LXL04_025901 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_025901

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 118334407-118336388 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1011 bp · LXL04_025901|LXL04_025901|OH1004|cDNA

AAGCAGATCCTCCTCCTCTCTCCCCCTCTTTATTCAAACAATTTCGCATTTCCTCTTCCGTTTGTCTGCCCCCATTCTCTATATTCCTGTATCCAAATCCagttttctctctctagaatCCGTTGCTCTCTCATGGCAATCGCACCAGAAACGCAGGTTCAACAAACGGCTAATGAAGAGGCAGCAGCAGAAAAGAAGAGGTGGACGCTTAATGACTTCGACATCGGGAAGCCACTGGGAAGGGGAAAATTTGGCCATGT...

CDS

下载 CDS FASTA

879 bp · LXL04_025901|LXL04_025901|OH1004|CDS

ATGGCAATCGCACCAGAAACGCAGGTTCAACAAACGGCTAATGAAGAGGCAGCAGCAGAAAAGAAGAGGTGGACGCTTAATGACTTCGACATCGGGAAGCCACTGGGAAGGGGAAAATTTGGCCATGTTTACATTGCTAGGGAAAAGAGGAGCAACCACATCGTTGCACTAAAGGTGCTCTTCAAAAGCCAGCTCAAACAATCTCAGGTGGAACACCAACTTCGCCGTGAAGTTGAAATACAAAGCCACCTTAGACACCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

292 aa · LXL04_025901|LXL04_025901|OH1004|PROTEIN

MAIAPETQVQQTANEEAAAEKKRWTLNDFDIGKPLGRGKFGHVYIAREKRSNHIVALKVLFKSQLKQSQVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFYDQKRVYLILEYAAKGELYKELQRCKHFSERRAATYVASLARALIYCHGKHVIHRDIKPENLLIGAQGELKIADFGWSVHTFNRRQTMCGTLDYLPPEMVESTEHDSSVDIWSLGILCYEFLYGVPPFEAKEHTDTYRRIVKVDLKFPSKPVVSSAAKDLISQM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_025901`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_025901

位置 Chr05:118334407-118336388 (+)

描述 Similar to AUR1: Serine/threonine-protein kinase Aurora-1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g32830`	在体外特异性磷酸化组蛋白 H3 的“Ser-10”，并在有丝分裂过程中与磷酸化组蛋白 H3 共定位。	Characterization of plant Aurora kinases during mitosis.2005 · DOI: 10.1007/s11103-005-3454-x
`At2g25880`	在体外特异性磷酸化组蛋白H3的'Ser-10'位点。	Characterization of plant Aurora kinases during mitosis.2005 · DOI: 10.1007/s11103-005-3454-x
`At2g45490`	在体外磷酸化组蛋白 H3 的“Ser-10” 和“Ser-28”，但不在“Thr-3” 或“Thr-11” 处磷酸化。	Characterization of plant Aurora kinases during mitosis.2005 · DOI: 10.1007/s11103-005-3454-x Aurora kinase is required for chromosome segregation in tobacco BY-2 cells.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02893.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025901 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000212 meiotic spindle organization 生物过程

GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程

GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0007051 spindle organization 生物过程

GO:0007052 mitotic spindle organization 生物过程

GO:0007057 spindle assembly involved in female meiosis I 生物过程

GO:0007098 centrosome cycle 生物过程

GO:0007100 mitotic centrosome separation 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009948 anterior/posterior axis specification 生物过程

GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G25880

ath:AT2G45490

ath:AT4G32830

bta:504437

mmu:20878

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.576

排名 1 · LXL04_025901 · OH-1004

细胞质0.572

排名 2 · LXL04_025901 · OH-1004

细胞膜0.083

排名 3 · LXL04_025901 · OH-1004

线粒体0.053

排名 4 · LXL04_025901 · OH-1004

内质网0.041

排名 5 · LXL04_025901 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase30-280 aa

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr31-276 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_025901	`PF00069.32`	Pkinase	30	280	7.4e-76	255.7
LXL04_025901	`PF07714.24`	PK_Tyr_Ser-Thr	31	276	5.1e-43	148.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M077`	拟南芥	Serine/threonine-protein kinase Aurora-1	87.031%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q683C9`	拟南芥	Serine/threonine-protein kinase Aurora-2	87.943%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`O64629`	拟南芥	Serine/threonine-protein kinase Aurora-3	62.143%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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