基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_000649
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 11942014-11946315
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1968 bp · LXL04_000649|LXL04_000649|OH1004|cDNA
ATGGAGAGGTTCTGGAATTACAACCGGTTTAAGCTGCGGTTAGCAGTCCTGCTTACTGCTTTATTAGTAATCGATTACAATTTTAGTCTCTGTTGGTCTCTCAACACCGAAGGGATGGCGTTGTTGAAGTTTCGGGATGGAATTGAGAGGGACCCTTTAGGCGTTTTGTCTGGATGGAATAACGACGATGAAGTGGCGGATTTGGGTCATTGTTCTTGGTTCGGCGTTGAGTGTTCCGATGGAAAAGTGGTCATCTTGAA...
CDS
下载 CDS FASTA1968 bp · LXL04_000649|LXL04_000649|OH1004|CDS
ATGGAGAGGTTCTGGAATTACAACCGGTTTAAGCTGCGGTTAGCAGTCCTGCTTACTGCTTTATTAGTAATCGATTACAATTTTAGTCTCTGTTGGTCTCTCAACACCGAAGGGATGGCGTTGTTGAAGTTTCGGGATGGAATTGAGAGGGACCCTTTAGGCGTTTTGTCTGGATGGAATAACGACGATGAAGTGGCGGATTTGGGTCATTGTTCTTGGTTCGGCGTTGAGTGTTCCGATGGAAAAGTGGTCATCTTGAA...
655 aa · LXL04_000649|LXL04_000649|OH1004|PROTEIN
MERFWNYNRFKLRLAVLLTALLVIDYNFSLCWSLNTEGMALLKFRDGIERDPLGVLSGWNNDDEVADLGHCSWFGVECSDGKVVILNLKDLCLEGTLAPELGKLTNVKSIILRNNSFNGTIPQEIGDLKQLEVLDLGYNNFTGPFPSDLVNNLSLSILLLDNNNFLDNLSLEVNHLKTLSEFQVDEEQLTNSHDHDFTCNKKSSSWNVITERKLLQIPPSSSLSPSRHPVSSISFPPFATSPSMSPVPSPSPSTSPVPAP...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_000649 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_000649 |
|---|---|
| 位置 | Chr01:11942014-11946315 (-) |
| 描述 | Similar to MDIS2: Protein MALE DISCOVERER 2 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程 GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程 GO:0048765 root hair cell differentiation 生物过程 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0012505 endomembrane system 细胞组分 GO:0090406 pollen tube 细胞组分 GO:0004672 protein kinase activity 分子功能 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G63430 ath:AT2G40270 ath:AT3G56050 ath:AT4G18640 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.789
内质网0.084
细胞质0.076
细胞核0.058
质体0.040
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF08263.18LRRNT_234-79 aaPF23598.2LRR_1486-188 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr382-621 aaPF00069.32Pkinase383-618 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_000649 | PF08263.18 | LRRNT_2 | 34 | 79 | 1.9e-09 | 38.4 |
| LXL04_000649 | PF23598.2 | LRR_14 | 86 | 188 | 5.7e-06 | 26.0 |
| LXL04_000649 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 382 | 621 | 2.1e-26 | 93.5 |
| LXL04_000649 | PF00069.32 | Pkinase | 383 | 618 | 5.2e-21 | 75.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
C0LGQ4 | 拟南芥 | Protein MALE DISCOVERER 2 | 41.716% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
C0LGU7 | 拟南芥 | Protein MALE DISCOVERER 1 | 41.916% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9SIZ4 | 拟南芥 | Inactive receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g40270 | 49.423% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9LYN6 | 拟南芥 | Probable inactive receptor-like protein kinase At3g56050 | 54.701% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
C0LGH8 | 拟南芥 | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g63430 | 31.330% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |