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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_005751
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 172690280-172695342 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1164 bp · LXL04_005751|LXL04_005751|OH1004|cDNA

ATGGCGCCGCCGTTGTGTATATTGGTGACTGGTGGTGCCGGATATATAGGGAGTCACACGGTGTTGCAGCTGTTGTTTGACGGGTATAAGGCGGTGGTGGTTGATAATCTTGATAATTCATCTGAAGTCGCTATTAGTCGAGTTCAAGAACTCGCCGGTGATCGTGCCCATAATTTATCTTTTCACAAGTTGTTGTTGGATGGTTataaggtggtggtggttgaaaAACTTGATAATTCCTCTGAACTTGCTATCAGTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1164 bp · LXL04_005751|LXL04_005751|OH1004|CDS

ATGGCGCCGCCGTTGTGTATATTGGTGACTGGTGGTGCCGGATATATAGGGAGTCACACGGTGTTGCAGCTGTTGTTTGACGGGTATAAGGCGGTGGTGGTTGATAATCTTGATAATTCATCTGAAGTCGCTATTAGTCGAGTTCAAGAACTCGCCGGTGATCGTGCCCATAATTTATCTTTTCACAAGTTGTTGTTGGATGGTTATAAGGTGGTGGTGGTTGAAAAACTTGATAATTCCTCTGAACTTGCTATCAGTCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

387 aa · LXL04_005751|LXL04_005751|OH1004|PROTEIN

MAPPLCILVTGGAGYIGSHTVLQLLFDGYKAVVVDNLDNSSEVAISRVQELAGDRAHNLSFHKLLLDGYKVVVVEKLDNSSELAISRVQELVGDRAHNLSFHKMDIRDKPALEQLFASTKFDVVIHLAGLKAVGESVKKPLMYYNNNIIGTITLLEVMASYGCKKLVFSSSATVYGVPKEVPCTEEFPLSAVNPYGRTKLMIEEICRDIYTSDPEWKIILLRYFNPIGAHSSGKMGEDPHGTPNNLMPFVQQVAVGRRPK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_005751
TK1151 IDTkA01G019160
OH-1004 IDLXL04_005751
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)89.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_005751
位置Chr01:172690280-172695342 (-)
描述Similar to UDP-glucose 4-epimerase GEPI48
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g10960 催化 UDP-葡萄糖和 UDP-半乳糖之间的相互转化。
Distinct properties of the five UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase isoforms of Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m512727200
Bifunctional cytosolic UDP-glucose 4-epimerases catalyse the interconversion between UDP-D-xylose and UDP-L-arabinose in plants.2009 · DOI: 10.1042/bj20091025
At1g64440 催化 UDP-葡萄糖和 UDP-半乳糖之间的相互转化。
Galactose biosynthesis in Arabidopsis: genetic evidence for substrate channeling from UDP-D-galactose into cell wall polymers.2002 · DOI: 10.1016/s0960-9822(02)01260-5
Growth regulators and the control of nucleotide sugar flux.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019661
The reb1-1 mutation of Arabidopsis. Effect on the structure and localization of galactose-containing cell wall polysaccharides.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.074997
Distinct properties of the five UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase isoforms of Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m512727200
UDP-glucose 4-epimerase isoforms UGE2 and UGE4 cooperate in providing UDP-galactose for cell wall biosynthesis and growth of Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.049619
Bifunctional cytosolic UDP-glucose 4-epimerases catalyse the interconversion between UDP-D-xylose and UDP-L-arabinose in plants.2009 · DOI: 10.1042/bj20091025
At4g23920 催化 UDP-葡萄糖和 UDP-半乳糖之间的相互转化。
Distinct properties of the five UDP-D-glucose/UDP-D-galactose 4-epimerase isoforms of Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m512727200
UDP-glucose 4-epimerase isoforms UGE2 and UGE4 cooperate in providing UDP-galactose for cell wall biosynthesis and growth of Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.049619
Bifunctional cytosolic UDP-glucose 4-epimerases catalyse the interconversion between UDP-D-xylose and UDP-L-arabinose in plants.2009 · DOI: 10.1042/bj20091025

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0595100 催化 UDP-葡萄糖和 UDP-半乳糖之间的相互转化。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005751 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005996 monosaccharide metabolic process 生物过程
GO:0006012 galactose metabolic process 生物过程
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009969 xyloglucan biosynthetic process 生物过程
GO:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程
GO:0042546 cell wall biogenesis 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005795 Golgi stack 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0003978 UDP-glucose 4-epimerase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G64440
ath:AT4G10960
ath:AT4G23920
dosa:Os05g0595100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.688
排名 1 · LXL04_005751 · OH-1004
细胞核0.249
排名 2 · LXL04_005751 · OH-1004
线粒体0.106
排名 3 · LXL04_005751 · OH-1004
过氧化物酶体0.092
排名 4 · LXL04_005751 · OH-1004
细胞膜0.066
排名 5 · LXL04_005751 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01370.28Epimerase7-47 aa
PF16363.12GDP_Man_Dehyd8-63 aa
PF07993.19NAD_binding_49-208 aa
PF16363.12GDP_Man_Dehyd62-371 aa
PF01370.28Epimerase62-309 aa
PF02719.22Polysacc_synt_281-229 aa
PF04321.24RmlD_sub_bind96-208 aa
PF01073.263Beta_HSD98-205 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_005751PF01370.28Epimerase7474.3e-58197.3
LXL04_005751PF16363.12GDP_Man_Dehyd8631.6e-70238.9
LXL04_005751PF07993.19NAD_binding_492082.2e-0627.7
LXL04_005751PF16363.12GDP_Man_Dehyd623711.6e-70238.9
LXL04_005751PF01370.28Epimerase623094.3e-58197.3
LXL04_005751PF02719.22Polysacc_synt_2812299.1e-1555.3
LXL04_005751PF04321.24RmlD_sub_bind962082.4e-1144.0
LXL04_005751PF01073.263Beta_HSD982051.9e-1454.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SN58拟南芥UDP-glucose 4-epimerase 569.211%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9C7W7拟南芥UDP-glucose 4-epimerase 468.435%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9T0A7拟南芥UDP-glucose 4-epimerase 269.251%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8LNZ3水稻UDP-glucose 4-epimerase 170.185%Swiss-Prot强数据库同源证据

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