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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_028221
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 35116240-35119238 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2172 bp · LXL04_028221|LXL04_028221|OH1004|cDNA

ATGTTCGATTATGTATCAAAGTCCCAATATATTGGTGGCCACATGGACAAATTTGCAAGGTTGGACGATTTAGATTCAATCACAATGAACAAATACAATTTCGAGGGTGTAACTGCAAACCGTCCAAACCGCCCACCTCCAACCCCCTCAAAGTCCTTCAAAAACGGGATCAAAAAAGGATCCGAAAGCCTCAAATCCATAGGCCGATCACTAGGCCTTGGCGTCTCACGTGCAGTGTTCCCTGAAGATCTCAAAGCCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2172 bp · LXL04_028221|LXL04_028221|OH1004|CDS

ATGTTCGATTATGTATCAAAGTCCCAATATATTGGTGGCCACATGGACAAATTTGCAAGGTTGGACGATTTAGATTCAATCACAATGAACAAATACAATTTCGAGGGTGTAACTGCAAACCGTCCAAACCGCCCACCTCCAACCCCCTCAAAGTCCTTCAAAAACGGGATCAAAAAAGGATCCGAAAGCCTCAAATCCATAGGCCGATCACTAGGCCTTGGCGTCTCACGTGCAGTGTTCCCTGAAGATCTCAAAGCCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

723 aa · LXL04_028221|LXL04_028221|OH1004|PROTEIN

MFDYVSKSQYIGGHMDKFARLDDLDSITMNKYNFEGVTANRPNRPPPTPSKSFKNGIKKGSESLKSIGRSLGLGVSRAVFPEDLKASEKKILDPQDTFLLTWNKYFVASCILAVSIDPLFFYLPVFDQSKTCLGIDRHLAIIATTLRTVVDVFYLIHMALQFRTAYIAPSSRVFGRGELVIDPGQIAKRYLRWYFIIDFLSVVPLPQIVVWRYLHTSRGSDVLATKQALLIIILLQYVPRFARIVPLTSELKRTAGVFAE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_028221
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_028221
位置Chr06:35116240-35119238 (-)
描述Similar to CNGC9: Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g30560 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At5g57940 可能的环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At2g23980 可能的环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At1g19780 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At1g15990 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028221 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0035618 root hair 细胞组分
GO:0071944 cell periphery 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0005216 monoatomic ion channel activity 分子功能
GO:0005223 intracellularly cGMP-activated cation channel activity 分子功能
GO:0005249 voltage-gated potassium channel activity 分子功能
GO:0005262 calcium channel activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G15990
ath:AT1G19780
ath:AT2G23980
ath:AT4G30560
ath:AT5G57940
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.897
排名 1 · LXL04_028221 · OH-1004
细胞质0.094
排名 2 · LXL04_028221 · OH-1004
内质网0.051
排名 3 · LXL04_028221 · OH-1004
细胞核0.028
排名 4 · LXL04_028221 · OH-1004
高尔基体0.022
排名 5 · LXL04_028221 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00520.38Ion_trans105-424 aa
PF00027.36cNMP_binding519-608 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_028221PF00520.38Ion_trans1054241.4e-2384.1
LXL04_028221PF00027.36cNMP_binding5196084.3e-0936.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M0A4拟南芥Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 974.588%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8RWS9拟南芥Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 574.896%Swiss-Prot强数据库同源证据
O82226拟南芥Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 673.324%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FXH6拟南芥Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 868.491%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9S9N5拟南芥Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 768.151%Swiss-Prot强数据库同源证据

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