LXL04_005873 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_005873

当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 174860689-174864187 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1497 bp · LXL04_005873|LXL04_005873|OH1004|cDNA

ATGGAGATGGAATCAATGGCGTCGGCGATCGGAGTATCAGTACCGGTACTCCGATTCCTTCTCTGCTTCGTTGCAACTATTCCCGTCAGCTTCTTCCACCGCCTTGTCCCCGGCGGCCCGACCGCCAGACACCTTTACGCCGCCTTGACGGGTGCCCTGCTCTCCTACATCTCCTTTGGATTCTCTTCGAATCTGCACTTCCTCGTGCCTATGCTGATCAGTTACGCGTCAATGATCATCTATAGGAAACGATGCGGCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1404 bp · LXL04_005873|LXL04_005873|OH1004|CDS

ATGGAGATGGAATCAATGGCGTCGGCGATCGGAGTATCAGTACCGGTACTCCGATTCCTTCTCTGCTTCGTTGCAACTATTCCCGTCAGCTTCTTCCACCGCCTTGTCCCCGGCGGCCCGACCGCCAGACACCTTTACGCCGCCTTGACGGGTGCCCTGCTCTCCTACATCTCCTTTGGATTCTCTTCGAATCTGCACTTCCTCGTGCCTATGCTGATCAGTTACGCGTCAATGATCATCTATAGGAAACGATGCGGCGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

467 aa · LXL04_005873|LXL04_005873|OH1004|PROTEIN

MEMESMASAIGVSVPVLRFLLCFVATIPVSFFHRLVPGGPTARHLYAALTGALLSYISFGFSSNLHFLVPMLISYASMIIYRKRCGVISFLSAMGYLIGCHVYYMSGDAWKEGGIDATGSLMVITLKVISCAINYNDGLLKEEDLRESQKKNRLLKLPNLIEYIGYCLCCGSHFAGPVYEVKDYLDWTERKGIWAKSEKGTPSPFMATLKALLQAGFCMGLYLYLVPSHPLSRFNEPIYQEWGFVQRLSYQYMSGFTARW...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_005873`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_005873

位置 Chr01:174860689-174864187 (-)

描述 Similar to LPCAT1: Lysophospholipid acyltransferase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g12640`	具有广泛特异性的溶磷脂酰基转移酶。	A family of eukaryotic lysophospholipid acyltransferases with broad specificity.2008 · DOI: 10.1016/j.febslet.2007.12.020 Acyl editing and headgroup exchange are the major mechanisms that direct polyunsaturated fatty acid flux into triacylglycerols.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.204438 Metabolic interactions between the Lands cycle and the Kennedy pathway of glycerolipid synthesis in Arabidopsis developing seeds.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.104604 Plant acyl-CoA:lysophosphatidylcholine acyltransferases (LPCATs) have different specificities in their forward and reverse reactions.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m113.521815 Metabolically Distinct Pools of Phosphatidylcholine Are Involved in Trafficking of Fatty Acids out of and into the Chloroplast for Membrane Production.2019 · DOI: 10.1105/tpc.19.00121
`At1g63050`	溶血磷脂酰基转移酶具有广泛的特异性。	A family of eukaryotic lysophospholipid acyltransferases with broad specificity.2008 · DOI: 10.1016/j.febslet.2007.12.020 Acyl editing and headgroup exchange are the major mechanisms that direct polyunsaturated fatty acid flux into triacylglycerols.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.204438 Metabolic interactions between the Lands cycle and the Kennedy pathway of glycerolipid synthesis in Arabidopsis developing seeds.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.104604 Plant acyl-CoA:lysophosphatidylcholine acyltransferases (LPCATs) have different specificities in their forward and reverse reactions.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m113.521815 Metabolically Distinct Pools of Phosphatidylcholine Are Involved in Trafficking of Fatty Acids out of and into the Chloroplast for Membrane Production.2019 · DOI: 10.1105/tpc.19.00121

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005873 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006641 triglyceride metabolic process 生物过程

GO:0006646 phosphatidylethanolamine biosynthetic process 生物过程

GO:0006656 phosphatidylcholine biosynthetic process 生物过程

GO:0008654 phospholipid biosynthetic process 生物过程

GO:0019375 galactolipid biosynthetic process 生物过程

GO:0019432 triglyceride biosynthetic process 生物过程

GO:0030258 lipid modification 生物过程

GO:0036150 phosphatidylserine acyl-chain remodeling 生物过程

GO:0036151 phosphatidylcholine acyl-chain remodeling 生物过程

GO:0036152 phosphatidylethanolamine acyl-chain remodeling 生物过程

GO:0045017 glycerolipid biosynthetic process 生物过程

GO:0046474 glycerophospholipid biosynthetic process 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G12640

ath:AT1G63050

gga:421925

mmu:67216

spo:2539940

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.872

排名 1 · LXL04_005873 · OH-1004

细胞质0.062

排名 2 · LXL04_005873 · OH-1004

线粒体0.059

排名 3 · LXL04_005873 · OH-1004

细胞核0.058

排名 4 · LXL04_005873 · OH-1004

细胞膜0.049

排名 5 · LXL04_005873 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03062.25MBOAT103-415 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_005873	`PF03062.25`	MBOAT	103	415	1.3e-65	222.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4IDU4`	拟南芥	Lysophospholipid acyltransferase 1	74.353%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9CAN8`	拟南芥	Lysophospholipid acyltransferase 2	71.983%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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