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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_025719
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 115825940-115828230 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

849 bp · LXL04_025719|LXL04_025719|OH1004|cDNA

ATGGATAGTACTAGAAGTTCCATGTGGGAGCAAACGCAGGTATTATCTCCCGACCATGAGGTTAGGGAAGAAGTAGATCGTGATCATGAAAGTCAAAGTAGTAGCTATACACACGACTGGTCAACCTCTAACCTTCATCCTCATCATCAGATCGTAGGAGCAAATCATGTCGCCGATGATGTTTACGGCGGTTTCATGATCCCTAACTACCCAACTCCACCTCCTCCCTCAATGATAGTAACACCTCAACTACAAAATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

849 bp · LXL04_025719|LXL04_025719|OH1004|CDS

ATGGATAGTACTAGAAGTTCCATGTGGGAGCAAACGCAGGTATTATCTCCCGACCATGAGGTTAGGGAAGAAGTAGATCGTGATCATGAAAGTCAAAGTAGTAGCTATACACACGACTGGTCAACCTCTAACCTTCATCCTCATCATCAGATCGTAGGAGCAAATCATGTCGCCGATGATGTTTACGGCGGTTTCATGATCCCTAACTACCCAACTCCACCTCCTCCCTCAATGATAGTAACACCTCAACTACAAAATCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

282 aa · LXL04_025719|LXL04_025719|OH1004|PROTEIN

MDSTRSSMWEQTQVLSPDHEVREEVDRDHESQSSSYTHDWSTSNLHPHHQIVGANHVADDVYGGFMIPNYPTPPPPSMIVTPQLQNQQPIQQEVKRHYRGVRQRPWGKWAAEIRDPNKGARVWLGTFETAEGAALAYDQAALKFKGSKAKLNFPERFQGSSELRFISTTAQPPPPAISPPSQPHPLNHTIATSYPDFLQYAQLLSSNDAQLPSYFTSTLYHHNINATQPYSSNQSSPSSSASMVGSSTISYQQPNYGDNS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_025719
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_025719
位置Chr05:115825940-115828230 (-)
描述Similar to ERF113: Ethylene-responsive transcription factor ERF113
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g13330 转录激活因子，参与植物发育和非生物胁迫耐受性的调控。
Functional characterization of four APETALA2-family genes (RAP2.6, RAP2.6L, DREB19 and DREB26) in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1007/s11103-010-9711-7
RAP2.6L overexpression delays waterlogging induced premature senescence by increasing stomatal closure more than antioxidant enzyme activity.2012 · DOI: 10.1007/s11103-012-9936-8
At5g61890 细胞增殖和腋芽萌发的转录调控因子。
EBE, an AP2/ERF transcription factor highly expressed in proliferating cells, affects shoot architecture in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.214049
At2g33710 可能充当转录激活因子。 暂无已核实直接文献
At5g07310 作为植物硫肽PSK5激素的转录激活因子。 暂无已核实直接文献
At2g47520 特异性结合顺式作用元件GCC盒5′-AGCCGCC-3′，或CRT/DRE元件5′-[AG]CCGAC-3′的转录激活因子。
HRE1 and HRE2, two hypoxia-inducible ethylene response factors, affect anaerobic responses in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04149.x
The hypoxia responsive transcription factor genes ERF71/HRE2 and ERF73/HRE1 of Arabidopsis are differentially regulated by ethylene.2011 · DOI: 10.1111/j.1399-3054.2011.01486.x
AtERF71/HRE2 transcription factor mediates osmotic stress response as well as hypoxia response in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2011.09.039
Homeostatic response to hypoxia is regulated by the N-end rule pathway in plants.2011 · DOI: 10.1038/nature10534
Arabidopsis AtERF71/HRE2 functions as transcriptional activator via cis-acting GCC box or DRE/CRT element and is involved in root development through regulation of root cell expansion.2015 · DOI: 10.1007/s00299-014-1701-9
Hypoxia and the group VII ethylene response transcription factor HRE2 promote adventitious root elongation in Arabidopsis.2019 · DOI: 10.1111/plb.12873
The possible roles of AtERF71 in the defense response against the Fusarium graminearum .2018 · DOI: 10.5511/plantbiotechnology.18.0501b

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025719 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009625 response to insect 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G33710
ath:AT2G47520
ath:AT5G07310
ath:AT5G13330
ath:AT5G61890
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.969
排名 1 · LXL04_025719 · OH-1004
细胞质0.095
排名 2 · LXL04_025719 · OH-1004
细胞膜0.030
排名 3 · LXL04_025719 · OH-1004
内质网0.029
排名 4 · LXL04_025719 · OH-1004
质体0.016
排名 5 · LXL04_025719 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00847.27AP297-146 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_025719PF00847.27AP2971461.5e-1557.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LYU3拟南芥Ethylene-responsive transcription factor ERF11356.774%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FH54拟南芥Ethylene-responsive transcription factor ERF11465.421%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
P93007拟南芥Ethylene-responsive transcription factor ERF11279.688%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LY29拟南芥Ethylene-responsive transcription factor ERF11566.667%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
O22259拟南芥Ethylene-responsive transcription factor ERF07173.438%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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