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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_008013
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 80308207-80310843 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1317 bp · LXL04_008013|LXL04_008013|OH1004|cDNA

ATGGAGACGCTACAGCAGATTTTTTTGACGGTTATTGCAGGTTTTGTGTTCTTTATCCTGATTGCAAAGATCGCTTCTGCCGTGACCAATGGCGATGAAGATGATCATCAAAGTAGGAGAACCCGTGATTTCAGTAAGGTTTTGGCGGAGGAACTTAATTCGAAGATGGAGAAAAGTAGTCGTAAAATGAAAAGCATGAAGAAAGTCCGATTTGCTGTCGATCACGATGAAACTTTAGTAAATAAGGTCGTCGCCGGGCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1317 bp · LXL04_008013|LXL04_008013|OH1004|CDS

ATGGAGACGCTACAGCAGATTTTTTTGACGGTTATTGCAGGTTTTGTGTTCTTTATCCTGATTGCAAAGATCGCTTCTGCCGTGACCAATGGCGATGAAGATGATCATCAAAGTAGGAGAACCCGTGATTTCAGTAAGGTTTTGGCGGAGGAACTTAATTCGAAGATGGAGAAAAGTAGTCGTAAAATGAAAAGCATGAAGAAAGTCCGATTTGCTGTCGATCACGATGAAACTTTAGTAAATAAGGTCGTCGCCGGGCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

438 aa · LXL04_008013|LXL04_008013|OH1004|PROTEIN

METLQQIFLTVIAGFVFFILIAKIASAVTNGDEDDHQSRRTRDFSKVLAEELNSKMEKSSRKMKSMKKVRFAVDHDETLVNKVVAGPSETKQVVFVENNHEEEIISLNDVGSVVKSAEEEFVGVENSASGDNKSRAESVSPSVVDYDQTKQGNTETVDQKSSEGTMNPYENAAIGINDQMSSKLLSDDGSVKNGGEEMISLNDVRSVVKSPEEESVGVEHSDSDDNKSNAESVTPGVVDYDQTKEGNTELLEQKSNQCPV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_008013
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_008013
位置Chr02:80308207-80310843 (+)
描述Similar to ACBP3: Acyl-CoA-binding domain-containing protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g24230 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
Arabidopsis ACBP3 is an extracellularly targeted acyl-CoA-binding protein.2006 · DOI: 10.1007/s00425-005-0139-2
At4g27780 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
Single amino acid substitutions at the acyl-CoA-binding domain interrupt 14[C]palmitoyl-CoA binding of ACBP2, an Arabidopsis acyl-CoA-binding protein with ankyrin repeats.2000 · DOI: 10.1023/a:1026524108095
ACBP4 and ACBP5, novel Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins with kelch motifs that bind oleoyl-CoA.2004 · DOI: 10.1007/s11103-004-0642-z
Overexpression of membrane-associated acyl-CoA-binding protein ACBP1 enhances lead tolerance in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03402.x
At5g53470 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
Arabidopsis ACBP3 is an extracellularly targeted acyl-CoA-binding protein.2006 · DOI: 10.1007/s00425-005-0139-2
Overexpression of membrane-associated acyl-CoA-binding protein ACBP1 enhances lead tolerance in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03402.x
Acyl-CoA-Binding Protein ACBP1 Modulates Sterol Synthesis during Embryogenesis.2017 · DOI: 10.1104/pp.17.00412
Arabidopsis ACYL-COA-BINDING PROTEIN1 interacts with STEROL C4-METHYL OXIDASE1-2 to modulate gene expression of homeodomain-leucine zipper IV transcription factors.2018 · DOI: 10.1111/nph.14965

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0243600 以高亲和力结合中链和长链酰基辅酶 A 酯。
The rice acyl-CoA-binding protein gene family: phylogeny, expression and functional analysis.2011 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03546.x
Subcellular localization of rice acyl-CoA-binding proteins (ACBPs) indicates that OsACBP6::GFP is targeted to the peroxisomes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12809
Os04g0681900 以高亲和力结合中链和长链酰基辅酶 A 酯。
The rice acyl-CoA-binding protein gene family: phylogeny, expression and functional analysis.2011 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03546.x
Subcellular localization of rice acyl-CoA-binding proteins (ACBPs) indicates that OsACBP6::GFP is targeted to the peroxisomes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12809
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008013 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程
GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程
GO:0006869 lipid transport 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009646 response to absence of light 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
GO:0010162 seed dormancy process 生物过程
GO:0010288 response to lead ion 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G24230
ath:AT4G27780
ath:AT5G53470
dosa:Os03g0243600
dosa:Os04g0681900
osa:4332223
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.401
排名 1 · LXL04_008013 · OH-1004
细胞膜0.281
排名 2 · LXL04_008013 · OH-1004
细胞核0.280
排名 3 · LXL04_008013 · OH-1004
内质网0.132
排名 4 · LXL04_008013 · OH-1004
高尔基体0.100
排名 5 · LXL04_008013 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00887.25ACBP313-386 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_008013PF00887.25ACBP3133862.1e-2279.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9STX1拟南芥Acyl-CoA-binding domain-containing protein 349.587%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9STP8拟南芥Acyl-CoA-binding domain-containing protein 247.500%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SM23拟南芥Acyl-CoA-binding domain-containing protein 157.143%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q10P83水稻Acyl-CoA-binding domain-containing protein 551.515%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
A3AYR1水稻Acyl-CoA-binding domain-containing protein 448.980%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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