LXL04_029036 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_029036

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 78703022-78704296 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1032 bp · LXL04_029036|LXL04_029036|OH1004|cDNA

ATGATGAGTCGTGGAGCGACGACTGTAGTCCGATCCATGATGGGTCAAATGTTCTCAACGGCAGCCGGAAACGCATCCGTGACCGGGGTGATGAGAACCAACACTGGCCTCATTGGATCTGAAAAGGCGGTGGCGACATGGTGGATTAGATATTCTCCTATTGGTGCTCGCAATGCGAGTACCATGACATTGGGGGAGAAAGAACAGCAACAGGAGCATAAGGAAGAAGCAACAGGTAGCGGCGGCGCTGCCGCCGGTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1032 bp · LXL04_029036|LXL04_029036|OH1004|CDS

ATGATGAGTCGTGGAGCGACGACTGTAGTCCGATCCATGATGGGTCAAATGTTCTCAACGGCAGCCGGAAACGCATCCGTGACCGGGGTGATGAGAACCAACACTGGCCTCATTGGATCTGAAAAGGCGGTGGCGACATGGTGGATTAGATATTCTCCTATTGGTGCTCGCAATGCGAGTACCATGACATTGGGGGAGAAAGAACAGCAACAGGAGCATAAGGAAGAAGCAACAGGTAGCGGCGGCGCTGCCGCCGGTGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

343 aa · LXL04_029036|LXL04_029036|OH1004|PROTEIN

MMSRGATTVVRSMMGQMFSTAAGNASVTGVMRTNTGLIGSEKAVATWWIRYSPIGARNASTMTLGEKEQQQEHKEEATGSGGAAAGGQKGKEVVSYWGVQPPKVTKEDGSEWKWHCFRPWETYQADLSIDLKKHHTPTTFLDKLAYWTVKSLRFPTDVFFQRRYGCRAMMLETVAAVPGMVGGMLLHCKSLRRFEPSGGWIKALLEEAENERMHLMTFMEVSKPRWYERALVFTVQGVFFNAYFLAYLASPKLAHRIVGY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_029036`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_029036

位置 Chr06:78703022-78704296 (+)

描述 Similar to AOX1: Ubiquinol oxidase 1, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g22370`	催化泛醇的抗氰化物氧化和分子氧还原成水，但不转移质子，因此与氧化磷酸化无关。	The alternative oxidase of plant mitochondria is involved in the acclimation of shoot growth at low temperature. A study of Arabidopsis AOX1a transgenic plants.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.070789
`At3g22360`	催化泛醇的抗氰化物氧化和分子氧还原成水，但不转移质子，因此与氧化磷酸化无关。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029036 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0010230 alternative respiration 生物过程

GO:0022904 respiratory electron transport chain 生物过程

GO:0031930 mitochondria-nucleus signaling pathway 生物过程

GO:0045333 cellular respiration 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009916 alternative oxidase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

GO:0102721 ubiquinol:oxygen oxidoreductase activity 分子功能

GO:0106292 superoxide-generating NADPH oxidase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G22360

ath:AT3G22370

gmx:547924

nta:107781761

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.958

排名 1 · LXL04_029036 · OH-1004

细胞核0.046

排名 2 · LXL04_029036 · OH-1004

细胞质0.042

排名 3 · LXL04_029036 · OH-1004

细胞膜0.037

排名 4 · LXL04_029036 · OH-1004

内质网0.016

排名 5 · LXL04_029036 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01786.25AOX132-324 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_029036	`PF01786.25`	AOX	132	324	1.4e-82	277.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39219`	拟南芥	Ubiquinol oxidase 1a, mitochondrial	72.191%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`O23913`	拟南芥	Ubiquinol oxidase 1b, mitochondrial	75.080%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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