase activity 分子功能 GO:0046872 metal ion binding 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G51760 ath:AT1G51780 ath:AT5G56660 dosa:Os01g0560000 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
内质网0.436
细胞质0.158
溶酶体／液泡0.111
过氧化物酶体0.106
线粒体0.092
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01546.34Peptidase_M20101-415 aaPF07687.20M20_dimer210-304 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_032170 | PF01546.34 | Peptidase_M20 | 101 | 415 | 4.9e-41 | 141.6 |
| LXL04_032170 | PF07687.20 | M20_dimer | 210 | 304 | 5.4e-11 | 43.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
O04373 | 拟南芥 | IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 4 | 65.957% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9SWX9 | 拟南芥 | IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 5 | 60.422% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
P54970 | 拟南芥 | IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 2 | 60.644% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q8S9S4 | 水稻 | IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 1 | 66.830% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q84XG9 | 水稻 | IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 1 | 66.585% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |